| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,945,306 | C→G | 100% | G172A (GGC→GCC) | recD ← | exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,945,306 | 0 | C | G | 99.6% | 1127.1 / ‑3.8 | 281 | G172A (GGC→GCC) | recD | exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (112/168); total (113/168) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
CGCAAAGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGCCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTTCATCAACCTCAATGGCATGATTCACTTCGTTG > CP009273/2945159‑2945452 | cAAAGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACTCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGggcgcc > 2:5307328/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGgcgccg > 2:3428136/1‑150 (MQ=255) aaaGCCTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGgcgccg > 2:539307/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGaaa > 1:3583859/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGaaa < 1:2509628/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAAt > 2:10066/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAAt > 1:1153350/1‑150 (MQ=255) ttGCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATc < 2:4670146/150‑1 (MQ=255) gCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCAc < 1:1868958/150‑1 (MQ=255) gCCGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCAc > 2:4931216/1‑150 (MQ=255) ccGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCAcc < 2:1631307/150‑1 (MQ=255) ccGAGAGATTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCAcc < 1:2941921/150‑1 (MQ=255) gagagaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCga < 2:2158008/150‑1 (MQ=255) gagagaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCga < 1:3223103/150‑1 (MQ=255) agagaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCgag > 1:2659501/1‑150 (MQ=255) gagaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCgaga > 2:523721/1‑150 (MQ=255) agaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGAt < 2:401224/150‑1 (MQ=255) gagtCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATc < 2:3353168/147‑1 (MQ=255) gaTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATc > 2:1794577/1‑150 (MQ=255) aTTCGGTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATcc < 2:295485/150‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATccgccg < 2:2732361/150‑1 (MQ=255) ttAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCcgcg > 2:712559/1‑150 (MQ=255) ttAAGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCcgcg < 2:2096688/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGCGGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTc < 2:1220177/150‑1 (MQ=255) cgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCa > 2:803072/1‑150 (MQ=255) cgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCa < 2:681053/150‑1 (MQ=255) cgGCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCa < 2:51146/150‑1 (MQ=255) gCAGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACt < 2:2423317/150‑1 (MQ=255) aGCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgc < 1:3339594/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgcc < 1:4614344/150‑1 (MQ=255) ttACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgccgcc > 1:1192971/1‑150 (MQ=255) ttACCCGTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGATACGGTGTTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCTGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTgccgcc < 1:2584097/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACt < 1:4055195/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACt > 2:718859/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACt < 1:3326637/150‑1 (MQ=255) tGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACttt < 2:1538307/150‑1 (MQ=255) tGGTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACttt < 1:1951039/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCCAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACttttt > 2:2034606/1‑150 (MQ=255) ccAGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGt < 2:4415264/150‑1 (MQ=255) aGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACTGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTa > 2:2812231/1‑150 (MQ=255) aGACGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTa > 1:5110633/1‑150 (MQ=255) cGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAAtt < 2:388198/150‑1 (MQ=255) cGGATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTGTTTGCCAGTTAAtt > 2:4565968/1‑150 (MQ=255) gATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGTTGCCAGGGGCGCCGTAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTc < 1:1414000/150‑1 (MQ=255) gATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTc > 2:4707653/1‑150 (MQ=255) gATACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCCAGATCCGCCGCGTCAGCCCCACAGCCGCCGCCACAGTTTGCCAGTTAATTTc > 1:4929559/1‑150 (MQ=255) aTACGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCa < 1:4306691/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATc < 2:5039101/150‑1 (MQ=255) 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gCGTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTAc < 1:3670622/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGTGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACAGCCGCCGCACCTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACtc > 2:3398952/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTg > 1:2054260/1‑150 (MQ=255) tCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGa < 1:1780847/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGa < 1:2293272/150‑1 (MQ=255) 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cGTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGaaaaa > 2:3138461/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACAGCCGCCGCAACATTTTGCCCGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAg > 1:2290543/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATTTAAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCAATGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGt < 2:3417321/150‑1 (MQ=255) cGGCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGtt > 1:2465353/1‑150 (MQ=255) ggCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGttt > 1:3946026/1‑150 (MQ=255) ggCCATTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACAGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGttt > 1:3886443/1‑150 (MQ=255) aTTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTcc > 2:4080551/1‑150 (MQ=255) aTTTGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTcc > 1:4459623/1‑150 (MQ=255) tttGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCa < 1:2380751/150‑1 (MQ=255) tGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAgg > 2:13947/1‑150 (MQ=255) tGAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAgg > 2:3561149/1‑150 (MQ=255) gAATTAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAggg < 2:94702/150‑1 (MQ=255) gAATTAACGCTGCCAGCAACTTAGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAggg < 1:956735/150‑1 (MQ=255) ttAACGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGttt < 1:1037180/150‑1 (MQ=255) aaCGCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTgc > 2:4029867/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGcc > 1:4394589/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCa < 2:1205497/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAACTTCGCTACGGTGGTCGTTGTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGt < 2:4378655/150‑1 (MQ=255) aaCTTCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCAGCTACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTTGAGCt < 1:357958/150‑1 (MQ=255) ttCGCTACGGTGGTCGTTTTACCGGTGCCAGGGGCGCCGGAAATCACCGAGATCCGCCGCGTCAGCGCCACTGCCGCCGCAACTTTTTGCCAGTTAATTTCATCGCTTACTGGAAAAAGTTTGTCCAGGGTTTGCGCCAGTAGAGCTtca < 1:616486/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |