Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 248,529 | C→T | 30.9% | T13I (ACT→ATT) | yafN → | antitoxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 248,529 | 0 | C | T | 30.9% | 594.1 / inf | 375 | T13I (ACT→ATT) | yafN | antitoxin of the YafO‑YafN toxin‑antitoxin system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (148/111); new base T (57/59); total (205/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.78e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
GGGGCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATACTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATCACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGTTACGTAAAAACCCAGCTAAATACTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGAACAAGAGGAGAAAAAGCCCATAA > CP009273/248380‑248678 | ggCTGCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTg < 2:5184253/150‑1 (MQ=255) gCATGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCACTGAGtt < 1:180932/150‑1 (MQ=255) aTGTGACGTTGCTTGACCCGCAAATGGAAAGACAACTGGTGCTGGGATTATGATGTATATTATTATGTATATTCTGGTGTGCATTATTATGAGGGTATAACTGTATGCATCGAATTCTCGCTGAAAAATCGGTCAATATCATTGAGTTAc < 1:4614231/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |