| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,068,690 | C→A | 23.1% | V284V (GTG→GTT) | yggF ← | fructose 1,6 bisphosphatase isozyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,068,690 | 0 | C | A | 23.1% | 770.6 / 162.0 | 313 | V284V (GTG→GTT) | yggF | fructose 1,6 bisphosphatase isozyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (108/132); new base A (34/39); total (142/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
GTCAGCGTCGCCATTGGTCTTCCGATAGATCACCATCAATGCAGGGAGTCTATTATATTACACGTTTGGTCCGCGCCGCCGATCAGTAATGTCTGCGTCCGCACCCCATTCGCCGTCTGTTGGATACCGTTCACCAGCTCACCGCCCGTCACGCCCGTAGCGCTAAAGAGGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCA > CP009273/3068541‑3068839 | gTCAGCGTCGCCATTGGTCTTCCGATAGATCACCATCAATGCAGGGAGTCTATTATATTACACGTTTGGTCCGCGCCGCCGATCAGTAATGTCTGCGTCCGCACCCCATTCGCCGTCTGTTGGATACCGTTCACCAGCTCACCGCCCGTc < 1:1749164/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGCCATTGGTCTTCCGATAGATCACCATCAATGCAGGGAGTCTATTATATTACACGTTTGGTCCGCGCCGCCGATCAGTAATGTCTGCGTCCGCACCCCATTCGCCGTCTGTTGGATACCGTTCACCAGCTCACCGCCCGTCa < 2:2620391/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATTGGTCTTCCGATAGATCACCATCAATGCAGGGAGTCTATTATATTACACGTTTGGTCCGCGCCGCCGATCAGTAATGTCTGCGTCCGCACCCCATTCGCCGTCTGTTGGATACCGTTCACCAGCTCACCGCCCGTCAc > 1:3492162/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |