| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,081,604 | 0 | C | T | 5.1% | 1255.5 / 32.0 | 351 | intergenic (+385/‑39) | metK/galP | S‑adenosylmethionine synthetase/D‑galactose transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (159/173); new base T (8/10); total (168/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.13e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 358 total aligned reads displayed.
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tATCATAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAAtt < 2:4812348/150‑1 (MQ=255) cTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAATTGCt < 2:1298569/150‑1 (MQ=255) | AAAGTCTTAATTGCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAATTGCT > CP009273/3081455‑3081753 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |