Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,302,027 | G→T | 100% | S86* (TCG→TAG) | nlpI ← | lipoprotein involved in osmotic sensitivity and filamentation |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,302,027 | 0 | G | T | 99.7% | 1137.4 / ‑4.6 | 348 | S86* (TCG→TAG) | nlpI | lipoprotein involved in osmotic sensitivity and filamentation |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (189/158); total (189/159) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
CAAGTGCGCGTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTCCTGCTGTAAA > CP009273/3301882‑3302173 | aaGTGCGCGTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTaaaaa > 1:3317071/1‑150 (MQ=255) gTGCGCGTATTTTTAATTTGGATCAATCTAAACTAAAGTAAACAACGCGTAATAGGCATCATCAAAATTGCCCGCCATCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATc < 2:5299267/150‑1 (MQ=255) tGCGCGTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCg < 1:1637960/150‑1 (MQ=255) gcgTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTa < 1:38639/150‑1 (MQ=255) gcgTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTa < 2:2625256/150‑1 (MQ=255) cgTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTAc > 1:3713415/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTAcg < 1:2060965/150‑1 (MQ=255) tAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTCcgc > 2:2786799/1‑150 (MQ=255) aGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTAcgcg > 2:1521268/1‑150 (MQ=255) aGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTAcgcg < 1:3563646/150‑1 (MQ=255) aGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTAcgcg > 1:3219307/1‑150 (MQ=255) aGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTAcgcg > 1:848133/1‑150 (MQ=255) tGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTa < 2:2989227/150‑1 (MQ=255) tGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTa > 2:5000377/1‑150 (MQ=255) ggATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTc < 2:5225701/150‑1 (MQ=255) aTCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAg > 1:3038822/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGAATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAg > 1:5226914/1‑150 (MQ=255) aaGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGAcc > 2:4719400/1‑150 (MQ=255) 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aGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTa > 1:637233/1‑150 (MQ=255) gTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTAt < 1:455309/150‑1 (MQ=255) tACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATc > 2:246685/1‑150 (MQ=255) tACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATc < 2:2102290/150‑1 (MQ=255) aCAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCa < 1:1103158/150‑1 (MQ=255) aCAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCa > 2:2309177/1‑150 (MQ=255) aGAATCAAACGNTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATa > 1:2766825/1‑150 (MQ=255) aGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATa < 2:4977862/150‑1 (MQ=255) aaTCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATaca > 1:3720935/1‑150 (MQ=255) aTCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATacaa > 2:869828/1‑150 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACTGAGACTATCATacaac > 1:2725064/1‑150 (MQ=255) cAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATacaaca > 2:5142230/1‑150 (MQ=255) aaCGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACt < 2:2762662/150‑1 (MQ=255) aaCGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACt < 2:232401/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTc > 1:3664540/1‑150 (MQ=255) cATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCt < 1:645682/150‑1 (MQ=255) caTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATaaaa < 2:2211750/150‑1 (MQ=255) caTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATaaaa < 1:63081/150‑1 (MQ=255) aTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAg > 2:4029130/1‑150 (MQ=255) aTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAg > 2:3083702/1‑150 (MQ=255) aTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAg > 2:4804971/1‑150 (MQ=255) cAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCt < 2:1161007/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCtg > 1:1390146/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCtg > 1:564658/1‑150 (MQ=255) aaaaGTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACTCTCCGCGCTAATATAAAAGCtg < 2:4850392/150‑1 (MQ=255) tgcctgccTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc < 1:1819918/150‑1 (MQ=255) gcctgcctGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGcgcg < 1:3909614/150‑1 (MQ=255) cctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGt > 2:3292116/1‑150 (MQ=255) cctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGt > 1:1765432/1‑150 (MQ=255) ctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTc > 1:149684/1‑150 (MQ=255) cGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATc > 2:1018883/1‑150 (MQ=255) cGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATc < 2:2508595/150‑1 (MQ=255) gTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCg > 2:3403156/1‑150 (MQ=255) gTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCg < 1:3089961/150‑1 (MQ=255) ttAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCgg < 2:142056/150‑1 (MQ=255) 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gCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCg < 2:4237802/150‑1 (MQ=255) ccTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGa > 1:5176464/1‑150 (MQ=255) ccTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGa > 1:4789555/1‑150 (MQ=255) ccTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGa < 2:4537035/150‑1 (MQ=255) tAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCa < 2:4423424/150‑1 (MQ=255) 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aCTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGt < 2:2580454/150‑1 (MQ=255) tCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTcc > 1:102462/1‑150 (MQ=255) tCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTcc < 1:240608/150‑1 (MQ=255) cAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCa < 1:3135036/150‑1 (MQ=255) ggCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATa < 1:2566155/150‑1 (MQ=255) atatCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGt > 1:1898699/1‑150 (MQ=255) atatCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGt > 1:4926442/1‑150 (MQ=255) tatCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTg > 1:220313/1‑150 (MQ=255) ggTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGa < 2:5300729/150‑1 (MQ=255) ggTCGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGa > 2:2026203/1‑150 (MQ=255) cGGATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATc > 2:3757268/1‑150 (MQ=255) ggATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCa < 1:1145101/150‑1 (MQ=255) ggATTGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCa > 2:1587066/1‑150 (MQ=255) agtGCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACt < 2:3483253/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGCTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTcc < 2:1934101/150‑1 (MQ=255) 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cgcTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTCctgctg < 1:462567/150‑1 (MQ=255) cTTGCTAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTCCTGCTGTa > 2:2387630/1‑150 (MQ=255) | CAAGTGCGCGTAGTTGTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGCGTTCGTCATCGGTTAAAGCCCGACTGGCAAGGATTTGTTCCATACGTGCCAGAATCACTTCCTGCTGTAAA > CP009273/3301882‑3302173 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |