| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,350,663 | C→A | 23.3% | T860T (ACC→ACA) | gltB → | glutamate synthase, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,350,663 | 0 | C | A | 23.3% | 734.4 / 161.6 | 307 | T860T (ACC→ACA) | gltB | glutamate synthase, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (117/118); new base A (41/31); total (158/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
GAGTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAGCAGGT > CP009273/3350514‑3350812 | gAGTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAcc < 1:2981031/150‑1 (MQ=255)gAGTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAcc < 1:3653766/150‑1 (MQ=255)gAGTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAcc > 2:604519/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAccgc > 1:1112691/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAccgc > 1:1491514/1‑150 (MQ=255) tACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAccgcc < 1:307133/150‑1 (MQ=255) aCAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATAccgccg < 2:3814264/150‑1 (MQ=255) cGACTATCAGGAATCCGCGAAGCTGGTTACTGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGAt < 1:2684866/150‑1 (MQ=255) gACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATg < 2:4480376/150‑1 (MQ=255) gACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATg > 1:2235091/1‑150 (MQ=255) cTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTc > 1:539825/1‑150 (MQ=255) cTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTACTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTc < 2:4729652/150‑1 (MQ=255) aTCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTa < 1:383544/150‑1 (MQ=255) tCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCTTCCGGCAACCACGCTGCGAGATCTGCTTGAAATTACGACGGTTGAAAACGAGTTCAACATTTCTGATGTTTAACCGGCAATCTAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCTATGTCTAt < 2:5006938/150‑1 (MQ=255) cAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATc < 2:406200/150‑1 (MQ=255) cAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATc < 2:1258454/150‑1 (MQ=255) aGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCg < 2:1300368/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGtt < 2:1630426/150‑1 (MQ=255) cTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCg > 2:4134327/1‑150 (MQ=255) gTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGaa > 1:4402380/1‑150 (MQ=255) gTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGaa < 1:218643/150‑1 (MQ=255) ttAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAg > 1:639657/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGc > 1:147715/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGc > 2:950851/1‑150 (MQ=255) aaTGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGAGATCTGCTGGCAATTACGCCGGTTTAAAAAGCGGTCAACATTGATTATGTTGAACCTGCAAGCGAACTGTATAAACGCTTTGATACCGCAGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGTAAgac > 2:1537641/1‑148 (MQ=255) aTGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGccc < 1:1619733/150‑1 (MQ=255) gAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCAc < 2:2741355/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACg < 1:2557059/150‑1 (MQ=255) cGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAAGTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAg < 2:2099083/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAgg > 2:2826364/1‑150 (MQ=255) gTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAgg > 1:217334/1‑150 (MQ=255) ggCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCt < 1:4955014/150‑1 (MQ=255) gCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTg < 1:3512428/150‑1 (MQ=255) aaCCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCATGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGc < 1:2277197/150‑1 (MQ=255) aaCCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGc > 2:4381555/1‑150 (MQ=255) aCCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCg > 1:2747033/1‑150 (MQ=255) cACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGa > 2:4650455/1‑150 (MQ=255) aCGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGaa > 2:3427979/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGc > 1:2247586/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGc < 1:1712709/150‑1 (MQ=255) gcgcTCTTCTGGCAATTACGCCGTGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGTACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGAGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGa < 1:3025877/150‑1 (MQ=255) gATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAAc > 2:1708750/1‑150 (MQ=255) gATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAAc > 2:80390/1‑150 (MQ=255) gATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAAc > 2:56808/1‑150 (MQ=255) aTCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACa < 2:3603092/150‑1 (MQ=255) gctgGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCAt > 1:2037151/1‑150 (MQ=255) tgGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATcg < 1:1811692/150‑1 (MQ=255) ggCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATcgg < 1:3905269/150‑1 (MQ=255) aTTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGt < 2:2235091/150‑1 (MQ=255) aTTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGt > 2:2545245/1‑150 (MQ=255) tACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTaa > 1:1361554/1‑150 (MQ=255) cGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAAtt < 1:4485351/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTc < 2:4925146/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTc < 2:196165/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCg < 2:1353834/150‑1 (MQ=255) cGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCACGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGa < 1:4016008/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAAc < 1:1004784/150‑1 (MQ=255) gAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTcc < 2:4343585/150‑1 (MQ=255) gAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTcc > 2:71788/1‑150 (MQ=255) gAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTCATTCGAACTcc > 1:4857985/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGt > 2:3234447/1‑150 (MQ=255) cgcgGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGa < 1:753742/150‑1 (MQ=255) ggTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAgg > 1:4191642/1‑150 (MQ=255) ggTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAgg > 1:4337015/1‑150 (MQ=255) ggTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAgg > 2:2130723/1‑150 (MQ=255) gTCTACATTTCTGATGTTGAACCGGCAAGCGATCTGTTTAATCGCTTTGTTACCGCCGAGATGTCTATCGGGGCGTTAATGCCGGAAGCCCACGTTGCTATGGAGGATTCGTTGATCATGATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGATggg < 2:253245/150‑2 (MQ=255) gTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAgga < 2:1112691/150‑2 (MQ=255) cAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAggcgg > 1:4637107/1‑150 (MQ=255) aaCATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAggcggc > 1:3259667/1‑150 (MQ=255) aCATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGgcggcg < 1:1098909/150‑1 (MQ=255) cATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGa > 2:4240734/1‑150 (MQ=255) gCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGAc < 1:2422773/150‑1 (MQ=255) gATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCg > 2:1784028/1‑150 (MQ=255) gATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCg > 2:3975483/1‑150 (MQ=255) aTGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCgg > 2:1589259/1‑150 (MQ=255) tGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGgc < 1:3735059/150‑1 (MQ=255) tGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGgcgcg < 2:1892795/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACgg > 1:186844/1‑150 (MQ=255) gCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACca < 2:1087143/150‑1 (MQ=255) cGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaa > 1:1252003/1‑150 (MQ=255) cGAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaa > 1:1965820/1‑150 (MQ=255) gAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcnac < 1:360388/150‑1 (MQ=255) gAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaac > 2:3760810/1‑150 (MQ=255) gAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaac < 2:2044740/150‑1 (MQ=255) gAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaac > 1:3418767/1‑150 (MQ=255) gAACTGTTTAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaac < 1:950851/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAGGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACcaaca > 2:3720895/1‑150 (MQ=255) tGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAg < 2:4858374/150‑1 (MQ=255) tttAAACGCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAgtg > 1:2906091/1‑150 (MQ=255) aaaCGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCAACGGCACCAACAAAGTGTcg > 1:5157980/1‑150 (MQ=255) gCTTTGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCa > 2:928670/1‑150 (MQ=255) ttGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCa > 2:2901988/1‑150 (MQ=255) ttGATACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCa < 2:539825/150‑1 (MQ=255) gATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAg > 2:230564/1‑150 (MQ=255) gATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAg > 2:5063800/1‑150 (MQ=255) gATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAg > 2:4951692/1‑150 (MQ=255) gATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAg > 1:3717393/1‑150 (MQ=255) tACAGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAGCa > 1:211094/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAGCAg > 1:4695104/1‑150 (MQ=255) cgccgcGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAGCAGGt > 2:2202902/1‑150 (MQ=255) | GAGTACAGCGACTATCAGGAATACGCGAAGCTGGTTAATGAGCGTCCGGCAACCACGCTGCGCGATCTGCTGGCAATTACGCCGGGTGAAAACGCGGTCAACATTGCTGATGTTGAACCGGCAAGCGAACTGTTTAAACGCTTTGATACCGCCGCGATGTCTATCGGCGCGTTAAGCCCGGAAGCCCACGAGGCGCTGGCGGAAGCGATGAACAGCATCGGCGGTAATTCGAACTCCGGTGAAGGCGGCGAAGACCCGGCGCGCTACGGCACCAACAAAGTGTCGCGCATCAAGCAGGT > CP009273/3350514‑3350812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |