Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,385,662 | C→G | 6.2% | intergenic (‑275/+155) | tldD ← / ← yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,385,662 | 0 | C | G | 6.2% | 638.4 / 3.9 | 245 | intergenic (‑275/+155) | tldD/yhdP | putative peptidase/DUF3971‑AsmA2 domains protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (156/59); new base G (4/13); total (172/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.25e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
ATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCG > CP009273/3385513‑3385811 | aTCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTcc > 1:892050/1‑150 (MQ=38) ctggCACCGGCTGTGGGATGCGGGTTAAACGCCTAACCCCACCTCGGTTTTTGTTCCGTTTGTTGGCCTTATAATACGCACCGGGTCGCCTCTGCCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGt < 1:2599461/148‑1 (MQ=9) cAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCGTATCCGACCTACGGGTATGTTCCgg > 1:4762127/1‑149 (MQ=255) aGGCAAGGGCGGTGGGTTGGGGCTTAAACGCATTATCCGACCTCCGGTTTTTTTCCGTTTGTAGCCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGtt < 2:4684327/150‑1 (MQ=14) aGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTCAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCCggt > 2:349862/1‑148 (MQ=16) gCAACGGCTGTCGTAGGCGGCGTAACCGCCTTAGCCGACCTACGTTTTTGTACCTTTTGTTGGCCTGATAAGACGCACAGCGGCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTg < 2:2180569/150‑1 (MQ=14) gCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGGTTGTGGGCCTGTTAAGACGCTCAGCGTCGCTTCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTGATCCGACCTACGGGGATGTTCCGGTTg > 1:2412186/1‑150 (MQ=14) ggcgggcGGAGGCGGCGTACCCCCCTTATCCGCCCTACGGTTATGTGCCGTTGGGAGGCCGTATAAGCCGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTCTCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGc < 2:3281930/144‑1 (MQ=14) tGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTg > 2:3943470/1‑150 (MQ=255) tGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCAGTTTGTAGGCCTg > 2:3376316/1‑150 (MQ=255) tGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCAGGATCTAGGccat > 2:818271/1‑148 (MQ=11) gTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCAGTGTGTTTGCCTGa > 1:3689392/1‑150 (MQ=11) tCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGAt < 2:1298057/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACTGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGAAGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGTCGTAAACGCCTTATCCGACATACGGTTATGTTCCGTTTGTATGCCTGATa > 2:2978103/1‑150 (MQ=14) cGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGAACTACGGTTATGTTCCGTTTCGAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCGTCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTGGGTGTGTATGCCTGATa > 1:1255021/1‑150 (MQ=11) gaggcggcgTAACCGCCTTATCCTACCTCGGGTTATGTTCGTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGAATCAGGAAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAg < 2:4648039/147‑1 (MQ=14) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGa > 1:2739254/1‑150 (MQ=255) tggggcgTAAACGCTTTATCCGACCTTGTTTTTTGTTCTTTTTGTCGGCCTTAAAAGACGCACCGCGTCGAAACTGCCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGAc < 1:2454487/147‑1 (MQ=14) gTAAACGCCTTATCCGACCTCCGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAg < 2:4004378/150‑1 (MQ=255) gccattctCCGACCTCGGGTTTTTTTCCGTTGGTCGGCCTGATAAGACGCACCGCGTCGCATCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCg < 2:3805620/143‑1 (MQ=14) gCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAATACGCACAGCGTCGc > 2:5038612/1‑150 (MQ=255) gCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGc > 1:4567250/1‑150 (MQ=255) cTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCAt > 2:1862818/1‑150 (MQ=255) cTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTATCTAGGCCAGATAAGACGCACAGccacgaat > 2:4428882/1‑143 (MQ=14) tATCCGACCTACGTTTATGTTCCGTTTGTCGGCCTTATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa < 2:3202392/150‑1 (MQ=255) tATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCa > 1:4425726/1‑150 (MQ=40) aTCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAg > 1:1748862/1‑150 (MQ=40) tCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAgg > 2:4824153/1‑150 (MQ=40) cGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCa > 1:1050985/1‑150 (MQ=38) cGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCa > 1:4564109/1‑150 (MQ=38) gACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCaa > 1:1604168/1‑150 (MQ=38) ccTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACg < 1:3547439/150‑1 (MQ=35) cTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCAACAGTCAACgg > 1:2364764/1‑150 (MQ=255) aCGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCt > 1:390026/1‑150 (MQ=35) aCGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCt > 2:4314622/1‑150 (MQ=35) aCGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCt > 1:832720/1‑150 (MQ=35) aCGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCAGTTTGTTGGCCTGATAACAAGCACAGAGACGCATCAGGCAACGGCt > 2:5240168/1‑150 (MQ=11) ggTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTATGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGc > 2:1343595/1‑150 (MQ=25) gTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGGTTGTAGGCCTGTTAAGACGCACAGCGACGCATCAGGCACCGGCTGcc > 2:4246400/1‑150 (MQ=255) ttATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGGTATGTTCGGTATGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCCGGCAACGGCTGCCg > 1:169432/1‑150 (MQ=255) tATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCCACGGCTGCCgg > 2:744342/1‑150 (MQ=25) aTGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGa > 1:732124/1‑150 (MQ=35) tCCGTTTGTAGGCATGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcg > 2:5151895/1‑150 (MQ=21) gTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggcg > 2:288784/1‑150 (MQ=32) gTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggcg > 2:1603454/1‑150 (MQ=32) gTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggcg > 2:1086798/1‑150 (MQ=32) gTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATgcggcg > 2:4766555/1‑150 (MQ=32) gTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCGGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCACCGGCTGCCGGAGgcggcg > 2:1516580/1‑150 (MQ=12) ggCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTACACGCCTTCTCCGACCTACGGTGATGTTCCGTGTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCGTCAGGCAACGGCTGCCGGAGGCGGCGTGACCGc > 2:4287613/1‑150 (MQ=11) ggCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGc > 1:4106712/1‑150 (MQ=34) ggCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGGTCCGTTTGTAGGCCTGATACGACGCACAGCGTCGCTTCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGc > 2:3882674/1‑150 (MQ=255) tGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCATTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTATGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTa > 2:1835754/1‑150 (MQ=255) gATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTAt > 1:4185555/1‑150 (MQ=37) 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cTGCCGGATGCGGCGAAAACGCATTATCCGACCTAGGGTTATGTTCCGTTTTTTGGAGTTATAAGACCCACCGCGTCGAATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGcc < 1:799594/150‑1 (MQ=14) tGCCGGCTGCGGATCAACCGCCTACTCCGCCCTCGGTTTTTGGTCCGTTTGGAGGCCTTATAAGACCCACCGCGCCGCATCCGCCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCt < 1:4721410/150‑1 (MQ=12) gcgggATGGGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTCCGGTTATGTCCCTTTTTTAGGCCTTATACGACGCACCGCGTCGCATCCGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCtt < 2:126003/147‑1 (MQ=14) ccGGATGCGCCGAAATCCCCTAACCCCCCCACCGGTTTTGTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCttt < 2:1775358/150‑1 (MQ=17) cGGATGCGGGTTAACCGCCTTCTCCGCCCTCGGGTTTTGTTCGGTTTGTAGGCCTTATACGACGCACCGCGTCGCATCTGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTg < 1:2221690/150‑1 (MQ=17) ggcgTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGa > 2:3399398/1‑150 (MQ=255) gcgttAACCGCCTAACCCGACCTCGGTTTTTGTCCGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACCGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGa < 2:48783/146‑1 (MQ=17) gTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTa > 1:958614/1‑150 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTa > 1:3510691/1‑150 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTa > 1:1176357/1‑150 (MQ=255) 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cGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCg > 2:1923380/1‑150 (MQ=255) cGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCg > 1:5022769/1‑150 (MQ=255) | ATCAGGCAACGGCTGTCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGACCTACGGTTATGTTCCGTTTGTAGGCCTGATAAGACGCACAGCGTCGCATCAGGCAACGGCTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCG > CP009273/3385513‑3385811 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |