| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,649,797 | C→A | 100% | E102* (GAA→TAA) | hdeA ← | stress response protein acid‑resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,649,797 | 0 | C | A | 98.8% | 1042.5 / 2.7 | 323 | E102* (GAA→TAA) | hdeA | stress response protein acid‑resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (173/146); total (175/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
CATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTG > CP009273/3649650‑3649943 | cATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGc < 1:1099367/150‑1 (MQ=255) tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCtt < 2:5256048/150‑1 (MQ=255) tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCtt < 2:5007190/150‑1 (MQ=255) tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCtt < 2:4822740/150‑1 (MQ=255) tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCtt < 2:2424406/150‑1 (MQ=255) tttGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCtt < 1:1564798/150‑1 (MQ=255) tAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAAc < 1:3489944/150‑1 (MQ=255) aaCCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACt < 2:724204/150‑1 (MQ=255) aTTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATc < 2:4202480/150‑1 (MQ=255) aTTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATc > 2:601483/1‑150 (MQ=255) aTTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATc < 1:3596254/150‑1 (MQ=255) aTTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATc > 1:2808551/1‑150 (MQ=255) tCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCtt > 1:29119/1‑150 (MQ=255) aaTATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGACGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATCTCTTTCTGAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTCTCTTTa > 1:2749139/1‑150 (MQ=255) aaTATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTGTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTa > 1:5289191/1‑150 (MQ=255) atatAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACTCATTACCGGAAATACATATCTTTCTTAATTTTGTACCATAAGCATTTAACTTTATCTTTaa > 1:3851688/1‑150 (MQ=255) atatAGAGAATATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaa > 2:1643120/1‑150 (MQ=255) tataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTaaa < 1:891934/150‑1 (MQ=255) tataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGATTTTAAAGAAGATATTACGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCAATTAGACTTTAACTTTATCTTTaaa < 1:2329123/150‑1 (MQ=255) ataGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAg > 2:328925/1‑150 (MQ=255) agagATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGtt < 2:324950/150‑1 (MQ=255) agaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTgg > 1:2410/1‑150 (MQ=255) agaTTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCAGTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTgg > 1:2583031/1‑150 (MQ=255) ttATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCtt < 2:2702654/150‑1 (MQ=255) atatatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGt > 1:3922361/1‑150 (MQ=255) tatGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTa > 1:116082/1‑150 (MQ=255) gAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGACTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATcc > 1:823137/1‑150 (MQ=255) gAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATcc > 1:1048611/1‑150 (MQ=255) gAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATca > 2:4156204/1‑149 (MQ=255) cAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGa > 1:189027/1‑150 (MQ=255) aggaggAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAg < 2:452650/150‑1 (MQ=255) ggaggaATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGt < 2:2953138/150‑1 (MQ=255) gaATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACaa > 1:1381223/1‑150 (MQ=255) tAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGcc > 2:2283156/1‑150 (MQ=255) aGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCt > 1:504356/1‑150 (MQ=255) gctgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTg < 1:2101429/150‑1 (MQ=255) ctgctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGa < 2:2102035/150‑1 (MQ=255) gctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAAc < 2:396579/150‑1 (MQ=255) ctTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACg < 2:1993981/150‑1 (MQ=255) tttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGAt < 1:2483967/150‑1 (MQ=255) tttAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGAt < 2:1149958/150‑1 (MQ=255) aagaagATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCt < 2:4237973/150‑1 (MQ=255) aagaagATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCt < 2:3761829/150‑1 (MQ=255) agaagaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTg > 2:5130115/1‑150 (MQ=255) agaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTgggg > 1:4385293/1‑150 (MQ=255) gaTATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGt > 1:1938201/1‑150 (MQ=255) atatTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGtt < 1:1787515/150‑1 (MQ=255) atatTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGtt < 1:3690051/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGt > 1:1830212/1‑150 (MQ=255) ggCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTg > 2:2576296/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCa < 1:955277/150‑1 (MQ=255) cTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCaa > 2:4284821/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCaa < 2:2868722/150‑1 (MQ=255) gTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATa < 2:3531913/150‑1 (MQ=255) gTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATa > 1:4799795/1‑150 (MQ=255) ttCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATAc < 1:4061285/150‑1 (MQ=255) aaTATTCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCt < 2:3413838/150‑1 (MQ=255) aaTATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCACATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTAAAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCt > 1:4624336/1‑150 (MQ=255) atatGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTg < 2:4746490/150‑1 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt > 2:1882979/1‑150 (MQ=255) cAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACAt < 2:4089806/150‑1 (MQ=255) aaGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATc < 2:1048611/150‑1 (MQ=255) aGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCt > 2:3090607/1‑150 (MQ=255) aGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaaa > 1:680451/1‑150 (MQ=255) aGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaaa > 1:1529194/1‑150 (MQ=255) aGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaaa > 1:98584/1‑150 (MQ=255) aGNACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTaaaa > 1:4191749/1‑150 (MQ=255) aCGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCg > 1:3042391/1‑150 (MQ=255) aTGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAt > 2:3625188/1‑150 (MQ=255) aCGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCAtcttct < 1:328925/150‑1 (MQ=255) cGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTg > 1:1195449/1‑150 (MQ=255) gCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTgg > 1:71548/1‑150 (MQ=255) aTTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGtt > 2:2127393/1‑150 (MQ=255) tCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTa < 1:2385713/150‑1 (MQ=255) cccGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTAt > 2:1820630/1‑150 (MQ=255) ggAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCtt < 1:3150762/150‑1 (MQ=255) gAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGATTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCttt > 1:4582629/1‑150 (MQ=255) aaTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttg < 1:4565448/150‑1 (MQ=255) aaTTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTttg > 2:1369957/1‑150 (MQ=255) aaTTAAATATCTTTCTTAAATTTGACCCATTAGCCTTTAACAATATAATTAAAGTTGGCTTGTTTATCATCAGTAAAAGCATGAAAGATAGCTGGGGATACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTACTGTTATATCtttt > 2:151306/1‑149 (MQ=255) aCATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTtgttgt < 2:1455834/150‑1 (MQ=255) aCATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTtgttgt > 2:432883/1‑150 (MQ=255) atatCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTc > 2:1260540/1‑150 (MQ=255) atatCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTc > 1:4965443/1‑150 (MQ=255) tatCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCa < 2:3872132/150‑1 (MQ=255) tatCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCa < 1:1734546/150‑1 (MQ=255) tatCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCa > 2:542759/1‑150 (MQ=255) atCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAg < 2:5083771/150‑1 (MQ=255) atCTTTCTTAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAg > 2:2811976/1‑150 (MQ=255) tctttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAgc < 2:4966439/150‑1 (MQ=255) tctttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGATTATCTTTGTTGTTCAgc > 2:464816/1‑150 (MQ=255) ctttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAgcg < 1:4657864/150‑1 (MQ=255) ttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCt > 1:3405970/1‑150 (MQ=255) ttcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCt < 2:3176953/150‑1 (MQ=255) tcttAATTTTGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCtt > 1:5081324/1‑150 (MQ=255) ttGTCCCATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCaaaa > 1:1619865/1‑150 (MQ=255) cccATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCaa > 2:1078672/1‑150 (MQ=255) cATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACt < 2:2393209/150‑1 (MQ=255) cATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACt < 2:665214/150‑1 (MQ=255) cATTAGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACt < 1:44809/150‑1 (MQ=255) | CATTTTGTAACCCATTCAATATAGAGATTATATATGAACAGGAGGAATAGCTGCTTTTAAAGAAGATATTCCGGCCTGTTCAATATGCAAGGAAGTACGATGTAACGCATTCCCGGAATTACATATCTTTCTTAATTTTGTCCCATTCGCCTTTAACTTTATCTTTAAAGTTGGCTTGTTTATCCTGAGTACAAGCCTGAACGATAGCTGGGGTTACGGTTGCAATACCCTGAACATCTAAAACCGCATCTTCTGGTTTATCTTTGTTGTTCAGCGCTTCAGCAAAACCAACTG > CP009273/3649650‑3649943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |