| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 294,929 | C→A | 100% | E573* (GAA→TAA) | paoC ← | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 294,929 | 0 | C | A | 99.3% | 959.9 / ‑2.3 | 297 | E573* (GAA→TAA) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (139/156); total (140/157) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
CAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTCA > CP009273/294782‑295075 | aGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAAt > 1:2846189/1‑150 (MQ=255) aGTTTTCGGATTAAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAAt > 2:3555499/1‑150 (MQ=255) ttttCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGc < 2:3262936/150‑1 (MQ=255) ttttCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGc < 1:294543/150‑1 (MQ=255) ttttCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGc < 2:2173998/150‑1 (MQ=255) ttttCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGc < 1:4473788/150‑1 (MQ=255) ttCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGctc < 1:1397591/150‑1 (MQ=255) cGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGctctc < 2:1032834/150‑1 (MQ=255) gATTAAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCtt < 1:5027717/150‑1 (MQ=255) ttaaGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTcc < 2:2417765/147‑1 (MQ=255) ttCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTcc < 1:1812886/150‑1 (MQ=255) ttCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTcc < 2:1165892/150‑1 (MQ=255) taaGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCg > 1:1473264/3‑150 (MQ=255) taaGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCg < 2:5049171/148‑1 (MQ=255) tCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAACTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCg < 1:2195543/150‑1 (MQ=255) tCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCg < 1:2362814/150‑1 (MQ=255) aGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGACTTAAATGCTCTCTTCCGCt > 1:3634651/1‑150 (MQ=255) aGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCt > 1:4089176/1‑150 (MQ=255) aGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACGTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACACAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCt < 2:4346445/150‑1 (MQ=255) ggATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTg > 1:1946815/1‑150 (MQ=255) gATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGt < 2:5256855/150‑1 (MQ=255) gCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAg < 1:1125458/150‑1 (MQ=255) gCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAg < 1:575699/150‑1 (MQ=255) gTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTc > 2:1470842/1‑150 (MQ=255) tCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCt > 1:4799970/1‑150 (MQ=255) tCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCt > 2:2756505/1‑150 (MQ=255) tGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgcc < 2:4700470/150‑1 (MQ=255) agcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc > 2:4414915/1‑150 (MQ=255) agcaCACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc > 2:3723290/1‑150 (MQ=255) acacacaGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc < 2:207368/150‑1 (MQ=255) cGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 1:4687797/1‑150 (MQ=255) gAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACATAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc < 2:1325149/150‑1 (MQ=255) gAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc < 1:2219503/150‑1 (MQ=255) aGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAACTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:2634649/150‑1 (MQ=255) aTACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGt > 2:627741/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAg < 1:2128171/150‑1 (MQ=255) cGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGc < 1:3800174/150‑1 (MQ=255) ggACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg > 2:2527619/1‑150 (MQ=255) ccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAACTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCt < 2:1441462/150‑1 (MQ=255) gAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc < 1:2594802/150‑1 (MQ=255) cTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:2820933/150‑1 (MQ=255) ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGt > 2:2991621/1‑150 (MQ=255) ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGt < 1:3183180/150‑1 (MQ=255) tctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTa < 1:2740242/150‑1 (MQ=255) tcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 2:1939984/150‑1 (MQ=255) tcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 1:3882494/150‑1 (MQ=255) tcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 2:4799436/150‑1 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCg < 2:1805502/150‑1 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCg > 1:4244454/1‑150 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCg < 2:2619546/150‑1 (MQ=255) cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt < 1:5328122/150‑1 (MQ=255) tCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 1:4007833/150‑1 (MQ=255) gcgcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTa < 1:1067721/150‑1 (MQ=255) gcgcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTa < 1:3077869/150‑1 (MQ=255) cgcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTaa > 2:4897063/1‑150 (MQ=255) tATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCt > 2:4085660/1‑150 (MQ=255) aTGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCtt < 2:764549/150‑1 (MQ=255) cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAATGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 1:3003427/1‑150 (MQ=255) 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cccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTc < 2:1746056/150‑1 (MQ=255) ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCa < 1:1525569/150‑1 (MQ=255) ggCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAgg < 2:2361713/150‑1 (MQ=255) ggCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAgg < 1:16525/150‑1 (MQ=255) aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATc > 1:3485873/1‑150 (MQ=255) aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATc > 1:3394856/1‑150 (MQ=255) ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCaaa < 1:99529/150‑1 (MQ=255) cGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAAccc > 1:4921958/1‑150 (MQ=255) cGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCCGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAAccc < 2:3941797/150‑1 (MQ=255) gACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCg > 2:3709961/1‑150 (MQ=255) 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aaTTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTc < 1:685167/150‑1 (MQ=255) aaTTAAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTc > 1:2554885/1‑150 (MQ=255) | CAGTTTTCGGATTCAGGATGCGTCCTGCAGCACACACAGCGAGCATACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACTGCGACTGCTCAGGATCAAACCCGACTGCCGAGGCAATCATTTCGCGAAGCTTCA > CP009273/294782‑295075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |