| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,738,088 | 0 | T | A | 26.6% | 621.6 / 270.9 | 357 | F134Y (TTC→TAC) | yiaM | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter small permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (116/146); new base A (52/43); total (168/189) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.31e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
CCATTCCTTAATCTTATTTATTTGTGGCGCACTGGCCTGGGGCGCAACGCTAAAAACAATTCAGGACTGGAGCGATTATTCACCGATCCTCGGTTTACCCATCGGCCTGATGTATGCCGCTTGTCTGCCCACCAGCCTCGTTATCGCATTCTTTGAACTGCGTCATTTATATCAACTCATCACGCGTAGCAATTCTCTAACGTCGCCACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTT > CP009273/3737939‑3738237 | ccATTCCTTAATCTTATTTATTTGTTGCGCACTGGCCTGGGGCGCAACGCTAAAAACAATTCAGGACTGGAGCGATTATTCACCGATCCTCGGTTTACCCATCTGCCTGATGTATGCCGCTTGTCTGCCCACCAGCATCGTTATCTCAtt > 1:724414/1‑150 (MQ=255)ccATTCCTTAATCTTATTTATTTGTGGCGCACTGGCCTGGGGCGCAACGCTAAAAACAATTCAGGACTGGAGCGATTATTCACCGATCCTCGGTTTACCCATCGGCCTGATGTATGCCGCTTGTCTGCCCACCAGCCTCGTTATCGCAtt > 1:4277161/1‑150 (MQ=255)ccATTCCTTAATCTTATTTATTTGTGGCGCACTGGCCTGGGGCGCAACGCTAAAAACAATTCAGGACTGGAGCGATTATTCACCGATCCTCGGTTTACCCATCGGCCTGATGTATGCCGCTTGTCTGCCCACCAGCCTCGTTATCGCAtt > 1:585516/1‑150 (MQ=255) 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cATTCTTTGAACTGCGTCATTTATATCAACTCATCACGCGTAGCAATTCTCTAACGTCGCCACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACt > 2:4168956/1‑150 (MQ=255) tCTTTGAACTGCGTCATTTATATCAACTCATCACGCGTAGCAATTCTCTAACGTCGCCACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACtgtt > 1:1342606/1‑150 (MQ=255) | CCATTCCTTAATCTTATTTATTTGTGGCGCACTGGCCTGGGGCGCAACGCTAAAAACAATTCAGGACTGGAGCGATTATTCACCGATCCTCGGTTTACCCATCGGCCTGATGTATGCCGCTTGTCTGCCCACCAGCCTCGTTATCGCATTCTTTGAACTGCGTCATTTATATCAACTCATCACGCGTAGCAATTCTCTAACGTCGCCACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTT > CP009273/3737939‑3738237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |