| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,824,948 | T→A | 29.3% | W378R (TGG→AGG) | yicH → | putative inner membrane‑anchored periplasmic AsmA family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,824,948 | 0 | T | A | 29.3% | 370.3 / 198.7 | 242 | W378R (TGG→AGG) | yicH | putative inner membrane‑anchored periplasmic AsmA family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (99/72); new base A (34/35); total (135/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CAGCCGCTGGGAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTGGAGT > CP009273/3824800‑3825097 | aGCCGCTGGGAAGGGGGTCTGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCGTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCggtagg > 1:190752/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTa > 1:3001091/1‑150 (MQ=255) cTGGGAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTaaa < 2:4775949/150‑1 (MQ=255) gggAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACa > 1:2788588/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAg < 2:2579024/150‑1 (MQ=255) gAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGc < 2:3890729/150‑1 (MQ=255) aGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCt < 1:101608/150‑1 (MQ=255) aGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCt > 1:228241/1‑150 (MQ=255) gTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAAc > 1:2635647/1‑150 (MQ=255) gTAGGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAAc < 2:1190764/150‑1 (MQ=255) tCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAaga < 1:3762591/150‑1 (MQ=255) gAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGTGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGAt < 2:2085297/150‑1 (MQ=255) aaCGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGAtt > 2:396117/1‑150 (MQ=255) gTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAg < 2:1089932/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAg < 1:1972042/150‑1 (MQ=255) gggAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGGTGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGcc > 2:240174/1‑150 (MQ=255) gggAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGcc < 2:2536050/150‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATGGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGcc < 2:4956146/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGAAGATGCGGCAAGTGCCGGGCTGGAATATACCGTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGc < 2:935517/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCa > 2:1742963/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAAt < 1:3809844/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAAt < 1:401734/150‑1 (MQ=255) tGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATc < 2:2715132/150‑1 (MQ=255) tGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATc > 1:1829252/1‑150 (MQ=255) gCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCt > 2:3415148/1‑150 (MQ=255) cGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATGGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTg < 1:1393530/150‑1 (MQ=255) gTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGa > 1:5045608/1‑150 (MQ=255) aCGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCa > 1:2192625/1‑150 (MQ=255) ggAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTg < 1:5151806/150‑1 (MQ=255) ggAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTg < 1:815062/150‑1 (MQ=255) gAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGa > 1:944157/1‑150 (MQ=255) aaaaCGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGat > 1:4937535/1‑150 (MQ=255) aaCGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGatat < 2:3683632/150‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGatat < 2:5233724/150‑1 (MQ=255) aCGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATc < 1:2060725/150‑1 (MQ=255) gTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGa > 1:2570540/1‑150 (MQ=255) aTCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCt > 2:1336396/1‑150 (MQ=255) cTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGAc < 2:2758384/150‑1 (MQ=255) cTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGAc > 1:893841/1‑150 (MQ=255) atgatgCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTcc < 1:808456/150‑1 (MQ=255) tgatgCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTccc < 2:3206491/150‑1 (MQ=255) tgatgCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTccc > 1:3169683/1‑150 (MQ=255) atgCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGt < 2:2064935/150‑1 (MQ=255) gCGGCAATGGCCGGGCTGGAATAGACCTGGCCGAAAATCGGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTgg < 2:351/150‑1 (MQ=255) cGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTAAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCAGTGGc > 2:2058714/1‑150 (MQ=255) ggCAATGGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCa < 1:4847277/150‑1 (MQ=255) gCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAg > 2:135713/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCa > 2:3401407/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCa > 1:2524966/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGAGCATTGATATCGACACTGACTTCCCGTGGCAGCTCAc > 1:3281112/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCAcc < 1:1567930/150‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACcg < 2:5066643/150‑1 (MQ=255) gCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCt > 1:2514/1‑150 (MQ=255) tGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCg < 1:3326684/150‑1 (MQ=255) tGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCg < 1:1661799/150‑1 (MQ=255) ggAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGa < 1:360346/150‑1 (MQ=255) tataCCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGt > 1:3240582/1‑150 (MQ=255) tataCCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGt > 2:2831247/1‑150 (MQ=255) ataCCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGtt > 2:4451737/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACgg > 1:1519915/1‑150 (MQ=255) ttGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATTGAAACTACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGAAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGt < 1:3883866/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAAc > 2:4254342/1‑150 (MQ=255) aaaaCTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAAcc > 1:3998920/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCt < 2:310149/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCt < 2:2472242/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCt < 2:4769461/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTg > 1:3449396/1‑150 (MQ=255) gCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCt < 2:5183891/150‑1 (MQ=255) gCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGATGGTTAAACAGCCTGCAACAGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGAGCCAACCTGACGCt > 2:4110925/1‑150 (MQ=255) aaCAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTgg < 2:539186/150‑1 (MQ=255) aaCAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTgg > 2:3197597/1‑150 (MQ=255) aaCAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTgg > 2:3588169/1‑150 (MQ=255) aGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTa > 1:2466333/1‑150 (MQ=255) aGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTa > 2:312307/1‑150 (MQ=255) aGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTa > 1:544656/1‑150 (MQ=255) aGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTa > 1:5252923/1‑150 (MQ=255) aGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTa < 1:2621032/150‑1 (MQ=255) gTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTAc < 2:3731780/150‑1 (MQ=255) tgttGATGTAAACGACACCCGGTTGTTTAAACAGCCTGCTACTGAATAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCg < 1:3221673/150‑1 (MQ=255) tggatggaAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGAt > 1:1278372/1‑150 (MQ=255) atggaAACGACACCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCAt < 1:3781947/150‑1 (MQ=255) tggaAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATa < 1:5146337/150‑1 (MQ=255) aaaCGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAAt < 2:2622767/150‑1 (MQ=255) aaCGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATg > 2:2205656/1‑150 (MQ=255) aaCGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATg < 2:4158719/150‑1 (MQ=255) aaCGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATg > 2:4399151/1‑150 (MQ=255) aCGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATgg < 2:693690/150‑1 (MQ=255) gACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATgggg > 1:4471180/1‑150 (MQ=255) gACACCCGGTTGGTGAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATgggg < 1:2842584/150‑1 (MQ=255) acacCCGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGc < 2:418803/150‑1 (MQ=255) cacCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCg > 1:977980/1‑150 (MQ=255) acCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGt > 1:4874259/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCt < 1:4116135/150‑1 (MQ=255) cGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTg > 1:72408/1‑150 (MQ=255) cGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTg > 2:1922685/1‑150 (MQ=255) cGGTAGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTg > 1:4156547/1‑150 (MQ=255) ggtaggttAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTgg > 2:2026304/1‑150 (MQ=255) ttggttAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTGGAg > 1:4311119/1‑150 (MQ=255) tggttAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTGGAGt < 1:5262911/150‑1 (MQ=255) tggttAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTGGAGt < 2:1845185/150‑1 (MQ=255) | CAGCCGCTGGGAAGGGGGTATGGTCAGAACGTCAGGGAACTGGCTGCGTGACGGGAAAACGTTGATCCTTGATGATGCGGCAATTGCCGGGCTGGAATATACCTTGCCGAAAAACTGGCAACAGTTGTGGATGGAAACGACACCCGGTTGGTTAAACAGCCTGCAACTGAAGAGATTTAGCGCCAGCCGCAATCTGATCATTGATATCGACCCTGACTTCCCGTGGCAGCTCACCGCGCTCGATGGTTACGGTGCCAACCTGACGCTGGTTACCGATCATAAATGGGGCGTCTGGAGT > CP009273/3824800‑3825097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |