Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 309,680 | C→T | 9.5% | intergenic (‑164/‑388) | ykgP ← / → eaeH | pseudogene, oxidoreductase family/pseudogene, attaching and effacing protein homology;factor; Not classified |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 309,680 | 0 | C | T | 9.5% | 1229.0 / 77.5 | 378 | intergenic (‑164/‑388) | ykgP/eaeH | pseudogene, oxidoreductase family/pseudogene, attaching and effacing protein homology;factor; Not classified |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (140/202); new base T (18/18); total (158/220) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
AGAAGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAGGTATCTATTT > CP009273/309531‑309829 | aaGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCa > 2:2497432/1‑150 (MQ=255) aaGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCa > 1:2712248/1‑150 (MQ=255) aGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCAt < 1:5078554/150‑1 (MQ=255) cATAACGTAAAGGGAAAAGCTCTATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATNAATATCCATaa < 1:2760801/150‑1 (MQ=255) aTAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATaaa > 2:747591/1‑150 (MQ=255) cGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAat < 1:2503533/150‑1 (MQ=255) aaGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAatatat < 1:3821745/150‑1 (MQ=255) aGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATAtt > 2:5289647/1‑150 (MQ=255) aGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATAtt < 2:1799004/150‑1 (MQ=255) gggAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTg < 1:3749961/150‑1 (MQ=255) gggAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTg < 1:3911882/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCTCTATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGt > 2:4026761/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGt > 1:2189023/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGt > 1:4966831/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGtt < 2:1993392/150‑1 (MQ=255) aGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTAt > 2:23515/1‑150 (MQ=255) aGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTAt > 2:3560262/1‑150 (MQ=255) aGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTAt < 1:4486404/150‑1 (MQ=255) tCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCt > 2:2871461/1‑150 (MQ=255) tCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCt < 1:2660020/150‑1 (MQ=255) ttAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCa < 1:3688122/150‑1 (MQ=255) tAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCat > 2:4214034/1‑150 (MQ=255) tAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCat < 2:1672924/150‑1 (MQ=255) cGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCatatat > 2:1191408/1‑150 (MQ=255) cGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCatatat < 2:831682/150‑1 (MQ=255) cAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATAcc < 1:1392824/150‑1 (MQ=255) aaTTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTAt > 2:600926/1‑150 (MQ=255) aaTTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTAt < 1:4049433/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTAtt > 1:5012944/1‑150 (MQ=255) aTTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTAtt < 2:221838/150‑1 (MQ=255) tttGTCAGGGGTTATGAACGAAAGTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTAttt < 2:1207505/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGa > 1:1785374/1‑150 (MQ=255) tCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGTTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGAc < 2:2405758/150‑1 (MQ=255) ggTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTAtt < 1:3800122/150‑1 (MQ=255) ggTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTAtt < 1:1473803/150‑1 (MQ=255) ggTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTAtt > 2:487423/1‑150 (MQ=255) ttATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTc < 1:3051487/150‑1 (MQ=255) gAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAAt > 2:304334/1‑150 (MQ=255) aaCGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATa < 2:1058777/150‑1 (MQ=255) aaCGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATa > 2:2136326/1‑150 (MQ=255) aaaTTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGttt < 1:4933378/150‑1 (MQ=255) aTTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTtta < 2:3130619/150‑1 (MQ=255) aTTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAAGAGTTtta > 1:4386894/1‑150 (MQ=255) ttCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTttaa > 2:3198375/1‑150 (MQ=255) aaaTCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTaaa < 1:283859/150‑1 (MQ=255) aaTCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAg < 2:4524410/150‑1 (MQ=255) aTCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAgg < 2:4123021/150‑1 (MQ=255) aTCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAgg < 2:1459962/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGc > 1:3597639/1‑150 (MQ=255) cTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCa < 1:3389540/150‑1 (MQ=255) tGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAg > 2:1929682/1‑150 (MQ=255) gTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAgg > 1:3124827/1‑150 (MQ=255) tGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCa < 1:1325728/150‑1 (MQ=255) aGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCAtt > 1:1631798/1‑150 (MQ=255) gtTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGtt > 2:4971084/1‑150 (MQ=255) tGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTAt < 1:4983839/150‑1 (MQ=255) tGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTAt < 2:3065649/150‑1 (MQ=255) cGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTc < 2:5265038/150‑1 (MQ=255) cGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTc < 2:1294743/150‑1 (MQ=255) gATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCa > 2:3899332/1‑150 (MQ=255) aTGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATTAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCAc < 2:3857271/150‑1 (MQ=255) aTGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCAc > 1:1116841/1‑150 (MQ=255) aTGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCAc > 1:2560224/1‑150 (MQ=255) gggTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCActc > 2:2668939/1‑150 (MQ=255) ggTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCActct > 1:4781610/1‑150 (MQ=255) aGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGaa < 2:562442/150‑1 (MQ=255) aGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGaa > 1:2305241/1‑150 (MQ=255) gTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAAt < 1:3203289/150‑1 (MQ=255) gTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAAt < 1:463359/150‑1 (MQ=255) tGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATa < 1:2902146/150‑1 (MQ=255) cGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAatta > 1:732276/1‑150 (MQ=255) gATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAattat > 1:4010635/1‑150 (MQ=255) atatCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAattatt > 1:3511393/1‑150 (MQ=255) atatCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAattatt > 2:4355000/1‑150 (MQ=255) atatCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAattatt > 1:2441701/1‑150 (MQ=255) atCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCa > 1:3984655/1‑150 (MQ=255) cGCAATTTACAGTCCTATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGTCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTc < 1:5245031/150‑1 (MQ=255) gCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTcc < 2:5068137/150‑1 (MQ=255) aaTTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGc < 2:2968094/150‑1 (MQ=255) tACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCagag < 1:3960748/150‑1 (MQ=255) aCAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGt > 1:2868679/1‑150 (MQ=255) aGTCCGATGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTaa > 2:3786506/1‑150 (MQ=255) ccGAAGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGaa < 2:2933217/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGaaa > 1:823466/1‑150 (MQ=255) gATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAat < 2:3679321/150‑1 (MQ=255) gATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAat < 1:2969820/150‑1 (MQ=255) aTGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAata > 1:199898/1‑150 (MQ=255) aTGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAata < 1:171391/150‑1 (MQ=255) aTGAAGGAAAATGAATATTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAata < 2:712151/150‑1 (MQ=255) aaGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATaa > 1:5172651/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTa > 1:667140/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTa > 1:1540898/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAg > 1:4286746/1‑150 (MQ=255) aaaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAg > 1:3257667/1‑150 (MQ=255) aaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAgg < 1:487423/150‑1 (MQ=255) aaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAgg > 1:39324/1‑150 (MQ=255) aaTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAgg < 2:2743561/150‑1 (MQ=255) aTGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAGGt > 1:4226021/1‑150 (MQ=255) gAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAGGTAt < 2:3473978/150‑1 (MQ=255) tatTCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAGGTATCTa > 2:4663868/1‑150 (MQ=255) | AGAAGCATAACGTAAAGGGAAAAGCTCGATTAGACGGCAGAATTTGTCAGGGGTTATGAACGAAATTCATAAATCTGTTTGAGTGTTGCGATGGGTAGTGCAAGTTCGATATCTCCGCAATTTACAGTCCGATGAAGGAAAATGAATATCCATAAAAAATATATTGGTTTATCCTGGCATATATACCTATTTCGACGTATTTCCAATAGTTTTAATTAAAGGCAGGTCATTGTTATTCACTCTGAATAGTGAATTATTCACTGTCCGCAGAGTAAGAAATATAACTTAGGTATCTATTT > CP009273/309531‑309829 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |