| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,875,671 | G→A | 28.0% | T4I (ACC→ATC) | dnaN ← | DNA polymerase III, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,875,671 | 0 | G | A | 28.0% | 694.1 / 303.9 | 386 | T4I (ACC→ATC) | dnaN | DNA polymerase III, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (145/132); new base A (45/63); total (190/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
CCATTTCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAATCT > CP009273/3875522‑3875819 | aTTTCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTa > 2:2847412/1‑150 (MQ=255) tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAAt < 1:4946367/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAAt < 2:1637020/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAAt < 1:2825250/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAAt < 2:2360482/150‑1 (MQ=255) cATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAAttt < 1:4465523/150‑1 (MQ=255) tctcGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCa < 1:805859/150‑1 (MQ=255) gagaTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAgg > 2:2324142/1‑150 (MQ=255) agaTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGt < 1:5108541/150‑1 (MQ=255) agaTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGt > 1:5307836/1‑150 (MQ=255) gaTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGtt < 1:574276/150‑1 (MQ=255) aTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGttt < 1:2401232/150‑1 (MQ=255) aTCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGttt > 1:3792840/1‑150 (MQ=255) cAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTAc < 1:1050639/150‑1 (MQ=255) aGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACg > 2:2084669/1‑150 (MQ=255) aGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAAGCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCAGAGGTTTACg > 2:3964442/1‑150 (MQ=255) tACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGAt < 1:5218876/150‑1 (MQ=255) tACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGAt < 1:5261758/150‑1 (MQ=255) tACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCAGAGGTTTACGAt > 1:1880926/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGAc < 2:64024/150‑1 (MQ=255) ggTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACa < 2:4227111/150‑1 (MQ=255) cAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATg < 2:1872803/150‑1 (MQ=255) aGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGt > 2:324382/1‑150 (MQ=255) gaaaaCGTACCGTCAGCAACCAGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACACTGTTCt < 2:1269966/147‑1 (MQ=255) gACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCt < 1:115344/150‑1 (MQ=255) gACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACAGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTATCGGTTTTAATAAATGATCACTTTCTACGGTAAATTTCATATGTTTACGATGACAATGTTCt > 2:4950305/1‑150 (MQ=255) aCAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTg < 2:33425/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCTCCTAACGGACCTCTCTCCTGTTGTAGCTGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTACATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAAt < 1:2225498/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTGTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATATCATAGGTTTACGATGACAAGGTTCTGATAAAAt > 1:3587286/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAAttt < 1:3258833/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTg > 2:4684253/1‑150 (MQ=255) tCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGa > 1:988948/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGaaa > 1:3281592/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGaaa < 2:3577694/150‑1 (MQ=255) tAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATcttctt < 2:3673960/150‑1 (MQ=255) tAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATcttctt > 1:700859/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTg < 1:2679869/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTg < 2:4754588/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTg < 1:4691914/150‑1 (MQ=255) agATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATc < 2:4057045/150‑1 (MQ=255) agATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATc < 1:1114781/150‑1 (MQ=255) gATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCg > 2:1478548/1‑150 (MQ=255) gATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCCTCTTTGATATCg < 2:3031038/150‑1 (MQ=255) aCCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCATTGATATCGTGGc < 2:556909/150‑1 (MQ=255) gagaATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGctct > 2:2898599/1‑150 (MQ=255) aaTCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGGCCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCtt < 1:415386/150‑1 (MQ=255) aaTCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCtt > 1:5059552/1‑150 (MQ=255) aaTCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCtt > 2:755854/1‑150 (MQ=255) ctCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCGGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCACACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTc < 2:5026198/149‑1 (MQ=255) aTCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTc < 2:1236421/150‑1 (MQ=255) aTCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTc > 1:1544050/1‑150 (MQ=255) ggTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCTCg > 2:893307/1‑150 (MQ=255) aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa < 1:5155243/150‑1 (MQ=255) aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa > 2:2584825/1‑150 (MQ=255) aGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCaa > 1:1001516/1‑150 (MQ=255) gTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATTGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTg < 2:2455985/150‑1 (MQ=255) ggACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTCTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTAAAAGGTTTAAGATGACAATTTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTATTATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGATc > 1:3208040/1‑150 (MQ=255) cgacCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGAt < 1:310817/150‑1 (MQ=255) accaccTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCt < 1:3675385/150‑1 (MQ=255) accaccTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCt < 1:2089495/150‑1 (MQ=255) ccaccTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCtt > 1:1441907/1‑150 (MQ=255) aaCGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACggca < 2:2150807/150‑1 (MQ=255) cGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACggcagg < 1:3041432/150‑1 (MQ=255) gACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACggcaggca > 1:4666839/1‑150 (MQ=255) aCCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCAt < 1:3759282/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCAt > 2:4813540/1‑150 (MQ=255) aCCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCAt > 2:4303686/1‑150 (MQ=255) ccGCTCAACTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATg < 2:3097211/150‑1 (MQ=255) gCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGaa < 1:4001869/150‑1 (MQ=255) cTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAg < 2:5077872/150‑1 (MQ=255) cTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAg > 2:1728816/1‑150 (MQ=255) cTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAg > 1:1198865/1‑150 (MQ=255) cACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCa > 2:1386270/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCAc < 1:2029072/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCAcc < 1:4517404/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGTAGCGGATTTAATAACTGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCAcc < 1:3917592/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTAGCTGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTAAGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACATTGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTATGGCAGGCATGAAGCACcg < 1:2272909/150‑1 (MQ=255) tgttgtAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACcgt < 2:3804043/150‑1 (MQ=255) gttgtAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACcgtc > 2:1130755/1‑150 (MQ=255) tgtAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACcgtcgt > 1:4386464/1‑150 (MQ=255) gtAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCgtg > 1:1691098/1‑150 (MQ=255) gtAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCgtg < 1:5176056/150‑1 (MQ=255) tAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCgtgt > 1:4087844/1‑150 (MQ=255) gTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACTATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCACGCATGAAGCACAGTCGTGTGGTCa > 2:94888/1‑150 (MQ=255) tttAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACg > 1:74924/1‑150 (MQ=255) taataaATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGc < 1:4249270/150‑1 (MQ=255) aataaATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGcc > 2:2872360/1‑150 (MQ=255) aataaATGCTCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGcc > 1:291315/1‑150 (MQ=255) ataaATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGcca > 2:2726047/1‑150 (MQ=255) cTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACg > 1:4603198/1‑150 (MQ=255) tCACGTTCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGc < 2:3480891/150‑1 (MQ=255) cGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGTCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAAAGAATc > 2:4473956/1‑150 (MQ=255) cGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATc > 1:1373535/1‑150 (MQ=255) cGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATc > 1:2502534/1‑150 (MQ=255) gTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCg > 1:1304051/1‑150 (MQ=255) gTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCg > 2:345547/1‑150 (MQ=255) tCTACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCACACGCATCGcc > 1:4862995/1‑150 (MQ=255) tACGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCaa > 2:5162851/1‑150 (MQ=255) aCGATAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAAt < 2:4605482/150‑1 (MQ=255) cGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAAtc < 2:869160/150‑1 (MQ=255) | CCATTTCCATCTCGAGATCAGTACCGGTCAGCGACAACGTACCGTCAGCAACCTGTAACAGCAGATTACCGAGAATCGGTAGCGTAGGACGACCACCTAACGGACCGCTCACCTGTTGTAGCGGTTTTAATAAATGCTCACGTTCTACGGTAAATTTCATAGGTTTACGATGACAATGTTCTGATTAAATTTGAAAAATCTTCTTTGATATCGTGGCTCTCTTCACGCAACTGCTCGATCTTACGGCAGGCATGAAGCACCGTCGTGTGGTCACGGCCACCAAACGCATCGCCAATCT > CP009273/3875522‑3875819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |