| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,247,370 | G→T | 13.8% | D110Y (GAT→TAT) | lexA → | transcriptional repressor of SOS regulon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,247,370 | 0 | G | T | 13.8% | 1087.9 / 93.1 | 342 | D110Y (GAT→TAT) | lexA | transcriptional repressor of SOS regulon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (146/148); new base T (24/24); total (170/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
CCGGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAA > CP009273/4247221‑4247519 | ccGGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTg > 2:1933848/1‑150 (MQ=255) cGGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGa < 1:4933447/150‑1 (MQ=255) cGGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGa < 1:4291326/150‑1 (MQ=255) gcgcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTAtt < 1:1068651/150‑1 (MQ=255) gcgcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGAtt < 2:451500/150‑1 (MQ=255) gcgcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGAtt < 2:2389804/150‑1 (MQ=255) cgcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGAttt < 1:2842255/150‑1 (MQ=255) gcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTc < 2:3204041/150‑1 (MQ=255) gcATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTc < 2:2310821/150‑1 (MQ=255) aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGTAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCct < 1:1856305/150‑1 (MQ=255) aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCCACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCct < 2:5286502/150‑1 (MQ=255) aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCct > 2:3721760/1‑150 (MQ=255) aTCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCct > 2:2177637/1‑150 (MQ=255) aCGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCctgct > 2:833929/1‑150 (MQ=255) gcgGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCtgctgc > 2:4350707/1‑150 (MQ=255) ggATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGcgcg > 1:4734367/1‑150 (MQ=255) ggATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGcgcg > 2:4801761/1‑150 (MQ=255) tGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGa > 2:5086001/1‑150 (MQ=255) tGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGa > 1:2081670/1‑150 (MQ=255) gCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTc < 1:5082187/150‑1 (MQ=255) aggaagaggaagAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCTGCGGGATGTCGa > 2:2755461/1‑150 (MQ=255) aggaagaggaagAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGa > 1:1757004/1‑150 (MQ=255) ggaagaggaagaAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATGATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGAt < 2:405337/150‑1 (MQ=255) aagaggaagaAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGa < 2:2067346/150‑1 (MQ=255) aggaagaAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAg < 2:3866203/150‑1 (MQ=255) aggaagaAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTACTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAg < 1:3635111/150‑1 (MQ=255) gaagaaGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGat < 2:3229930/150‑1 (MQ=255) aagaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAATGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAATACGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGata > 1:1928285/1‑150 (MQ=255) aagaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGata > 1:5322532/1‑150 (MQ=255) aagaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGata > 1:811584/1‑150 (MQ=255) agaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGatat > 2:4646230/1‑150 (MQ=255) agaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGatat < 2:4861706/150‑1 (MQ=255) agaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGatat < 2:2298182/150‑1 (MQ=255) gaagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATc < 1:2835678/150‑1 (MQ=255) aagGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCg < 1:1621200/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCAtt < 2:1097414/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTat < 1:5158695/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTatg < 2:4926193/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGACGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTatggat < 2:4148918/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTatggat > 1:2690543/1‑150 (MQ=255) tGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTatggatg < 2:1135357/150‑1 (MQ=255) tAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTg > 1:1042178/1‑150 (MQ=255) gTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACt < 2:648307/150‑1 (MQ=255) 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aGGTCGATCCGTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTa < 1:353877/150‑1 (MQ=255) gTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTAtt < 1:90934/150‑1 (MQ=255) gTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTAtt > 2:257788/1‑150 (MQ=255) tCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATtg < 1:4090266/150‑1 (MQ=255) cGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATtga > 1:396110/1‑150 (MQ=255) 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tccttATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGaa < 1:49002/150‑1 (MQ=255) ccttATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAg < 2:1049388/150‑1 (MQ=255) ttATTCAAGCCGCATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGtt < 2:5180307/150‑1 (MQ=255) ttATTCAAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGtt > 2:2010437/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCGAATGCTTATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTAcc < 2:4244823/150‑1 (MQ=255) ccGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAg < 2:3375665/150‑1 (MQ=255) ccGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAg < 1:3606307/150‑1 (MQ=255) gAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAgcg > 1:3354713/1‑150 (MQ=255) cTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGa < 1:2177637/150‑1 (MQ=255) tGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGaa > 2:4191206/1‑150 (MQ=255) tGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGaa > 2:2448471/1‑150 (MQ=255) gATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGaaa > 2:4678081/1‑150 (MQ=255) | CCGGCGCATCACGCGGGATTCGTCTGTTGCAGGAAGAGGAAGAAGGGTTGCCGCTGGTAGGTCGTGTGGCTGCCGGTGAACCACTTCTGGCGCAACAGCATATTGAAGGTCATTATCAGGTCGATCCTTCCTTATTCAAGCCGAATGCTGATTTCCTGCTGCGCGTCAGCGGGATGTCGATGAAAGATATCGGCATTATGGATGGTGACTTGCTGGCAGTGCATAAAACTCAGGATGTACGTAACGGTCAGGTCGTTGTCGCACGTATTGATGACGAAGTTACCGTTAAGCGCCTGAAA > CP009273/4247221‑4247519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |