Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,384,268 | C→A | 13.2% | S129* (TCG→TAG) | nnr → | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme; C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,384,268 | 0 | C | A | 13.2% | 1123.4 / 87.6 | 355 | S129* (TCG→TAG) | nnr | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme; C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (162/145); new base A (23/25); total (185/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
CGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTGCTGGCTGAAACTGGCG > CP009273/4384119‑4384417 | gcgcgACTGGCCACAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCg < 1:4143958/150‑1 (MQ=255) gcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGt > 1:736120/1‑150 (MQ=255) gcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGt > 2:590/1‑150 (MQ=255) gACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAg < 2:4962479/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGa > 1:3460338/1‑150 (MQ=255) tGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATc < 2:2127211/150‑1 (MQ=255) ggCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCt < 1:5237360/150‑1 (MQ=255) gCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTg < 2:2029691/150‑1 (MQ=255) ccAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGa > 2:2811404/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAt < 2:3332835/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGTCTGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAtt < 1:3785737/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAtt > 1:2030619/1‑150 (MQ=255) aaaGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAtt > 1:3889365/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAttg < 2:2296507/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAttg < 2:5106361/150‑1 (MQ=255) aGCGGTCTGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAttgt < 1:4283986/150‑1 (MQ=255) aGCGGTCGGCANTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAttgt > 1:2758658/1‑150 (MQ=255) gTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACACACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGAt < 2:1774266/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATgc < 2:3601304/150‑1 (MQ=255) ggCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTTGATCTGATTGTTGATgcg < 2:1442600/150‑1 (MQ=255) cATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgct > 2:3907846/1‑150 (MQ=255) cATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgct < 1:1136669/150‑1 (MQ=255) aTTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATCTTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgctg > 2:2773080/1‑150 (MQ=255) aTTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgctg > 1:1022221/1‑150 (MQ=255) tGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgctgct < 1:3551823/150‑1 (MQ=255) gAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTc > 2:1118983/1‑150 (MQ=255) gAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTc < 2:930927/150‑1 (MQ=255) aGGTCACGGTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGGTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCg < 2:904876/150‑1 (MQ=255) gTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGt > 2:1075220/1‑150 (MQ=255) gTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGt < 2:4236448/150‑1 (MQ=255) cACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTAc < 1:4850655/150‑1 (MQ=255) gttgttGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCgg > 1:896916/1‑150 (MQ=255) ttgttgGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGt < 1:1502042/150‑1 (MQ=255) tgttgGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGtt < 2:858486/150‑1 (MQ=255) gttgGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGttt < 1:5311560/150‑1 (MQ=255) ggCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCg < 1:4464701/150‑1 (MQ=255) cccAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGc > 2:5146139/1‑150 (MQ=255) cccAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGc > 1:5164931/1‑150 (MQ=255) ccAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCa < 1:4337286/150‑1 (MQ=255) cAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCaa > 2:2135859/1‑150 (MQ=255) aGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCTGTTTGCGGCAAg > 2:1283779/1‑150 (MQ=255) aGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAg > 2:4369489/1‑150 (MQ=255) ggAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTCCCGGTTTGCGGCAAgc > 2:1942256/1‑150 (MQ=255) agagCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAgcgc > 1:437294/1‑150 (MQ=255) agCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGccc > 1:2958874/1‑150 (MQ=255) cGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCcg > 2:3534468/1‑150 (MQ=255) aaaCCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGaa > 2:5013625/1‑150 (MQ=255) ccGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATcc < 2:2057782/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATcc < 1:4193953/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCAt < 2:3211960/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCAtt < 1:2585922/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCGGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCAtt < 1:3073253/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTa < 2:5222383/150‑1 (MQ=255) cGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGcc > 2:3458565/1‑150 (MQ=255) ggAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCa > 1:2405881/1‑150 (MQ=255) gagGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAAGAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGCTa > 2:3024739/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACTCGGGTGGAGAGTTCCATGCTTCGAATATTGTCTTGCCCTAATCGTTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCTGCAAGCGCCCCTCGAATCCATTAGCCAGTTATTc < 2:1173750/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCg < 1:1706135/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 2:232789/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCACGCGACGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAcc < 2:3684422/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAcc < 1:1625404/150‑1 (MQ=255) gcTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCa > 2:4854097/1‑150 (MQ=255) tGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACg > 2:4931813/1‑150 (MQ=255) tGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACg > 2:3755570/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAAtt < 2:724845/150‑1 (MQ=255) gcgAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAAtt < 2:193442/150‑1 (MQ=255) aaGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTccc > 2:4621939/1‑150 (MQ=255) aGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCa > 1:64737/1‑150 (MQ=255) gCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCAt < 2:1362421/150‑1 (MQ=255) gCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCAt < 1:2166308/150‑1 (MQ=255) tGGTTACACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCt < 2:2695735/150‑1 (MQ=255) aCGCGGGTGACGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGa < 1:4570007/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAGATCCATGCTTCGAATAGTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATtgtg < 2:2230942/150‑1 (MQ=255) cNAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCACGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCNANTNTGNCGGt > 1:1843041/1‑150 (MQ=255) cGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGt > 1:373688/1‑150 (MQ=255) gagaTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGtt < 2:855796/150‑1 (MQ=255) gagaTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGtt > 2:4064209/1‑150 (MQ=255) gaTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGa > 2:2630849/1‑150 (MQ=255) aTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGat < 1:2444171/150‑1 (MQ=255) aTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGat > 1:4829619/1‑150 (MQ=255) aTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGat > 2:3402861/1‑150 (MQ=255) aTCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGTGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGat < 1:826665/150‑1 (MQ=255) cATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATc > 1:3574948/1‑150 (MQ=255) cATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATc > 1:4647670/1‑150 (MQ=255) aTGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATcc > 1:4931017/1‑150 (MQ=255) tGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATccc > 2:2431206/1‑150 (MQ=255) cTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCtt > 2:1418103/1‑150 (MQ=255) tCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTcc < 2:2879963/150‑1 (MQ=255) cGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCTACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCg > 2:3850253/1‑150 (MQ=255) gAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGATGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCgg > 2:39737/1‑150 (MQ=255) atatTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGcc > 1:2242563/1‑150 (MQ=255) atatTGTCTGGCCCGAATCGGTAGAACTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATAGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGcc > 1:3146262/1‑150 (MQ=255) tatTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCct < 1:507246/150‑1 (MQ=255) tGTCTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCctgct < 2:3251544/150‑1 (MQ=255) tGTCTGGCCCGAAGCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTGGGCGGCAAGCGCCCCGCGAAGCCCTTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCctgct < 2:416543/150‑1 (MQ=255) gggCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGCTGCGCTGCTCGGTACCGGTGGGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTgctggct < 1:1374224/149‑1 (MQ=255) gAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTGCTGGCTGAAACt > 1:4013568/1‑150 (MQ=255) aaTAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTGCTGGCTGAAACTg > 1:2703408/1‑150 (MQ=255) cGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTGCTGGCTGAAACTGgcg > 2:4725074/1‑150 (MQ=255) cGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTGCTGGCTGAAACTGgcg < 1:3227769/150‑1 (MQ=255) | CGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTGTTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACGCGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGTCTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATATCCCTTCCGGCCTGCTGGCTGAAACTGGCG > CP009273/4384119‑4384417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |