Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,456,233 | G→T | 100% | I277I (ATC→ATA) | treR ← | trehalose 6‑phosphate‑inducible trehalose regulon transcriptional repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,456,233 | 0 | G | T | 99.3% | 964.4 / ‑2.2 | 303 | I277I (ATC→ATA) | treR | trehalose 6‑phosphate‑inducible trehalose regulon transcriptional repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (140/161); total (140/163) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
GAAGATCACAATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACGATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAGTGCCAGCGTGTCGGTTGCGCACAGTAAGGCGGTAGTTTCAGGCGTAAT > CP009273/4456086‑4456379 | gAAGATCACAATTTATCGTTCAGGAATCGATCAGGACAGGGTGGCGGGGAGGATGATTTGTTGCGGGTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTAt < 2:1422279/150‑1 (MQ=255) gAAGATCACAATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTAt < 2:2275563/150‑1 (MQ=255) aGATCACAATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTAtct > 1:4567291/1‑150 (MQ=255) gATCACAATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTAtctc > 1:1380071/1‑150 (MQ=255) aTCACAATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTcc < 1:2015744/150‑1 (MQ=255) acaATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGa < 2:4583123/150‑1 (MQ=255) caATTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGAt < 1:4412713/150‑1 (MQ=255) aaTTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATg < 2:154654/150‑1 (MQ=255) aaTTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATg < 2:473277/150‑1 (MQ=255) aaTTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATg < 2:3096941/150‑1 (MQ=255) aTTTATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATgg > 1:2634246/1‑150 (MQ=255) gtgaTCGTTCAGGAATCGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGGTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATgga < 2:5063645/147‑1 (MQ=255) ttATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATggag < 2:62083/150‑1 (MQ=255) ttATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATggag < 1:5061686/150‑1 (MQ=255) tATCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATggagg > 2:2176273/1‑150 (MQ=255) aTCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGCTggagga > 2:4622390/1‑150 (MQ=255) tCGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGaa > 2:1260118/1‑150 (MQ=255) cGTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAAt > 2:1524065/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGCTTGGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTGACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAAtt < 2:1604014/150‑1 (MQ=255) ttCAGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAAttt > 2:4238182/1‑150 (MQ=255) gtCAGGAACCGATCAGGCCCGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGGTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAAttt < 1:1494100/149‑1 (MQ=255) aGGAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCAt < 2:3340966/150‑1 (MQ=255) gAAACGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGGTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTa < 1:4933476/150‑1 (MQ=255) aaCGATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAAc < 1:3386861/150‑1 (MQ=255) gATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGc > 2:563548/1‑150 (MQ=255) gATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGc > 2:4167799/1‑150 (MQ=255) gATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGc > 2:1742807/1‑150 (MQ=255) gATCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGc > 2:4035273/1‑150 (MQ=255) tCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGt > 1:3010492/1‑150 (MQ=255) tCAGGACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGGTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGt < 2:341319/150‑1 (MQ=255) aGGACCGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGGTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTAt < 2:4810663/150‑1 (MQ=255) gACAGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTa > 1:4258865/1‑150 (MQ=255) cAGGGGGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACGATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTAcc < 1:4965264/150‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCg < 2:1154028/150‑1 (MQ=255) aGGGGGGCGGGGATGATGATTTGGGGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCg < 2:2962925/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGc > 2:2692458/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGc > 1:4784288/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGc > 2:1208450/1‑150 (MQ=255) ggCGGGGTTGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCt < 1:9625/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCt < 2:1117746/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACGATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCt < 2:5278687/150‑1 (MQ=255) ggggATGATGATTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGc > 1:900554/1‑150 (MQ=255) gggATGATGATTAGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGcc > 2:2865738/1‑150 (MQ=255) atgatgatTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGt > 1:246721/1‑150 (MQ=255) gatgatTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTg > 2:5196297/1‑150 (MQ=255) gatgatTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTg < 1:288390/150‑1 (MQ=255) tgatTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCa > 2:3431173/1‑150 (MQ=255) atTTGTTGCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAg < 1:133911/150‑1 (MQ=255) ttgttgCGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGgt < 2:3924764/150‑1 (MQ=255) cGGTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGAt < 1:3469023/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATg > 2:2627501/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCGCCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCg > 1:727667/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCGCCCGGGTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCg < 2:2093939/150‑1 (MQ=255) gcCCGGTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCtt < 1:4238182/150‑1 (MQ=255) ggTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAg > 1:2283247/1‑150 (MQ=255) ggTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAg > 1:1002352/1‑150 (MQ=255) gTTACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAgg < 1:3539995/150‑1 (MQ=255) tACCTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTTTTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTa < 2:2797464/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTAtt > 2:2396139/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCGTGCAGGTAttt < 2:635112/150‑1 (MQ=255) tGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTCTCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTa > 2:1912783/1‑150 (MQ=255) tGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTa > 1:2720426/1‑150 (MQ=255) tGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTa > 2:2649062/1‑150 (MQ=255) tGCGCGATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTa > 2:3188674/1‑150 (MQ=255) cgcgATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGGTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACt < 2:5287775/150‑1 (MQ=255) cgATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTg < 1:4668988/150‑1 (MQ=255) gATCAACTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTgc < 1:3202916/150‑1 (MQ=255) cTGGCAAGCCGCCTGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAg < 2:2132241/150‑1 (MQ=255) 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tGGCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAGTGCCAGCGTGTCg > 2:4843888/1‑150 (MQ=255) gCGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAGTGCCAGCGTGTCGGt < 2:1870108/150‑1 (MQ=255) cGTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAGTGCCAGCGTGTCGGtt < 1:4192608/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAGTGCCAGCGTGTCGGTTg > 1:5288346/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTCGGCGTAACCGGGATCTACGGTTACTATCTCCGGATGGAGGAATTTCATTAACGGCGTATTACCGACGCTCGCCAGTTGCAAGGTGTCGATGCGTTGCTCTTGCAGGTATTTACTTGCGCCAAGTGCCAGCGTGTCGGTTgcg < 1:2367233/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |