| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,465,936 | T→A | 100% | L228* (TTA→TAA) | yjgL → | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,465,936 | 0 | T | A | 97.2% | 1350.6 / 16.0 | 420 | L228* (TTA→TAA) | yjgL | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/8); new base A (226/181); total (231/189) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
ACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTAT > CP009273/4465789‑4466082 | cAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTaaaa < 1:2434364/150‑1 (MQ=255) aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAAt > 1:1811770/1‑150 (MQ=255) aGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATg < 2:2820025/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGAt < 2:1481081/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGAt < 2:1422604/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGAt > 1:3624652/1‑150 (MQ=255) aTAGCGCGTATATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtct < 2:236013/150‑1 (MQ=255) aTAGCGAGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtct < 2:4950401/150‑1 (MQ=255) tAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtctc > 2:82893/1‑150 (MQ=255) tAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtctc < 1:1419866/150‑1 (MQ=255) tAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATtctc > 2:2951520/1‑150 (MQ=255) gcgcGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAg < 2:2674745/150‑1 (MQ=255) cgcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAgg > 2:3401765/1‑150 (MQ=255) cgcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAgg < 1:2175259/150‑1 (MQ=255) cgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACATAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAg < 1:119785/150‑1 (MQ=255) cgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAg < 1:104137/150‑1 (MQ=255) tCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGtt < 2:2448550/150‑1 (MQ=255) cTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTa > 2:593144/1‑150 (MQ=255) cTATTAAACAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTa > 1:1651769/1‑150 (MQ=255) tATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTaa > 2:1306670/1‑150 (MQ=255) aTTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTaaa > 1:990730/1‑150 (MQ=255) tAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATa < 1:4016340/150‑1 (MQ=255) tAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATa < 2:5066175/150‑1 (MQ=255) aaaTAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATaa > 1:5075874/1‑150 (MQ=255) aaaTAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATaa < 1:496801/150‑1 (MQ=255) aataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAAc > 1:4198126/1‑150 (MQ=255) ataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt < 2:1364119/150‑1 (MQ=255) ataatCAGGAGTTAAATAATCAACAGTAATTAAATAAAGTACAGTAGAGATATAATCTTGTGTTGTTATATAATATAAAGGGTTTATTTAATGAACAGGAGTTAAATGATGAGCTGAGTGAAAATGATTATCTGGTTTTAAATataacta > 2:4050807/1‑144 (MQ=255) tCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGa < 1:695839/150‑1 (MQ=255) cAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGaa > 1:561459/1‑150 (MQ=255) ggAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAtt < 1:1685256/150‑1 (MQ=255) aGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaa > 1:3115486/1‑150 (MQ=255) aGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaa > 2:4660604/1‑150 (MQ=255) ttAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt < 1:5061373/150‑1 (MQ=255) ttAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt < 2:2113614/150‑1 (MQ=255) aaaTAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg < 1:2795091/150‑1 (MQ=255) taatCTAAAGAAATTAAATAATCTACAGAATTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGTGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGTAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTcc < 2:3132826/150‑1 (MQ=255) aatCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCca > 2:2012163/1‑150 (MQ=255) aatCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCca < 1:2883996/150‑1 (MQ=255) atCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcac > 1:3359737/1‑150 (MQ=255) cTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg > 2:3764528/1‑150 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAATTGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAgg > 2:2921964/1‑150 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAgg < 1:1450319/150‑1 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAgg < 2:4157617/150‑1 (MQ=255) aGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCATGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCGACAGGAGt > 2:4783801/1‑150 (MQ=255) aGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGt > 1:4066256/1‑150 (MQ=255) aGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGt > 1:194515/1‑150 (MQ=255) aaaTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCATGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTa < 2:5256211/150‑1 (MQ=255) aaaTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTa > 2:2314485/1‑150 (MQ=255) aTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaaa > 1:461767/1‑150 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg > 1:4888238/1‑150 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg < 2:4656261/150‑1 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg < 1:1133155/150‑1 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg < 1:102372/150‑1 (MQ=255) aataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATgtt > 2:3262357/1‑148 (MQ=255) taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 2:3468245/150‑1 (MQ=255) aatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg > 2:3924019/1‑150 (MQ=255) aatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg < 2:4410834/150‑1 (MQ=255) atCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGc < 2:4415584/150‑1 (MQ=255) atCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGc < 2:5272365/150‑1 (MQ=255) cTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAg > 1:899154/1‑150 (MQ=255) cTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAg < 1:3413264/150‑1 (MQ=255) aaaGAAGTTAAATAATCTAATTAATTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATTACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGa < 1:2954543/148‑1 (MQ=255) aGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGt < 2:1772039/150‑1 (MQ=255) aaGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTa > 2:4309892/1‑150 (MQ=255) aaGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTa > 1:1923795/1‑150 (MQ=255) aGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaa > 1:2049130/1‑150 (MQ=255) ttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaat > 1:2643005/1‑150 (MQ=255) ttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaat < 1:82893/150‑1 (MQ=255) aataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaataat > 2:3542289/1‑150 (MQ=255) taatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtc > 2:692287/1‑150 (MQ=255) cTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAg < 1:4711406/150‑1 (MQ=255) aCTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGa > 2:4385543/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGa > 1:596957/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACt < 2:1921747/150‑1 (MQ=255) gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACtt > 1:3691062/1‑150 (MQ=255) aaGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa > 1:3836504/1‑150 (MQ=255) aataTANAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAActct > 1:4407804/1‑150 (MQ=255) aataTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAActct > 2:724569/1‑150 (MQ=255) ataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAg > 1:128767/1‑150 (MQ=255) cAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTg < 1:1548093/150‑1 (MQ=255) cAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTg < 1:5266372/150‑1 (MQ=255) ttAAATACTCCTCAGGAGTTCAATACTCCGNAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGt < 2:4576239/150‑1 (MQ=255) tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTa < 2:2252003/150‑1 (MQ=255) aaaTAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTAc > 2:2061742/1‑150 (MQ=255) atCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGttt > 2:3083705/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCa < 2:2597853/150‑1 (MQ=255) ccTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCa < 1:2253158/150‑1 (MQ=255) aGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTg < 2:3624652/150‑1 (MQ=255) aGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTg > 1:1619323/1‑150 (MQ=255) gAGTTAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGAt < 2:1055014/150‑1 (MQ=255) ttAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCt > 1:2355780/1‑150 (MQ=255) tAAATAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTa < 2:1703113/150‑1 (MQ=255) aaaTAATCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTAc > 1:728423/1‑150 (MQ=255) aatCCGCAGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGAtt < 1:3241438/150‑1 (MQ=255) atCCGCAGAATTAAAATAATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTa > 2:5137818/1‑150 (MQ=255) gaaGAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGTTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACggg < 1:4278825/148‑1 (MQ=255) cAGAATTTAAATGAGTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGt < 2:1144687/150‑1 (MQ=255) gAATTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGttt < 1:1884614/150‑1 (MQ=255) aTTAAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTttat < 1:3770197/150‑1 (MQ=255) | ACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTAT > CP009273/4465789‑4466082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |