Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 364,561 | G→T | 100% | D18Y (GAC→TAC) | mhpB → | 2,3‑dihydroxyphenylpropionate 1,2‑dioxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 364,561 | 0 | G | T | 99.6% | 896.0 / ‑4.5 | 292 | D18Y (GAC→TAC) | mhpB | 2,3‑dihydroxyphenylpropionate 1,2‑dioxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (152/137); total (153/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
TTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGT > CP009273/364414‑364707 | cAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGgc > 1:3188836/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGgcg < 1:4771373/150‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGgcg > 2:1968640/1‑150 (MQ=255) gCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTg < 1:1429741/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTg < 1:2128413/150‑1 (MQ=255) cccTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGAt > 2:3251303/1‑150 (MQ=255) ccTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATg > 2:4651590/1‑150 (MQ=255) cTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGa > 1:2427891/1‑150 (MQ=255) cTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGa < 1:1910705/150‑1 (MQ=255) aaTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGt > 1:4636496/1‑150 (MQ=255) aaTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGt > 1:607221/1‑150 (MQ=255) aTAATCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGTCGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTc < 1:2795373/150‑1 (MQ=255) aTAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCACGAGGTGCTCGATGAGGTc > 1:3776795/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAAt > 1:2286072/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAAt < 1:255591/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATg < 2:3833407/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATg < 1:1128212/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATg < 2:901644/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATgg > 2:2931359/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATgg < 2:2593622/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCg > 2:2703375/1‑150 (MQ=255) gatgaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTGTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCGCGATGAGGTCAATGGCGTGGTTGCCa < 2:379658/150‑1 (MQ=255) gaCGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAgcg > 2:1071722/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGccc > 2:4479296/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGccc > 1:3065493/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGccc > 2:4837927/1‑150 (MQ=255) cccGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAg < 1:4067468/150‑1 (MQ=255) cGCCCTGATGCCGACGTGTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCg < 1:1852492/150‑1 (MQ=255) gCCCTGATGCCGACGTTTCTGAAGAAAAGGTAGCCTGAAATCCAAGCTTATCTTCACTGTCTTTACCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTTCTCTATGAGGTCAATGGCGTGAATGACAGCGCCCGCGAGCGt > 2:1256213/1‑150 (MQ=255) ccTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTAt < 2:2174979/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTAt > 1:861323/1‑150 (MQ=255) cTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTAtt > 1:2180541/1‑150 (MQ=255) gATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGc > 1:4680746/1‑150 (MQ=255) cGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAt > 1:727271/1‑150 (MQ=255) gACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAtt > 2:4936286/1‑150 (MQ=255) attCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGAGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGAATTGCGGCAATCTcc > 2:1661639/2‑150 (MQ=255) tGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTg > 2:5065461/1‑150 (MQ=255) tGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTg < 1:1259446/150‑1 (MQ=255) tGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTg < 1:3899352/150‑1 (MQ=255) cGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAGTCTCCCCTGAAc > 1:3686311/1‑150 (MQ=255) gAATAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACt < 2:2047899/150‑1 (MQ=255) aaaGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtgg > 1:3642994/1‑150 (MQ=255) aaGGTAGCCTTATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtggt > 2:1757206/1‑150 (MQ=255) aGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCAACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGAGAGATAGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtggtg > 2:1166372/1‑150 (MQ=255) ggTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACtggtgg > 1:3514091/1‑150 (MQ=255) gTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTggtggt < 2:2999681/150‑1 (MQ=255) aGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc > 2:1412085/1‑150 (MQ=255) aGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGc < 1:4030716/150‑1 (MQ=255) gCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCt < 2:420645/150‑1 (MQ=255) ccTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTg < 2:2417191/150‑1 (MQ=255) gATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGttt > 1:2647224/1‑150 (MQ=255) gATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGttt > 2:5001444/1‑150 (MQ=255) atatGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTg > 1:1999072/1‑150 (MQ=255) atatGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTg > 1:4653945/1‑150 (MQ=255) atGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgcg > 1:4198314/1‑150 (MQ=255) tGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTgcgc < 2:3917894/150‑1 (MQ=255) gCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGcc > 2:3421925/1‑150 (MQ=255) cACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCa < 1:4570460/150‑1 (MQ=255) gCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGAt > 1:3601375/1‑150 (MQ=255) cTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATc > 1:4495247/1‑150 (MQ=255) cTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCAATCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATc > 2:948455/1‑150 (MQ=255) ttATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCa > 1:588884/1‑150 (MQ=255) aTCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACt > 1:3152406/1‑150 (MQ=255) aTCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCACCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACt < 1:547285/150‑1 (MQ=255) cTTCTCTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTTGGTCTTCCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTTATCTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCAATAc < 2:4029796/150‑1 (MQ=255) cACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAAc > 1:1563093/1‑150 (MQ=255) cACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAAc > 1:4879416/1‑150 (MQ=255) cACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGAGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGTTTCTGTTTGAGCCAGATCACTACAAc > 1:1017968/1‑150 (MQ=255) aCTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACg < 2:4877565/150‑1 (MQ=255) aCTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACg > 1:4480934/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCt > 1:739889/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCt > 1:5284131/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCt > 1:5190352/1‑150 (MQ=255) cTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttt < 1:3359824/150‑1 (MQ=255) cTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttt > 1:3628497/1‑150 (MQ=255) ttCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttttt < 1:952252/150‑1 (MQ=255) ttCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAAAGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCttttt > 1:4401052/1‑150 (MQ=255) cACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTAt > 1:992695/1‑150 (MQ=255) 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cTGGTGGGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATg < 1:640967/150‑1 (MQ=255) tggtggGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGc < 1:1693714/150‑1 (MQ=255) gtggGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAAGGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCa < 2:3526906/150‑1 (MQ=255) tggGGTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCAGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCACCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATTCCAc > 1:5074412/1‑150 (MQ=255) ggggTATGTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACTGCTTTTTCTATGACGTGATGCCAcc > 2:282238/1‑150 (MQ=255) 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gTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCACTGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGt < 2:764143/150‑1 (MQ=255) gTCTACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGt > 2:1872920/1‑150 (MQ=255) | TTCCGCAAACCCTGGGCAAGACCCTGAATAAACTGGCGTCGGTGATGACGCTGACCCGCCCTGATGCCGACGTTTCTGTCGAAAAGGTAGCCTGATATGCACGCTTATCTTCACTGTCTTTCCCACTCGCCGCTGGTGGGGTATGTCGACCCGGCGCAAGAGGTGCTCGATGAGGTCAATGGCGTGATTGCCAGCGCCCGCGAGCGTATTGCGGCATTCTCCCCTGAACTGGTGGTGCTGTTTGCGCCAGATCACTACAACGGCTTTTTCTATGACGTGATGCCACCGTTCTGT > CP009273/364414‑364707 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |