| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 412,004 | A→T | 5.5% | R135R (CGT→CGA) | sbcD ← | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 412,004 | 0 | A | T | 5.5% | 965.2 / 31.9 | 316 | R135R (CGT→CGA) | sbcD | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (170/127); new base T (8/10); total (178/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
AAATGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGCGTGGCGACCGA > CP009273/411855‑412153 | aaaTGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCa < 2:2867187/150‑1 (MQ=255) aaTGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATATTCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCAc < 1:1527871/150‑1 (MQ=255) aaTGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCAc < 1:4032779/150‑1 (MQ=255) aaTGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCAAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCTTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCAc > 2:459401/1‑150 (MQ=255) aTGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCAcg < 2:4094432/150‑1 (MQ=255) gTCCCGTGGCGGTGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCTCCTGGCTGGTAATAATGTCAcgcg > 2:4786982/1‑150 (MQ=255) tCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCgg < 2:1488612/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTa < 2:3841260/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTa < 1:1987007/150‑1 (MQ=255) gCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTaaa < 1:1108444/150‑1 (MQ=255) gatgatGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTaaaaa < 1:1004957/150‑1 (MQ=255) gatgatGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTaaaaa > 1:2100606/1‑150 (MQ=255) gatgatGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTaaaaa > 1:4332642/1‑150 (MQ=255) atgatgGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAAc < 2:4965433/150‑1 (MQ=255) atgatgGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAAc < 1:3899486/150‑1 (MQ=255) tgatgGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACg < 1:4354768/150‑1 (MQ=255) tgGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGaa < 1:658337/150‑1 (MQ=255) tgGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGaa < 1:2797710/150‑1 (MQ=255) tgGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATAGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATTCCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGaa > 1:2655605/1‑150 (MQ=255) gggCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACATAAAAACGGAAt > 1:2039127/1‑150 (MQ=255) gCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCAGAGTGTGGGTGGTCATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATgg > 2:2496066/1‑150 (MQ=255) agagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATgggg > 1:1466358/1‑150 (MQ=255) agagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATgggg > 2:5084029/1‑150 (MQ=255) agagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATgggg > 1:516117/1‑150 (MQ=255) agagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATgggg > 1:3595820/1‑150 (MQ=255) agagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATgggg < 2:3646711/150‑1 (MQ=255) gagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGc < 2:612359/150‑1 (MQ=255) gagGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGc > 2:558151/1‑150 (MQ=255) agGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGca < 1:3204894/150‑1 (MQ=255) ggCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCTCGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGcac < 2:2373586/150‑1 (MQ=255) cTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAg < 1:3045566/150‑1 (MQ=255) cTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAg > 2:4303911/1‑150 (MQ=255) tGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGc < 1:3414777/150‑1 (MQ=255) cgccgcGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTg > 2:1840212/1‑150 (MQ=255) ccgcGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTTTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTgcg < 2:3404/150‑1 (MQ=255) ccgcGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTgcg < 1:1576509/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGcc < 1:689027/150‑1 (MQ=255) cAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCg > 2:3196590/1‑150 (MQ=255) aGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGt > 2:3338785/1‑150 (MQ=255) ggCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGACTGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTc > 1:4358748/1‑150 (MQ=255) ggCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTc > 1:3653684/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTCTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTcg > 2:1114798/1‑150 (MQ=255) aGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCa > 1:4677974/1‑150 (MQ=255) tgttgtTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAg > 2:3795259/1‑150 (MQ=255) ttgttgGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGAt < 1:891701/150‑1 (MQ=255) gttgGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGAttt < 1:4104639/150‑1 (MQ=255) gttgGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGAttt > 1:5224051/1‑150 (MQ=255) ggTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTgcg > 2:858278/1‑150 (MQ=255) gTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTgcgg > 2:2588190/1‑150 (MQ=255) gTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTgcgg > 1:3847062/1‑150 (MQ=255) gTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTgcgg > 1:610034/1‑150 (MQ=255) taataaTCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTgcggc > 1:1397686/1‑150 (MQ=255) taataaTCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAAGACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTgcggc < 2:4875287/150‑1 (MQ=255) aaatCGGTAAACTCTTCCAGAAAAAGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAATCCCCTCCGGGCTGGTAAAAATGACACGCGGACGAAAAAACGGAATGGGTCACAGCACTTCGACTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCa > 2:1342706/2‑150 (MQ=255) aatCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCAt < 2:2901075/150‑1 (MQ=255) atCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATg > 1:4291735/1‑150 (MQ=255) ggTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTcc < 2:2305503/150‑1 (MQ=255) cGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCt > 1:1072257/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTg > 1:2400628/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTg > 2:4279013/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTgg > 1:5127319/1‑150 (MQ=255) tGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGc > 1:4190097/1‑150 (MQ=255) cAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGAc > 2:5199505/1‑150 (MQ=255) cAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGAc < 1:5075042/150‑1 (MQ=255) aGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGAcc > 1:758829/1‑150 (MQ=255) aGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCAGGTCCGGCGCTGGCGAcc > 2:1734009/1‑150 (MQ=255) gTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCa < 1:1797382/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTCAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGgt < 2:4945105/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCTCGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGgt > 1:4480606/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCTGTTTTTCAAGACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGgt < 2:5275975/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGgtagt < 2:157337/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGgtagt > 1:2749923/1‑150 (MQ=255) ctgTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCTCGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTAtt < 1:1204917/150‑1 (MQ=255) ctgTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTAtt > 1:2219447/1‑150 (MQ=255) cAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACg > 1:4414570/1‑150 (MQ=255) aTACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGcc > 1:2554978/1‑150 (MQ=255) ccGTTAAGCCCCGCCTGGCGGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCCAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGACCGCCATg > 2:3295039/1‑150 (MQ=255) cGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGa < 1:1270006/150‑1 (MQ=255) gTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGat > 2:835148/1‑150 (MQ=255) gTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCATCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGat > 2:693472/1‑150 (MQ=255) ttAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCTCGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCTCGGTAGTATTGAGGAACGCCATGata < 1:3482243/150‑1 (MQ=255) tAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGatat < 2:2704530/150‑1 (MQ=255) tAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGatat < 2:5112441/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATc < 1:1610458/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATc > 2:2418490/1‑150 (MQ=255) aGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTTGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATcg < 1:4843171/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGTAATAATGTCTCGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGatt > 1:2520707/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTGGTAATAATGTCTCGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGatt > 1:5165079/1‑150 (MQ=255) tggccggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGattca < 2:3229048/150‑1 (MQ=255) ggctggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGattcat < 1:4955515/150‑1 (MQ=255) ggctggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGattcat < 2:2100606/150‑1 (MQ=255) ggctggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGattcat < 1:558151/150‑1 (MQ=255) gctggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGattcatt > 2:5235633/1‑150 (MQ=255) ctggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGattcattc < 1:1754930/150‑1 (MQ=255) ggTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAg > 1:995747/1‑150 (MQ=255) gTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGc < 1:4547551/150‑1 (MQ=255) aataatGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGGAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGCGt > 2:3391482/1‑150 (MQ=255) ataatGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGAACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGCGTg > 1:1914161/1‑150 (MQ=255) taatGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGCGTgg > 2:3067667/1‑150 (MQ=255) aatGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGCGTGGc > 1:3125004/1‑150 (MQ=255) | AAATGTCCCGTGGCGATGATGGGCAGAGGCTGATCGCCGCGCAGTTTGCAGGCATCGGCATAGTGTTGTTGGTAATAATCGGTAATCGCTGCCAGTAAATGCTGCTGTTTTTCAATACCGTTAAGCCCCGCCTGGCTGGTAATAATGTCACGCGGACGTAAAAACGGAATGGGGCACAGCACTGCGCCTGGCGTCCCGTCGCGACGAGGCAAGATTTGCGGCGCATGTCCGGCGCTGGCGACCACGGTAGTATTGAGGAACGCCATGATATCGCGCGATTCATTCAGCGTGGCGACCGA > CP009273/411855‑412153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |