| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 424,393 | G→T | 5.7% | A431S (GCG→TCG) | secD → | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 424,393 | 0 | G | T | 5.7% | 1373.7 / 29.3 | 365 | A431S (GCG→TCG) | secD | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (165/179); new base T (10/11); total (175/190) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
GGTCGTGCGGTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCG > CP009273/424246‑424539 | ggTCGTGCGGTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATcgcg > 2:3026109/1‑150 (MQ=255) gCGGTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGAtt > 2:2792647/1‑150 (MQ=255) cGGTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTc > 1:2363796/1‑150 (MQ=255) ggTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCa > 1:2146385/1‑150 (MQ=255) ggTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCa > 2:4898828/1‑150 (MQ=255) tCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGAt < 2:181150/150‑1 (MQ=255) ggTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGAttgt > 2:3198268/1‑150 (MQ=255) gAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTga < 2:4055009/150‑1 (MQ=255) gAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTga < 2:3612083/150‑1 (MQ=255) aaaCAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTgaa > 2:5000506/1‑150 (MQ=255) aaCAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTgaag < 1:1011368/150‑1 (MQ=255) aaCAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTgaag > 1:5310526/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAAc > 2:3778549/1‑150 (MQ=255) ggAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACg < 1:633731/150‑1 (MQ=255) gAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGt > 1:372988/1‑150 (MQ=255) gAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGt < 2:1546215/150‑1 (MQ=255) agagGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTAc > 1:4113575/1‑150 (MQ=255) agagGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTAc > 2:1568086/1‑150 (MQ=255) agGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCa > 1:3718711/1‑150 (MQ=255) gATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTgg > 1:3238528/1‑150 (MQ=255) gATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGAGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTgg < 1:559564/150‑1 (MQ=255) aTTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGc < 2:2197502/150‑1 (MQ=255) aTTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGc > 2:650827/1‑150 (MQ=255) tAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGccc < 2:2873480/150‑1 (MQ=255) tAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGccc > 2:2223118/1‑150 (MQ=255) aaCATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTCCCATTGGCCCa < 1:2731198/150‑1 (MQ=255) aaCATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCa < 1:5271031/150‑1 (MQ=255) aCATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCaa > 2:781554/1‑150 (MQ=255) aCATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCaa > 1:3342262/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAAcc > 2:3723598/1‑150 (MQ=255) gCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTg > 1:3138206/1‑150 (MQ=255) aCATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTa > 1:4047923/1‑150 (MQ=255) aCAGCCAGTCTCGTCTGGGT‑ACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTAt < 2:4202379/150‑1 (MQ=255) cATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTAt > 1:1967808/1‑150 (MQ=255) cATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTAt > 1:2932221/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATg < 2:4418016/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATg < 1:3940058/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATg < 1:2208310/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGACAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCGGGGAATg > 1:2941212/1‑150 (MQ=255) ccAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCa > 2:4541894/1‑150 (MQ=255) ccAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCa > 2:4103122/1‑150 (MQ=255) gTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGaa < 2:3095379/150‑1 (MQ=255) gTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTg < 1:880682/150‑1 (MQ=255) tGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAAc < 1:3843069/150‑1 (MQ=255) ggTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAg < 2:5046614/150‑1 (MQ=255) tAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAggg < 2:1290977/150‑1 (MQ=255) gCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCGGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTgg > 1:1514331/1‑150 (MQ=255) cTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGa < 1:257609/150‑1 (MQ=255) ttCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAg < 1:3521892/150‑1 (MQ=255) cGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGct < 2:2471258/150‑1 (MQ=255) cGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGct < 1:5000506/150‑1 (MQ=255) gTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCTCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGctt > 2:1176088/1‑150 (MQ=255) gTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGctt < 2:2410191/150‑1 (MQ=255) gTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGctt > 1:5080125/1‑150 (MQ=255) gTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGctt < 1:201685/150‑1 (MQ=255) aTCACCGGCTTCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgc > 2:700319/1‑150 (MQ=255) aTCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgc > 1:4818714/1‑150 (MQ=255) cACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgcct < 2:5156463/150‑1 (MQ=255) aCCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCTCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgcctt > 2:349866/1‑150 (MQ=255) aCCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgcctt < 2:1395878/150‑1 (MQ=255) aCCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgcctt < 2:3156347/150‑1 (MQ=255) aCCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgcctt < 1:1858537/150‑1 (MQ=255) aCCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCGGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgcctt < 2:4721027/150‑1 (MQ=255) ccGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCTCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGcttgccttg < 2:1473112/150‑1 (MQ=255) ggCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCttgccttgcc > 2:4344743/1‑150 (MQ=255) ggCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCttgccttgcc < 2:3414775/150‑1 (MQ=255) aTCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGt < 2:2646613/150‑1 (MQ=255) aTCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGt > 1:689459/1‑150 (MQ=255) aTCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCAGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGt > 2:1662486/1‑150 (MQ=255) aacCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTctgctg < 2:2339240/150‑1 (MQ=255) acCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTgg > 1:4267480/1‑150 (MQ=255) cgaacgaaGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGttt < 2:2093391/150‑1 (MQ=255) gaaGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTAtt > 1:1105146/1‑150 (MQ=255) gaaGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTAtt > 2:1902499/1‑150 (MQ=255) aGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCt < 1:2752126/150‑1 (MQ=255) gCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTg < 2:3309328/150‑1 (MQ=255) gTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCa < 1:4217549/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCAt > 2:610452/1‑150 (MQ=255) aGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGa > 2:5294578/1‑150 (MQ=255) gCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGat < 1:813914/150‑1 (MQ=255) cTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGatc < 2:2490751/150‑1 (MQ=255) gTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGatcat > 1:2706534/1‑150 (MQ=255) gTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGatcat < 1:612577/150‑1 (MQ=255) gTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGatcat < 2:3954057/150‑1 (MQ=255) gTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGatcat < 2:731820/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCAtct < 1:4747057/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCAtct < 1:245947/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCAtctt < 1:5049392/150‑1 (MQ=255) ctgctgcGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCtat < 2:5310526/150‑1 (MQ=255) ctgctgcGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCtat > 2:4631765/1‑150 (MQ=255) ctgcGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATaag < 2:1049744/150‑1 (MQ=255) gcGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATaagaa > 2:904949/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGGTGCGTTGATCTCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATaagaag > 2:806297/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATaagaag > 1:2150435/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGt < 1:5187149/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTgg > 2:1896059/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTgg < 1:1235802/150‑1 (MQ=255) ggTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTGGt > 2:2557282/1‑150 (MQ=255) gTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGAt > 1:1332107/1‑150 (MQ=255) aTCTCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCg < 1:458378/150‑1 (MQ=255) | GGTCGTGCGGTTCTGGTGAAACAGGAAGAGGTGATTAACATCGCCAACATCCAGTCTCGTCTGGGTAACAGCTTCCGTATCACCGGCATCAACAACCCGAACGAAGCCCGTCAGCTGTCACTGCTGCTGCGTGCCGGTGCGTTGATCGCGCCGATTCAGATTGTTGAAGAACGTACCATTGGCCCAACCCTGGGTATGCAGAACATTGAACAGGGGCTGGAGGCTTGCCTTGCCGGTCTGCTGGTTTCTATTCTGTTCATGATCATCTTCTATAAGAAGTTTGGTCTGATTGCG > CP009273/424246‑424539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |