| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 42,342 | G→T | 12.8% | intergenic (‑411/‑61) | caiT ← / → fixA | putative transporter/anaerobic carnitine reduction putative electron transfer flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 42,342 | 0 | G | T | 12.8% | 1114.2 / 89.9 | 351 | intergenic (‑411/‑61) | caiT/fixA | putative transporter/anaerobic carnitine reduction putative electron transfer flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (148/158); new base T (23/22); total (171/180) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
TGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTCAGCAAAGC > CP009273/42193‑42491 | tCCATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGata < 2:3866877/150‑1 (MQ=255) ccATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTTCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTatat > 1:3758105/1‑150 (MQ=255) ccATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTatat > 1:3862180/1‑150 (MQ=255) cATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATc < 2:1668408/150‑1 (MQ=255) aTAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCt < 1:4080047/150‑1 (MQ=255) tAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTg < 2:5165802/150‑1 (MQ=255) aaaCAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTa < 2:3820235/150‑1 (MQ=255) aaTATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTa > 1:4705173/1‑150 (MQ=255) atatTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTaa > 1:2297532/1‑150 (MQ=255) atTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAaca > 2:4626320/1‑150 (MQ=255) atTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAaca > 1:3084050/1‑150 (MQ=255) ttGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAacac < 2:2169849/150‑1 (MQ=255) tGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAAcacc < 2:4833769/150‑1 (MQ=255) tGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAAcacc < 1:4374936/150‑1 (MQ=255) tGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAAcacc < 2:841510/150‑1 (MQ=255) tGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAAcacc < 2:2417531/150‑1 (MQ=255) gAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGTGCGTGATATCTGTAATTAAcacca > 1:4925503/1‑150 (MQ=255) gAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAAcacca > 2:1118960/1‑150 (MQ=255) aaaTTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACaccacc < 1:4784300/150‑1 (MQ=255) tttCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGat < 1:2553354/150‑1 (MQ=255) ttCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGata < 1:1532956/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGatat < 2:867979/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGatat < 2:3557168/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGatat < 1:1800670/150‑1 (MQ=255) tCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGatat < 2:703188/150‑1 (MQ=255) cTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATg < 1:2832615/150‑1 (MQ=255) cTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATg > 1:3338404/1‑150 (MQ=255) tttGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAac < 2:1776401/150‑1 (MQ=255) tttGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAac < 2:2926937/150‑1 (MQ=255) ttGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGaaag > 2:3793201/1‑148 (MQ=255) tGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAacga > 1:3792451/1‑150 (MQ=255) gCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAacgac < 2:1466495/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGtt > 1:660785/1‑150 (MQ=255) aCGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTAAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGtt < 2:1925112/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGttt > 1:1087010/1‑150 (MQ=255) cGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGttt > 1:220596/1‑150 (MQ=255) gCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTc > 2:5058065/1‑150 (MQ=255) gCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTc > 1:3544851/1‑150 (MQ=255) cGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCt > 1:1440571/1‑150 (MQ=255) gtTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCa < 2:3635653/150‑1 (MQ=255) ttttCAATATTGGTGATGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGAGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCAt < 2:4433896/150‑1 (MQ=255) tCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGAt < 2:90756/150‑1 (MQ=255) tCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGAt < 1:1324350/150‑1 (MQ=255) tCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGAt < 2:39255/150‑1 (MQ=255) aaTATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGAttt > 2:1606922/1‑150 (MQ=255) aaTATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGAttt < 1:369873/150‑1 (MQ=255) atatTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTc > 2:4474535/1‑150 (MQ=255) tGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGga > 1:1007721/1‑150 (MQ=255) ttattaaCTTAACAATATTTAAATTTGGATTTATCTGAGTGTGAATTTTTAAATATTTGTTATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGAt < 1:993578/145‑1 (MQ=255) aaCTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAAt < 1:2046210/150‑1 (MQ=255) aCTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATg > 2:3261057/1‑150 (MQ=255) aaCAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGa < 1:4320616/150‑1 (MQ=255) aaCAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGa > 1:5230594/1‑150 (MQ=255) aaTATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGatta > 1:817224/1‑150 (MQ=255) atTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGAttatta > 2:1038818/1‑150 (MQ=255) tGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACt > 1:4510473/1‑150 (MQ=255) tGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACt > 1:5079348/1‑150 (MQ=255) gAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACtt < 1:5159755/150‑1 (MQ=255) aaGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGc > 2:3115374/1‑150 (MQ=255) aGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCt < 2:270556/150‑1 (MQ=255) gTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCta > 2:2315148/1‑150 (MQ=255) gATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAg < 2:1202097/150‑1 (MQ=255) aTTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAgt < 1:1898677/150‑1 (MQ=255) aTTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAgt > 1:2466081/1‑150 (MQ=255) aTTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAgt < 2:5237352/150‑1 (MQ=255) ttATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAgtgc < 1:2913067/150‑1 (MQ=255) aTCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAgtgcgt > 2:4184101/1‑150 (MQ=255) tgtgACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCtgat < 1:1275743/150‑1 (MQ=255) gtgACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCtgatg > 2:4357168/1‑150 (MQ=255) tgACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCtgatga < 2:2862431/150‑1 (MQ=255) tgACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCtgatga > 1:2422941/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAg < 1:1606922/150‑1 (MQ=255) ttttCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAgg < 1:4825737/150‑1 (MQ=255) ttCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCAGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGat < 2:4691847/150‑1 (MQ=255) aaTATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATAtt < 1:278949/150‑1 (MQ=255) tGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCaa > 2:4130359/1‑150 (MQ=255) tGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCaa < 1:5281763/150‑1 (MQ=255) gATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCaat > 2:3335807/1‑150 (MQ=255) gATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCaat > 2:2863296/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCaata > 2:2098359/1‑150 (MQ=255) tAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCaataat < 1:3425008/150‑1 (MQ=255) aGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCt < 2:3758105/150‑1 (MQ=255) gTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTTTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTg < 2:2985462/150‑1 (MQ=255) ttttATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATCTTGCGGTCAATAATGCTGa > 2:675274/1‑150 (MQ=255) tttATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGAt > 1:2625356/1‑150 (MQ=255) tttATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGAt < 1:4626320/150‑1 (MQ=255) aTTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATTAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGt < 2:265932/150‑1 (MQ=255) aaaaTTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCAtt > 1:3825064/1‑150 (MQ=255) aaaaTTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCAtt < 1:4662185/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTCCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGa > 1:1163199/1‑150 (MQ=255) tAAAGGGCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACt > 1:1737630/1‑150 (MQ=255) tAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACt < 2:1366322/150‑1 (MQ=255) aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTc > 2:536232/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTc > 1:187057/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTc > 1:5020537/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTc > 2:2466899/1‑150 (MQ=255) aGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTCa < 1:1110269/150‑1 (MQ=255) gggCGTTATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTCAg < 1:1665176/150‑1 (MQ=255) gggCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTCAg < 1:404385/150‑1 (MQ=255) tGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTCAGCAAAg > 1:3245070/1‑150 (MQ=255) | TGATCCATAAAACAATATTGAAAATTTCTTTTTGCTACGCCGTGTTTTCAATATTGGTGAGGAACTTAACAATATTGAAAGTTGGATTTATCTGCGTGTGACATTTTCAATATTGGTGATTAAAGTTTTATTTCAAAATTAAAGGGCGTGATATCTGTAATTAACACCACCGATATGAACGACGTTTCCTTCATGATTTCTGGAGATGCAATGAAGATTATTACTTGCTATAAGTGCGTGCCTGATGAACAGGATATTGCGGTCAATAATGCTGATGGTTCATTAGACTTCAGCAAAGC > CP009273/42193‑42491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |