Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 525,268 | C→A | 13.8% | pseudogene (205/357 nt) | ylbG ← | pseudogene, DNA‑binding transcriptional regulator homology |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 525,268 | 0 | C | A | 13.8% | 927.8 / 74.0 | 297 | pseudogene (205/357 nt) | ylbG | pseudogene, DNA‑binding transcriptional regulator homology |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (127/127); new base A (20/22); total (147/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
ATTCTCAAGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCTGAGTTCTTCAG > CP009273/525119‑525417 | aTTCTAAAGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATc < 2:2046867/150‑1 (MQ=255) tcAAGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTa < 2:2781404/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTAc > 2:5016557/1‑150 (MQ=255) cAAGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTAc < 2:3868812/150‑1 (MQ=255) aaGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACg > 1:1092756/1‑150 (MQ=255) aaGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACg > 1:2854474/1‑150 (MQ=255) tATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTCCGGTTCt > 2:320027/1‑150 (MQ=255) tATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCt > 1:668928/1‑150 (MQ=255) aGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAgg < 2:71147/150‑1 (MQ=255) aaCCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTa > 2:2301112/1‑150 (MQ=255) aCCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAg < 1:4681627/150‑1 (MQ=255) ccAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAgg < 2:5275660/150‑1 (MQ=255) cagacagaACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGa < 2:3323679/150‑1 (MQ=255) agacagaACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAg < 2:3342541/150‑1 (MQ=255) agacagaACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAg < 2:1599057/150‑1 (MQ=255) gacagaACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAgc > 2:4152016/1‑150 (MQ=255) agaACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGcgcg < 1:1624510/150‑1 (MQ=255) agaACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGcgcg > 1:5248854/1‑150 (MQ=255) aaCGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCgcggc < 2:3061255/150‑1 (MQ=255) aaCGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCgcggc > 1:5293887/1‑150 (MQ=255) cGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGa > 1:4897777/1‑150 (MQ=255) ggACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGAc > 2:3446607/1‑150 (MQ=255) ggACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGAc > 2:4070607/1‑150 (MQ=255) ggACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGAc > 2:2122795/1‑150 (MQ=255) cacTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGAt > 1:945942/1‑150 (MQ=255) acTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGAtt > 1:3093671/1‑150 (MQ=255) acTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGAtt < 1:3756238/150‑1 (MQ=255) tGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTaa > 2:2515330/1‑150 (MQ=255) tCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATc > 2:3577297/1‑150 (MQ=255) cGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCt > 2:1433176/1‑150 (MQ=255) cGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCt > 2:1711137/1‑150 (MQ=255) cGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCt < 2:763284/150‑1 (MQ=255) ggAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTg < 2:2872208/150‑1 (MQ=255) ggAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTg > 2:3658290/1‑150 (MQ=255) ggAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTg > 1:3429936/1‑150 (MQ=255) gagaTAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTgc > 2:2416195/1‑150 (MQ=255) gagaTAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTgc > 1:3373179/1‑150 (MQ=255) agaTAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTgcg > 2:24869/1‑150 (MQ=255) aaaCCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCca < 1:3159576/150‑1 (MQ=255) aaaccccTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGAACATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACATCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCcac < 1:472478/147‑1 (MQ=255) aaCCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCcac < 2:4373442/150‑1 (MQ=255) aaCCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCcac < 1:1619699/150‑1 (MQ=255) aaCCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCcac > 1:3610019/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCcaca < 1:1911739/150‑1 (MQ=255) cccTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCg > 1:2466238/1‑150 (MQ=255) cccTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCg > 1:1231711/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGc > 1:410379/1‑150 (MQ=255) tGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCt < 2:2653754/150‑1 (MQ=255) gTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCtt < 2:124775/150‑1 (MQ=255) gTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCtt < 1:3206139/150‑1 (MQ=255) gTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCtt < 2:603853/150‑1 (MQ=255) gTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTGCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCtt > 2:1771087/1‑150 (MQ=255) ttACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCa < 1:1875086/150‑1 (MQ=255) cAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGAc < 2:2196548/150‑1 (MQ=255) gCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGAcaa > 2:227211/1‑148 (MQ=255) gCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCa < 1:3066736/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCCGGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTATTCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTc < 1:346682/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTc < 2:4556234/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTc > 1:2940600/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGTTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCATCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTATTCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGt < 2:3610979/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGt > 1:1750749/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTa < 1:4219399/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGa > 1:2056218/1‑150 (MQ=255) tGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATaa > 1:1484459/1‑150 (MQ=255) gCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATaaa > 1:196894/1‑150 (MQ=255) cTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATaaaa > 2:1214751/1‑150 (MQ=255) tGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAAc < 1:4322722/150‑1 (MQ=255) tGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAAc < 1:619302/150‑1 (MQ=255) ccATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTa < 2:3771299/150‑1 (MQ=255) cATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTAt < 2:2971174/150‑1 (MQ=255) tgtgTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCa < 2:4174715/150‑1 (MQ=255) gtgtCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCAc < 1:1006791/150‑1 (MQ=255) tgtCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCAcg < 2:5121234/150‑1 (MQ=255) gAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAAc > 1:48883/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAAc < 1:3296563/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCa < 1:3892779/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCa < 1:2301112/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTAATCGGTACGGTTATTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCa < 1:4045409/150‑1 (MQ=255) ggCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAt > 2:2251350/1‑150 (MQ=255) ggCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAt > 1:4499095/1‑150 (MQ=255) gCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAtt < 2:2854474/150‑1 (MQ=255) gCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAtt < 2:4845164/150‑1 (MQ=255) cGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAttt < 1:4801515/150‑1 (MQ=255) gTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAtttt < 1:2567765/150‑1 (MQ=255) gTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGAtttt > 1:384180/1‑150 (MQ=255) tAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTa > 1:3967449/1‑150 (MQ=255) aaTCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTAc < 2:2466238/150‑1 (MQ=255) aaTCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTACAGCGACCAGTTCGCGGTAACGAAAAAACGTAACACGCGAAACGCCCAAGATATTAc > 2:1330687/1‑150 (MQ=255) caacaaCAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAgg > 1:1133673/1‑150 (MQ=255) aGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGa < 1:793112/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATa > 2:1851000/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATAc > 2:3832244/1‑150 (MQ=255) tGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACg > 2:4748889/1‑150 (MQ=255) ttCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGtt < 1:5015822/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGc > 1:4534524/1‑150 (MQ=255) aGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCt > 1:1828809/1‑150 (MQ=255) ttGCCTCATAGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCTGa > 1:1441932/1‑150 (MQ=255) tCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTAAGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCTGAGttct < 2:668928/150‑1 (MQ=255) cATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCTGAGttctt < 1:2228860/150‑1 (MQ=255) aTCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCTGAGttcttc > 1:3510546/1‑150 (MQ=255) | ATTCTCAAGGTTATGGAGTAACCAGACAGAACGGACACCACTGTCGGAGATAAAAACCCCCTGTTTACGCAGCTCGTTGCTGGCCCGGTGCTGACCATGTGTCGGGAAAGCGACGGCGTAATCAACAACAGCCTGTTCAGTTGCCTCATCGGTACGGTTCTTAAGGTTAGGAGCGCGGCGACTACGATTAATCTGCGCATCCACACCGCCTTCAGCGACCAGTTCGCGGTAACGATAAAACGTATCACGCGAAACGCCCATGATTTTACAGGCTTTTGATACGTTGCTGAGTTCTTCAG > CP009273/525119‑525417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |