Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 576,192 | 0 | T | A | 10.1% | 629.1 / 21.0 | 237 | intergenic (‑291/‑98) | ylcI/nohD | DUF3950 family protein, DLP12 prophage/DLP12 prophage; DNA packaging protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (131/79); new base A (3/24); total (134/103) | |||||||||||
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Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
ATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGT‑ATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGT > CP009273/576043‑576340 | aTGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATATATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTAGTCGTAACTTAATGT‑atttattt > 2:1036243/1‑150 (MQ=255) tGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGT‑Atttattta > 1:1439666/1‑150 (MQ=255) gTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGT‑ATTTATTTaa < 1:149893/150‑1 (MQ=255) 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tAACTTAATGT‑ATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTACTTTCTCTGTTTTTGTACGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCAGGCTGTCAttt > 1:279308/1‑150 (MQ=255) aaCTTAATGT‑ATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACAtttt > 2:2063927/1‑150 (MQ=255) aaCTTAATGT‑ATTTATTAAAAATACCCCCAGAAAAGAAACGAAACCACAGCTGCTGAAAGCGAGCTTTATGCCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCAGATTTTGTCCGTCGAAAGTGCAAAGGAAGTCAACAAAAACCAGCTGGCAGACaatat > 2:80618/1‑146 (MQ=14) cTTAATGT‑ATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCg > 2:251777/1‑150 (MQ=255) cTTAATGT‑ATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCg > 2:675080/1‑150 (MQ=255) 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ttatttaAAATACCCCCTGAAAAGAACGGACACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTAt < 2:5130465/150‑1 (MQ=255) atttaAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTATGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAATCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATcc > 1:3002630/1‑150 (MQ=255) | ATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGT‑ATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGT > CP009273/576043‑576340 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |