Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 88,635 | C→A | 14.0% | R246S (CGC→AGC) | ftsI → | transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin‑binding protein 3) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 88,635 | 0 | C | A | 14.0% | 838.8 / 73.5 | 270 | R246S (CGC→AGC) | ftsI | transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin‑binding protein 3) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (118/113); new base A (22/16); total (140/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCG > CP009273/88486‑88783 | tCGCTAAATGGCGTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATc < 1:3562501/150‑1 (MQ=255) cGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATcg > 2:2422973/1‑150 (MQ=255) aTAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATagcg > 1:4948707/1‑150 (MQ=255) tAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGa > 2:3478653/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCTTATCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGaa > 2:3153727/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAAc > 2:1239292/1‑150 (MQ=255) aTGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACt > 1:4163234/1‑150 (MQ=255) ttACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGaaca > 1:2915848/1‑150 (MQ=255) ttACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGaaca < 1:3444159/150‑1 (MQ=255) ttACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGaaca > 1:3088335/1‑150 (MQ=255) ttACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGaaca < 2:1686048/150‑1 (MQ=255) tACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTGTATCGCGAACTGaacaa > 2:3080266/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAAcgc < 1:3936840/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAAcgcg < 1:3229314/150‑1 (MQ=255) aGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTgg < 1:73100/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGcc < 2:4967104/150‑1 (MQ=255) gggTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCtt > 1:4059586/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTa < 1:818554/150‑1 (MQ=255) aGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACa > 1:2014948/1‑150 (MQ=255) aGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACa > 2:2610858/1‑150 (MQ=255) cgcATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAg < 1:1416482/150‑1 (MQ=255) cgcATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAg < 1:3669225/150‑1 (MQ=255) tgCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAAt < 2:4128564/150‑1 (MQ=255) gCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATc > 2:5214590/1‑150 (MQ=255) tAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTgg < 2:4338180/150‑1 (MQ=255) aaaGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGt > 1:3696651/1‑150 (MQ=255) ccGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAgcgc < 2:175302/150‑1 (MQ=255) tATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTg > 2:1855749/1‑150 (MQ=255) tATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTg > 2:2516967/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCt < 2:1192176/150‑1 (MQ=255) ggacgcgTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTGTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCtg > 2:2998840/4‑150 (MQ=255) ggTCGCGTAATTGAAGATATTTATTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCtg < 1:1803664/150‑1 (MQ=255) gTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGAt > 2:4746825/1‑150 (MQ=255) gTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGAt > 2:4163495/1‑150 (MQ=255) tAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATg > 2:2361522/1‑150 (MQ=255) nttGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTc > 1:1516327/2‑150 (MQ=255) gAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAac < 2:3975695/150‑1 (MQ=255) gAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAac > 2:224396/1‑150 (MQ=255) gAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAac > 1:4880835/1‑150 (MQ=255) gAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAac < 1:5284323/150‑1 (MQ=255) gAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTATAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAac < 2:4882410/150‑1 (MQ=255) aaGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAaca < 2:1808175/150‑1 (MQ=255) aaGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAaca > 2:3771373/1‑150 (MQ=255) aGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAacac > 1:604274/1‑150 (MQ=255) atatTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCg > 2:1917983/1‑150 (MQ=255) ttcttcTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGa > 2:15861/1‑150 (MQ=255) cttctACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAg > 2:2342212/1‑150 (MQ=255) cttctACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAg < 2:1429856/150‑1 (MQ=255) tctACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTg < 2:3409490/150‑1 (MQ=255) tctACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTg < 1:1958258/150‑1 (MQ=255) tctACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTg > 1:4681645/1‑150 (MQ=255) tACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCt < 2:4544451/150‑1 (MQ=255) tACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCt < 1:1552147/150‑1 (MQ=255) tACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCt > 2:2116763/1‑150 (MQ=255) aCTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTg > 1:2983298/1‑150 (MQ=255) cTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTgg > 2:2452408/1‑150 (MQ=255) cTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTgg > 1:2278046/1‑150 (MQ=255) cTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTgg > 1:48173/1‑150 (MQ=255) cTGACAGCCAGACAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTgg < 2:3233116/150‑1 (MQ=255) aCAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGa > 1:3301165/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGGCAGCGCTCAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGAt < 1:3165856/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGAt < 2:1273068/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCt > 1:4760627/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCt > 2:572880/1‑150 (MQ=255) aGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTa > 1:5120290/1‑150 (MQ=255) aGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTa > 2:4236855/1‑150 (MQ=255) cAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACa < 2:5009390/150‑1 (MQ=255) aGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAg > 1:5186852/1‑150 (MQ=255) aGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAg > 2:702890/1‑150 (MQ=255) gcgcACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTATATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCAGAAACTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGc > 2:2292368/1‑150 (MQ=255) cacaACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCg < 2:2861225/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGACCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCa < 2:828752/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATAc < 1:1079268/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACa > 2:772265/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACaa < 1:5121074/150‑1 (MQ=255) cgcTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAAcc > 1:2886911/1‑150 (MQ=255) tGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTa > 2:4357358/1‑150 (MQ=255) aGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAAc > 2:2982044/1‑150 (MQ=255) tATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACaa > 1:1048219/1‑150 (MQ=255) tATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACaa < 2:3932059/150‑1 (MQ=255) aTTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAAt > 2:3567721/1‑150 (MQ=255) aTTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAAt > 1:1250042/1‑150 (MQ=255) aTTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAAt > 1:906261/1‑150 (MQ=255) aTTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAAt < 2:5058662/150‑1 (MQ=255) tgatgaACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCt > 1:1260259/1‑150 (MQ=255) atgaACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGa > 1:5234009/1‑150 (MQ=255) tgaACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACACCCCTAACAATCTGAg > 2:1205310/1‑150 (MQ=255) gaACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGc > 1:220418/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCg < 1:2802719/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACg < 1:411263/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGaaa < 2:4181595/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAag < 2:2793090/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAag < 2:104526/150‑1 (MQ=255) cTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAagag < 2:3701039/150‑1 (MQ=255) cTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAagag < 2:2195556/150‑1 (MQ=255) cTGGTTTATAGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAagag < 1:4163452/150‑1 (MQ=255) tGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAgg > 1:444637/1‑150 (MQ=255) ggTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGc > 1:1700643/1‑150 (MQ=255) tATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATg < 2:1330313/150‑1 (MQ=255) tCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCg > 1:4272420/1‑150 (MQ=255) | TCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCG > CP009273/88486‑88783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |