| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 93,391 | G→T | 100% | T301T (ACG→ACT) | mraY → | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 93,391 | 0 | G | T | 99.6% | 889.2 / ‑4.5 | 269 | T301T (ACG→ACT) | mraY | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (141/127); total (141/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CTTCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACCGCGCGTCATTGTGCGTTTCTGGATTATTTCGCTGATGCTGGT > CP009273/93244‑93537 | cTTCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAActct > 1:680968/1‑150 (MQ=255)cTTCCTGTGGTTTAACAACTATCCGGCGCAGGTCTTTATGTGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGATAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATCGGGGTCGTGTTCGTGTTAGAAActct > 2:3834961/1‑150 (MQ=255) ttCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCtt < 1:2934221/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCtt > 2:2351516/1‑150 (MQ=255) tCCTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCttt < 2:5306533/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTTCTAAGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCt > 1:4207756/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCt < 2:1213524/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCt < 2:1425985/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTAAGGTGGTGCGTTAGTCATAATCGCCGTACTGCTACTTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCt > 1:3970324/1‑150 (MQ=255) tgtgGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTg > 1:5191766/1‑150 (MQ=255) tgGTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTc > 2:2743571/1‑150 (MQ=255) gTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCAt > 2:3022192/1‑150 (MQ=255) gTTTAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCAt > 1:4539943/1‑150 (MQ=255) tttAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATc < 2:682353/150‑1 (MQ=255) tAACACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCt < 2:4098322/150‑1 (MQ=255) aaCACCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTg > 2:3358844/1‑150 (MQ=255) acCTATCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAg < 1:392997/150‑1 (MQ=255) aTCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCg > 2:4797811/1‑150 (MQ=255) tCCGGCGCAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCgg > 1:965837/1‑150 (MQ=255) cGGCGCAGGTCTTTAGGGGCGATGTAGGTTNGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCt < 2:3399215/150‑1 (MQ=255) gcAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCtt > 1:4082079/1‑150 (MQ=255) cAGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCttt < 1:2090729/150‑1 (MQ=255) aGGTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGAGTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTa > 2:4018130/1‑150 (MQ=255) ggTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTaa > 1:3393536/1‑150 (MQ=255) gTCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTaaa > 1:3000486/1‑150 (MQ=255) tCTTTATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAAc > 2:3798444/1‑150 (MQ=255) ttATGGGCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTgc > 2:4814995/1‑150 (MQ=255) ggCGATGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGa > 2:2073429/1‑150 (MQ=255) tGTAGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTACACTGCGCGGACAACg > 2:4474347/1‑150 (MQ=255) aGGTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAt > 2:2871617/1‑150 (MQ=255) ggTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAtt < 2:813675/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACGCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAtt < 2:3315111/150‑1 (MQ=255) gTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAttt > 1:1045506/1‑150 (MQ=255) gTTCGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTAttt > 1:1273097/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTcc < 2:1510798/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTcc > 2:2513521/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCg < 1:5059780/150‑1 (MQ=255) gCGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATg < 1:3467727/150‑1 (MQ=255) cGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATgg < 2:5055648/150‑1 (MQ=255) cGTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATgg > 1:4589050/1‑150 (MQ=255) gTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTCTTTTCCGCATGGc > 2:1549422/1‑150 (MQ=255) gTTAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGc < 1:3352629/150‑1 (MQ=255) tAGGTGGTGCGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCAc > 2:5082768/1‑150 (MQ=255) cGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATtcatc > 2:2220009/1‑150 (MQ=255) cGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATtcatc > 2:1759896/1‑150 (MQ=255) cGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATtcatc < 2:1297045/150‑1 (MQ=255) cGTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTAT‑GGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATtcatca < 2:1993281/150‑1 (MQ=255) gTTAGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATtcatca > 1:3243486/1‑150 (MQ=255) aGGCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATcacca > 1:836984/1‑150 (MQ=255) gCATTATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACt > 2:4563701/1‑150 (MQ=255) tATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGa > 1:2344689/1‑150 (MQ=255) tATCGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGa > 1:2656835/1‑150 (MQ=255) cGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGTTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGAATTTTCCGCATGGCACAGATTCATCACCACTATGAACt > 1:4253831/1‑150 (MQ=255) cGCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACt > 2:351751/1‑150 (MQ=255) gCCGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTg > 1:1453904/1‑150 (MQ=255) ccGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGa < 1:3491906/150‑1 (MQ=255) cGTACTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGaa > 1:2775903/1‑150 (MQ=255) aCTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAgg < 2:4996410/150‑1 (MQ=255) aCTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAgg < 1:2188359/150‑1 (MQ=255) cTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGc < 1:1254872/150‑1 (MQ=255) cTGCTACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGc < 1:1975526/150‑1 (MQ=255) tACGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGc > 2:548899/1‑150 (MQ=255) aCGTCAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGcc < 1:2281701/150‑1 (MQ=255) cAGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGaa < 1:1665534/150‑1 (MQ=255) aGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAAc > 1:696059/1‑150 (MQ=255) aGGAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAAc > 1:189210/1‑150 (MQ=255) ggAATTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAAcc < 1:95779/150‑1 (MQ=255) aaTTCCTGCTGGTGATTATGGGGGGCGTGTTCGTGGTAGAAACTCTTTCTGTCATCCTGCAGGTCGGCTCCTTTAAACTGCGCGGACAACGTATTTTCCGCATGGCACCGATTCATCACCACTATGAACTGAAAGGCTGGCCGGAACcgc > 2:1733023/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |