Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 847,118 | G→T | 15.8% | I312I (ATC→ATA) | ybiP ← | putative EptAB family phosphoethanolamine transferase, inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 847,118 | 0 | G | T | 15.8% | 924.0 / 103.0 | 310 | I312I (ATC→ATA) | ybiP | putative EptAB family phosphoethanolamine transferase, inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (134/127); new base T (23/26); total (157/153) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
GTAGAACAATCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGCGGTATCGTATTCGCCGATTTGACCCTGGTTGGAAAACCACCAGGTCTGGAAGCCCGCGCGATTTGCCAGGGTGACAAAGTTATCCTGAAACTGTGGTTTGCCATCGACAACGCGATTGAGCGTTAAGCCAAGCGATTTCTGCGT > CP009273/846970‑847267 | aGAACAATCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATa > 2:1505891/1‑150 (MQ=255) gAACAATCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAg < 1:3392202/150‑1 (MQ=255) aaCAATCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGc > 2:490033/1‑150 (MQ=255) aCAATCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGCg > 2:1086387/1‑150 (MQ=255) aCAATCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGCg < 1:3793623/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCTGCGGTTGCGCGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCTTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGCGGt > 1:3585809/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGCGGt < 2:187470/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCTGCGGTTGCGAGTGCTCTTGCGCCAGCACTTGAGCGGTCATATCCAGTAACGCTTCGTCTTTGGTGTTTTTATCTGCTTCAAAATTACCTTCTTTCAGGAAGTACACTTCATCTGCTCGTTTGGCGATGCTGGCGATAGCGGt < 2:2873657/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |