Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 102,769 | G→T | 100% | V326V (GTG→GTT) | ftsZ → | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 102,769 | 0 | G | T | 98.8% | 1068.3 / 1.0 | 338 | V326V (GTG→GTT) | ftsZ | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base T (204/129); total (207/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATCCCAGC > CP009273/102622‑102918 | gtaggtaACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTAcc < 2:5151444/150‑1 (MQ=255) ggtaACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAAt > 1:3572299/1‑150 (MQ=255) gtaACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATa > 2:2139184/1‑150 (MQ=255) taACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATaa > 1:4721519/1‑150 (MQ=255) taACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATaa > 2:3828669/1‑150 (MQ=255) aaCACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAg < 2:178699/150‑1 (MQ=255) aaCACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAg < 1:3956934/150‑1 (MQ=255) aaCACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAg > 1:3097262/1‑150 (MQ=255) aTCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGtt > 2:2287056/1‑150 (MQ=255) cATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCagcagc > 1:4121874/1‑150 (MQ=255) cATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCagcagc > 1:3270912/1‑150 (MQ=255) ttGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAg < 1:4456520/150‑1 (MQ=255) tCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATg > 1:2476536/1‑150 (MQ=255) cGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGa > 2:4219223/1‑150 (MQ=255) gACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGAt > 1:1057664/1‑150 (MQ=255) cAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCg > 1:1814419/1‑150 (MQ=255) aaCGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGc > 2:4908027/1‑150 (MQ=255) aCGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCt < 1:1467292/150‑1 (MQ=255) cgACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTAcc > 1:3753979/1‑150 (MQ=255) gACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACca > 2:3219030/1‑150 (MQ=255) gACTGTGGTTANCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCTCTACca > 1:2764227/1‑150 (MQ=255) tgtgGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACcagca > 1:3165894/1‑150 (MQ=255) gtgGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACcagcag > 2:4882443/1‑150 (MQ=255) gTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCAt < 1:4313218/150‑1 (MQ=255) tATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATgg > 2:3321967/1‑150 (MQ=255) aTCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATggg > 2:4501707/1‑150 (MQ=255) aTCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATggg > 2:3478909/1‑150 (MQ=255) ggTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATg > 2:1452628/1‑150 (MQ=255) ggTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATg < 1:3806697/150‑1 (MQ=255) ggTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATg > 2:2381997/1‑150 (MQ=255) gTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATgg < 2:104617/150‑1 (MQ=255) aCTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCt > 2:3054310/1‑150 (MQ=255) aCTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCt < 1:4216287/150‑1 (MQ=255) cTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTc > 2:4795766/1‑150 (MQ=255) ctTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTg < 2:2831542/150‑1 (MQ=255) tGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGAc > 2:5228414/1‑150 (MQ=255) cccGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCa > 2:431385/1‑150 (MQ=255) cccGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCa > 1:3539294/1‑150 (MQ=255) cGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAgg < 1:2299407/150‑1 (MQ=255) ggATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGa > 2:1703004/1‑150 (MQ=255) gATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAg < 2:4073490/150‑1 (MQ=255) gATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAg < 2:137403/150‑1 (MQ=255) atatGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGc > 1:523787/1‑150 (MQ=255) atgaaggaCGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTTCCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAg < 1:4052182/150‑1 (MQ=255) tgaatgaCGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGa > 2:43361/1‑150 (MQ=255) gaatgaCGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCGACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGaa < 2:1908710/150‑1 (MQ=255) aatgaCGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAg > 1:5306516/1‑150 (MQ=255) tgaCGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGcc > 2:1317754/1‑150 (MQ=255) aCGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCgg > 1:1830544/1‑150 (MQ=255) gTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTc > 2:3532184/1‑150 (MQ=255) tAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCg > 1:865143/1‑150 (MQ=255) tAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCg > 1:548905/1‑150 (MQ=255) tAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCg > 1:1886017/1‑150 (MQ=255) tAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCg > 2:2004176/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGt > 1:4921783/1‑150 (MQ=255) tgttgCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATACGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGa < 2:101409/150‑1 (MQ=255) gttgCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGAc < 2:3664240/150‑1 (MQ=255) gttgCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGAc < 1:3079710/150‑1 (MQ=255) gCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAAt < 2:758652/150‑1 (MQ=255) gCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAAt < 2:1511175/150‑1 (MQ=255) cGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATg > 2:862015/1‑150 (MQ=255) gACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATgc > 1:1381276/1‑150 (MQ=255) aCAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATgcg < 2:4742830/150‑1 (MQ=255) aGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGcgcc > 2:330319/1‑150 (MQ=255) gTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGcgccgc > 2:1835738/1‑150 (MQ=255) gTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGcgccgc > 2:2880696/1‑150 (MQ=255) ataggCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCaa > 2:1577285/4‑150 (MQ=255) taggCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCaaa < 1:2889238/148‑1 (MQ=255) taggCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCaaa < 1:50752/148‑1 (MQ=255) ggCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACt < 1:1158566/150‑1 (MQ=255) ggCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACt > 1:263129/1‑150 (MQ=255) ggCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACt > 1:796664/1‑150 (MQ=255) gCATGGACAAACGTCCTGACATCACTCTGGTTACCACTAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTg < 2:2533274/150‑1 (MQ=255) cATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGc > 2:2691879/1‑150 (MQ=255) tGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGa > 1:2056880/1‑150 (MQ=255) gACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGaaa > 1:616491/1‑150 (MQ=255) cAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAaga < 2:889762/150‑1 (MQ=255) cAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAaga > 1:3368785/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAagag > 2:1158055/1‑150 (MQ=255) aCGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGcc < 1:1716998/150‑1 (MQ=255) cGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCg < 2:3165894/150‑1 (MQ=255) gTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCgg < 2:4224905/150‑1 (MQ=255) ccTGAAATCACTCTGTTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGAt < 2:1597624/150‑1 (MQ=255) ccTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGAt < 2:21918/150‑1 (MQ=255) ccTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGAt > 2:661623/1‑150 (MQ=255) tGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTa > 2:4412125/1‑150 (MQ=255) tGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTa > 1:2463965/1‑150 (MQ=255) gAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTAt < 1:2167949/150‑1 (MQ=255) aaaTCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATc < 2:3454769/150‑1 (MQ=255) aaTCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCt > 1:4908164/1‑150 (MQ=255) aTCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTg < 1:3784924/150‑1 (MQ=255) cACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGa > 1:2835091/1‑150 (MQ=255) ctctGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGata < 2:3572324/150‑1 (MQ=255) ctctGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGata < 1:2559741/150‑1 (MQ=255) ctctGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGata < 1:5165712/150‑1 (MQ=255) tctGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGatat < 1:4509721/150‑1 (MQ=255) ctGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATc < 2:2041022/150‑1 (MQ=255) ctGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATc < 2:3980069/150‑1 (MQ=255) tGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATcc > 2:615729/1‑150 (MQ=255) ggTTACCAATCAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATccc < 1:1289592/150‑1 (MQ=255) | GGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAACTGCGAAAGAGCCGGATTATCTGGATATCCCAGC > CP009273/102622‑102918 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |