| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,281,517 | G→T | 7.7% | L71L (CTG→CTT) | narI → | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,281,517 | 0 | G | T | 7.7% | 1171.6 / 40.3 | 324 | L71L (CTG→CTT) | narI | nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (148/150); new base T (17/9); total (165/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
ATTGGTAGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACGCGTGCGTGCAA > CP009273/1281368‑1281665 | tGGTAGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGAc < 1:3203688/150‑1 (MQ=255) tGGTAGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGAc < 2:4879217/150‑1 (MQ=255) ggTAGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTAcg < 1:4409853/150‑1 (MQ=255) tAGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGAcgcc > 1:955205/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGAcgccg > 1:5007210/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCGGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGAGTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGAcgccg > 1:2788901/1‑150 (MQ=255) tggctgCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCAc > 1:2540307/1‑150 (MQ=255) tATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTAt > 2:703084/1‑150 (MQ=255) aTGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATg < 1:3264721/150‑1 (MQ=255) aTGACAACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGACAATCCAGAAGCTGGAACGCAAAGGGATGAACCTGGCTACGAACATGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTATTGTCGGTCACTACTTAGGTATGCTGACGCCTCACTGGATGTaag > 2:2144346/1‑148 (MQ=255) gACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGaa > 1:4197017/1‑150 (MQ=255) gACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGaa > 1:2945360/1‑150 (MQ=255) cTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGc < 2:445269/150‑1 (MQ=255) cTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACGGGATGTATGAAGc > 2:922949/1‑150 (MQ=255) aCGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCt < 2:1665354/150‑1 (MQ=255) aCGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCt > 2:3103516/1‑150 (MQ=255) aCGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCt < 1:3048151/150‑1 (MQ=255) aCGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCt < 2:1152157/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTg < 1:3241127/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTg < 1:1617478/150‑1 (MQ=255) gCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCt < 1:733151/150‑1 (MQ=255) aGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGc > 2:2321236/1‑150 (MQ=255) acacCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGa > 1:1904426/1‑150 (MQ=255) acacCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGAGTCTGGGGATTTTAGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCgc > 2:4172755/1‑149 (MQ=255) cacCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGAt < 1:1051302/150‑1 (MQ=255) cacCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGAt < 2:1638087/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGa > 2:424379/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGaa < 1:4819051/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCGGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGGTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGaa < 2:101122/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAg < 1:1503371/150‑1 (MQ=255) gcgcgcGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGCGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTNCCGATTGAAGt < 1:2761833/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTg < 1:4471177/150‑1 (MQ=255) gcggcgTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGaaa > 2:1296364/1‑150 (MQ=255) ggcgTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACa < 1:4001201/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGaa > 2:2743386/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGaaa > 2:3359060/1‑150 (MQ=255) cagccagATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAAt < 1:2133949/150‑1 (MQ=255) cagccagATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAAt < 1:1386243/150‑1 (MQ=255) cagccagATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAAt < 1:2078833/150‑1 (MQ=255) ccagATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGc < 1:2478864/150‑1 (MQ=255) ccagATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGc < 1:1476686/150‑1 (MQ=255) cagATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCa > 2:1937342/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACATAAAATGGCAAt > 2:3523470/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATg < 1:5230064/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATg < 1:3695823/150‑1 (MQ=255) cTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGttt < 1:3174654/150‑1 (MQ=255) cTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGttt < 2:3147999/150‑1 (MQ=255) ggATCGCAAAGGGATGAAACTGGCGTCTAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGTGATTTTTGTCGGTCAATTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGACTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGc < 1:3556746/150‑1 (MQ=255) aTCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAATTGGCAATGTTTGCtg > 2:2075151/1‑150 (MQ=255) aTCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCtg > 2:2930792/1‑150 (MQ=255) gCATAGGGATGAACCTGGCGTAGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCtggtg < 2:3579765/150‑1 (MQ=255) gCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCtggtg > 1:1404642/1‑150 (MQ=255) gCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCtggtg < 2:3076830/150‑1 (MQ=255) cAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCtggtgg > 2:848067/1‑150 (MQ=255) aaaGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTggtggt > 2:2654160/1‑150 (MQ=255) aaaGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTggtggt < 1:1187162/150‑1 (MQ=255) aaaGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTggtggt > 2:2944832/1‑150 (MQ=255) aaaGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTggtggt < 1:198461/150‑1 (MQ=255) gAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGAGTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAgcgg > 1:1950944/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAgcggc > 1:4776199/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCt < 1:2235984/150‑1 (MQ=255) cGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCtgt > 2:3192919/1‑150 (MQ=255) gTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCtgtg > 2:5276992/1‑150 (MQ=255) gAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTgtgtat < 1:2689975/150‑3 (MQ=255) gAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCt < 1:460766/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTg < 1:2205020/150‑1 (MQ=255) aaCCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTg > 2:2059256/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTg < 2:4009826/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTCCATATCGGTATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGa < 1:5130524/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGa > 2:3837733/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGAtt > 1:3323529/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGAtt > 2:2578141/1‑150 (MQ=255) tGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTg < 1:3835825/150‑1 (MQ=255) atatCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGgcggcg > 1:2618413/1‑150 (MQ=255) atCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCGTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTg > 1:3621433/1‑150 (MQ=255) tCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGc < 1:4888487/150‑1 (MQ=255) tCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGc < 1:703084/150‑1 (MQ=255) ggATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGt > 1:4425755/1‑150 (MQ=255) tGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGa > 1:2447782/1‑150 (MQ=255) ggggATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGaa > 2:4413397/1‑150 (MQ=255) gggATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCAGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGaca > 2:4698470/1‑148 (MQ=255) ggATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAAc < 1:830546/150‑1 (MQ=255) gATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAAcg < 1:4547811/150‑1 (MQ=255) aTTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAAcgt < 2:1373386/150‑1 (MQ=255) tttttGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAAcgtc < 1:4676881/150‑1 (MQ=255) ttttGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAAcgtcg < 1:180684/150‑1 (MQ=255) tGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCt > 2:4928013/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCt > 2:5154628/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCt > 1:792647/1‑150 (MQ=255) tGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCt > 1:587615/1‑150 (MQ=255) cGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGtt < 1:307568/150‑1 (MQ=255) cACTACTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGAAGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAAAGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCAGTGACAGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGACACGACGTCTGGTCAGc > 2:2377250/1‑150 (MQ=255) aCTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCTGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGcc > 2:3391300/1‑150 (MQ=255) ttcttcGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCa > 2:5059839/1‑150 (MQ=255) cttcGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCAcg > 1:1690294/1‑150 (MQ=255) cGGTATGCTTACGCCGCACTGGACGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACgcgt > 1:609153/1‑150 (MQ=255) gTATGCTTACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACgcgtgc > 2:250035/1‑150 (MQ=255) tATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACgcgtgcg > 1:5079401/1‑150 (MQ=255) aTGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACgcgtgcgt < 2:955205/150‑1 (MQ=255) cTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACGCGTGCGTGCa > 1:335853/1‑150 (MQ=255) | ATTGGTAGCTGGCTGCGTTATGACTACGGGCAGTACACCTGGCGCGCGGCGTCCAGCCAGATGCTGGATCGCAAAGGGATGAACCTGGCGTCGAACCTGTTCCATATCGGGATTCTGGGGATTTTTGTCGGTCACTTCTTCGGTATGCTGACGCCGCACTGGATGTATGAAGCCTGGCTGCCGATTGAAGTGAAACAGAAAATGGCAATGTTTGCTGGTGGTGCCAGCGGCGTGCTGTGTCTGATTGGCGGCGTGCTGTTGCTGAAACGTCGTCTGTTCAGCCCACGCGTGCGTGCAA > CP009273/1281368‑1281665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |