Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,296,729 | C→A | 100% | H431N (CAC→AAC) | oppA → | oligopeptide transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,296,729 | 0 | C | A | 97.8% | 1060.4 / 8.5 | 334 | H431N (CAC→AAC) | oppA | oligopeptide transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/5); new base A (178/148); total (181/153) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
GACAAACCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATGAATACCGCGCATTATAAGAGCCCGGCCTTTGACAGCATTATGGCGGAAACG > CP009273/1296582‑1296875 | aCAAACCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAAcc < 2:531669/150‑1 (MQ=255) aCAAACCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAAcc < 2:876723/150‑1 (MQ=255) aaaCCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAg < 1:3747390/150‑1 (MQ=255) aaCCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAgg > 2:3432649/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAggg < 1:5104003/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAggg < 1:2755050/150‑1 (MQ=255) ccGTTGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGt < 1:4779652/150‑1 (MQ=255) ttGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACt < 1:4500226/150‑1 (MQ=255) ttGACCATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACt < 1:2118587/150‑1 (MQ=255) ccATCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTg > 2:4216051/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAt < 1:1218860/150‑1 (MQ=255) cAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAtgt > 2:1766942/1‑150 (MQ=255) cAACCTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGAtgt > 2:1340092/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGc < 1:832247/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGcc < 2:2089719/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGcc > 2:2943576/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGcc < 2:4740899/150‑1 (MQ=255) tgttgtATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGccc < 2:1610906/150‑1 (MQ=255) ttgtATAACACCTCCTATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCACGt > 2:3010100/1‑150 (MQ=255) tgtATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTg < 2:2928878/150‑1 (MQ=255) tgtATAACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTg > 1:259212/1‑150 (MQ=255) tataACACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCa > 2:2462244/1‑150 (MQ=255) aaCACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGc > 2:2139462/1‑150 (MQ=255) aaCACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGc > 1:1646407/1‑150 (MQ=255) aaCACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGc > 2:2859388/1‑150 (MQ=255) aaCACCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGc > 2:3554823/1‑150 (MQ=255) acacCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCt < 1:3463813/150‑1 (MQ=255) acacCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCt > 1:4797677/1‑150 (MQ=255) acCTCCGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTgg > 2:363568/1‑150 (MQ=255) cGATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGc > 2:332613/1‑150 (MQ=255) gATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCt < 1:2917428/150‑1 (MQ=255) gATCTGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCt < 1:2571331/150‑1 (MQ=255) tGCATAAAAAGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACt > 2:660848/1‑150 (MQ=255) 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aaaaaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAAc > 2:1839125/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACg < 2:3993798/150‑1 (MQ=255) aaaaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACg < 2:3101624/150‑1 (MQ=255) aaaaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACg < 2:1038101/150‑1 (MQ=255) aaaaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACg > 1:1023951/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGaa < 2:4908416/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCa > 1:2685111/1‑150 (MQ=255) cTGGCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCa < 2:4125112/150‑1 (MQ=255) ggCGATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAAc > 2:3170680/1‑150 (MQ=255) gATTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAActtc > 2:4037052/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAActtcc < 2:5262822/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAActtcct < 2:4612347/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAActtcct < 2:2738960/150‑1 (MQ=255) ctgcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACttccttcc < 2:1594987/150‑1 (MQ=255) tgcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTtccttcct > 2:2733996/1‑150 (MQ=255) tgcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTtccttcct > 1:1930239/1‑150 (MQ=255) tgcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTtccttcct > 1:716288/1‑150 (MQ=255) tgcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTtccttcct > 2:1955041/1‑150 (MQ=255) gcCTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTg > 1:3318471/1‑150 (MQ=255) ccTCTTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGa < 1:1378823/150‑1 (MQ=255) tctTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAac < 1:4064347/150‑1 (MQ=255) ctTCATTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAaca > 2:3824318/1‑150 (MQ=255) aTTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCAt > 1:2302084/1‑150 (MQ=255) aTTGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCAt > 1:2175104/1‑150 (MQ=255) ttGTGGAAGAAAAACATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATg > 2:2302388/1‑150 (MQ=255) 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aaaaCATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGCGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACa > 1:1485929/1‑150 (MQ=255) aaCATTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGc > 2:4951177/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGTAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCg > 1:921108/1‑150 (MQ=255) gtgtAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTAACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATGa < 1:1340092/150‑1 (MQ=255) gtAAACGTCAAACTGGTTAACCAGGAGTGGAAAACGTTCCTCGACACCCGTCACCAGGGTACTTTTGATGTGGCCCGTGCAGGCTGGTGTGCTGACTACAACGAACCAACTTCCTTCCTGAACACCATGCTTTCGAACAGCTCGATGAAt < 1:3223958/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |