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| * | CP009273 | 1,421,685 | 0 | T | A | 12.0% | 1001.6 / 96.3 | 347 | pseudogene (40/210 nt) | lomR | pseudogene, Rac prophage lom homolog;Phage or Prophage Related; interrupted by IS5 and N‑ter deletion |
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Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
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cAAGAATCGCCAGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCgtgt > 1:2410830/1‑150 (MQ=255) aaGAATCGCCAGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCgtgtg > 1:1132062/1‑150 (MQ=255) aGAATCGCCAGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCgtgtgt < 2:760273/150‑1 (MQ=255) aGAATCGCCAGCTTACCCGTAACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCgtgtgt > 1:1059227/1‑150 (MQ=255) gAATCGCCAGCTTACCCGTTACAGCGAGACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTc < 2:4315591/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGAGTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGAc < 1:3051746/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACt < 1:626760/150‑1 (MQ=255) aGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTtct < 2:4478775/150‑1 (MQ=255) aGCTTACCCGTAACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTtct < 2:3979486/150‑1 (MQ=255) cTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTcc < 1:785429/150‑1 (MQ=255) cTTACCCGTAACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTcc > 1:5275475/1‑150 (MQ=255) ttACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCg > 2:334668/1‑150 (MQ=255) ttACCCGTAACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCg > 2:1023133/1‑150 (MQ=255) cGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGAt < 1:776208/150‑1 (MQ=255) gTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGAtt < 1:4721482/150‑1 (MQ=255) gTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGAtt > 2:2940406/1‑150 (MQ=255) tACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTAt > 1:4669788/1‑150 (MQ=255) | AAACAAACGGCTTTTGCTATGCGCATGTTGCCTGCACAAATGACGGATATTGTTGTTGGGTTGTCCACTGGTCAGTCGCCATTTATGGTGTTAATGCAGCAGGGCGGCCATTCAGCTATGCAGGAGACAAGAATCGCCAGCTTACCCGTTACAGCGATACCCGCTGGCATGAAGATTCCGTGCGTAACCGCTGGTTCAGCGTGATGGTGGGGCCGTCTGTGCGCGTGAATGAATGGTTCAGCGCGTATGCGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTAT > CP009273/1421536‑1421834 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |