Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,482,005 | G→T | 100% | D172Y (GAT→TAT) | ydcF → | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,482,005 | 0 | G | T | 100.0% | 1183.6 / ‑6.7 | 357 | D172Y (GAT→TAT) | ydcF | DUF218 superfamily protein, SAM‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (170/186); total (170/187) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
TCAACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGC > CP009273/1481858‑1482151 | tCAACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTAt < 1:3013131/150‑1 (MQ=255) tCAACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTAt > 1:5090570/1‑150 (MQ=255) aacccaCTGCGGTGAAAACGCACGCTTGAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGc < 1:1365331/145‑1 (MQ=255) cGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTg < 1:5006143/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTgg > 1:435764/1‑150 (MQ=255) gTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGt > 2:1790890/1‑150 (MQ=255) gAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa < 1:1987755/150‑1 (MQ=255) gAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTa < 2:5020158/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTaa > 2:3011348/1‑150 (MQ=255) aaaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAg < 2:558703/150‑1 (MQ=255) aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGt < 1:4462189/150‑1 (MQ=255) aaCGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGt < 1:1053495/150‑1 (MQ=255) acgcacgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGtt < 1:1280446/150‑1 (MQ=255) cacgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATc < 1:2313733/150‑1 (MQ=255) cacgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATc < 2:3631217/150‑1 (MQ=255) cgcTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATccc < 1:3152749/150‑1 (MQ=255) ttAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAt > 1:3562346/1‑150 (MQ=255) tAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGAtt < 2:2483026/150‑1 (MQ=255) aGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc > 1:4521429/1‑150 (MQ=255) aGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc > 1:3212121/1‑150 (MQ=255) aGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTc > 1:2433379/1‑150 (MQ=255) gcgcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCt < 2:4154229/150‑1 (MQ=255) gcTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCa > 2:2962474/1‑150 (MQ=255) cTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAg > 2:3664432/1‑150 (MQ=255) cTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAg < 1:3812721/150‑1 (MQ=255) aTTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGtt > 2:13072/1‑150 (MQ=255) gAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAgg > 2:3926472/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt > 2:1244813/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAAt > 1:41392/1‑150 (MQ=255) gCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAAc < 2:5120054/150‑1 (MQ=255) ccGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACg < 1:858893/150‑1 (MQ=255) cGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGGTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTGAAGTTATCCCGGCTTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGc > 2:2419065/1‑150 (MQ=255) gTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCa > 2:2336077/1‑150 (MQ=255) tAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAg > 1:2592514/1‑150 (MQ=255) gAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGAc > 2:1112597/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACa > 1:2325783/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACa < 1:2920387/150‑1 (MQ=255) gAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAgtg > 1:939101/1‑150 (MQ=255) gTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa > 2:2381072/1‑150 (MQ=255) gTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTa > 1:4827799/1‑150 (MQ=255) ttCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTaa < 1:1805261/150‑1 (MQ=255) aCGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCttt > 2:3417559/1‑150 (MQ=255) ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttat > 2:4427277/1‑150 (MQ=255) ggCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttat > 2:531270/1‑150 (MQ=255) gCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatt < 1:1124638/150‑1 (MQ=255) gCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatt < 2:3589659/150‑1 (MQ=255) cTATCGTTGTTCAGTACCCCACCATGCAGCGCCGCACGATCGCGACGAACCGCCGTATGACAGGTGACAAACACTAAGCACCACTATGGAAAAGATATCACGGATTAGATACTAAGAAATGAAAAAACGCAGACAGTGTAATCTttataa > 2:2633723/1‑148 (MQ=255) cTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTttatta > 1:3236733/1‑150 (MQ=255) tATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTATGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTaa < 2:4673045/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAAt > 2:3132615/1‑150 (MQ=255) aTCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAAt < 1:4912370/150‑1 (MQ=255) tCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATc < 2:669159/150‑1 (MQ=255) gttgttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAg < 2:2181315/150‑1 (MQ=255) gttgttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGAGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATCAATCAg < 1:1497565/150‑1 (MQ=255) gttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTa > 2:318355/1‑150 (MQ=255) ttCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTAc < 2:194851/150‑1 (MQ=255) tCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACa > 1:3393686/1‑150 (MQ=255) ggACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAgg < 2:1985966/150‑1 (MQ=255) 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aTGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCa < 1:3890240/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAg > 2:1538092/1‑150 (MQ=255) cGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtc < 1:5153832/150‑1 (MQ=255) gATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtct < 2:3366755/150‑1 (MQ=255) gATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTAtct < 2:3309362/150‑1 (MQ=255) 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gTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCactact > 2:4063395/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTc < 2:4378061/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCa < 1:567479/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCa > 2:5099641/1‑150 (MQ=255) ccgccgTATGACTGGGGACAATCCCTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCAc < 1:2140206/150‑1 (MQ=255) 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cccTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTAcgc > 1:121318/1‑150 (MQ=255) cccTATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATAAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGACGCGTTTAcgc > 1:2808911/1‑150 (MQ=255) | TCAACAAACTGCGGTGAAAACGCACGCTTTAGCATCGCGCTATTGAATCAGGCCGTAGAACGAGTTCATACGGCTATCGTTGTTCAGGACCCCACCATGCAGCGGCGCACGATGGCGACGTTCCGCCGTATGACTGGGGACAATCCCGATGCACCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTTTATTAATCAGTTACAAGGATTATGGCCAGTTGAGCGTTATCTCTCACTACTCACTGGCGAGCTGCCGCGTTTACGC > CP009273/1481858‑1482151 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |