| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,643,955 | C→A | 74.0% | A30A (GCC→GCA) | dicB → | Qin prophage; cell division inhibition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,643,955 | 0 | C | A | 74.0% | 484.4 / 288.9 | 353 | A30A (GCC→GCA) | dicB | Qin prophage; cell division inhibition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/57); new base A (145/116); total (180/173) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.13e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
AACGTCACCTGGAGGCACCAGGCACTGCATCACAAAATTCATTGTTGAGGACGCGATAATGAAAACGTTATTACCAAACGTTAATACGTCTGAAGGTTGTTTTGAAATTGGTGTCACTATCAGTAACCCAGTATTTACTGAAGATGCCATTAACAAGAGAAAACAAGAACGGGAGCTATTAAATAAAATATGCATTGTTTCAATGCTGGCTCGTTTACGTCTGATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCA > CP009273/1643808‑1644104 | aaCGTCACCTGGAGGCACCAGGCACTGCATCACAAAATTCATTGTTGAGGACGCGATAATGAAAACGTTATTACCAAACGTTAATACGTCTGAAGGTTGTTTTGAAATTGGTGTCACTATCAGTAACCCAGTATTTACTGAAGATGCAAt < 2:5301772/150‑1 (MQ=255) cGTCACCTGGAGGCACCAGGCACTGCATCACAAAATTCATTGTTGAGGACGCGATAATGAAAACGTTATTACCAAACGTTAATACGTCTGAAGGTTGTTTTGAAATTGGTGTCACTATCAGTAACCCAGTATTTACTGAAGATGCCATTa < 1:4510614/150‑1 (MQ=255) cACCTGGAGGCACCAGGCACTGCATCACAAAATTCATTGTTGAGGACGCGATAATGAAAACGTTATTACCAAACGTTAATACGTCTGAAGGTTGTTTTGAAATTGGTGTCACTATCAGTAACCCAGTATTTACTGAAGATGCCATTAACa > 1:2477031/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |