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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,672,692 | 0 | T | A | 7.8% | 1048.0 / 57.2 | 345 | L3L (CTT→CTA) | ydgH | DUF1471 family periplasmic protein |
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Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
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aaGGATTATTTTTATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGtgt > 1:3641315/1‑148 (MQ=255) gATTATTTTTATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGtgtgta > 1:4077696/1‑145 (MQ=255) attattTTTATGAAGCTTCAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAAt < 2:3723714/150‑1 (MQ=255) attattTTTATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCCCTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAAt < 2:1295271/150‑1 (MQ=255) attattTTTATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAAt < 1:1987788/150‑1 (MQ=255) attattTTTATGAAGCTAAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAAt > 1:2620981/1‑150 (MQ=255) ttattTTTATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAATg < 1:4455026/150‑1 (MQ=255) ttATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTTATTCTAttt > 2:1917801/1‑149 (MQ=255) ttATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAATGCTATTg < 1:814746/150‑1 (MQ=255) ttATGAAGCTTAAGAACACCCTCCTGGCGTCGGCACTGCTTTCTGCTATGGCATTCTCCGTTAACGCAGCAACAGAACTGACACCGGAGCAAGCGGCAGCGGTTAAACCTTTTGACCGTGTAGTGGTTACCGGTCGTTTTAATGCTATTg < 1:1757201/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |