Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 1,675,261 | T→A | 6.8% | L10* (TTA→TAA) | folM → | dihydromonapterin reductase, NADPH‑dependent; dihydrofolate reductase isozyme |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,675,261 | 0 | T | A | 6.8% | 894.3 / 40.3 | 294 | L10* (TTA→TAA) | folM | dihydromonapterin reductase, NADPH‑dependent; dihydrofolate reductase isozyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (142/131); new base A (13/7); total (155/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
TAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTT > CP009273/1675112‑1675410 | aTGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATattaa > 1:1086913/1‑150 (MQ=255) tGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATataaat < 1:155614/150‑1 (MQ=255) gTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCGGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATattaatt < 1:3401216/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |