| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,700,008 | T→A | 25.4% | intergenic (+61/‑16) | ydgK → / → rsxA | DUF2569 family inner membrane protein/SoxR iron‑sulfur cluster reduction factor component; inner membrane protein of electron transport complex |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 1,700,008 | 0 | T | A | 25.4% | 551.7 / 211.9 | 295 | intergenic (+61/‑16) | ydgK/rsxA | DUF2569 family inner membrane protein/SoxR iron‑sulfur cluster reduction factor component; inner membrane protein of electron transport complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (111/109); new base A (42/33); total (153/142) | |||||||||||
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Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
AGTTGCTGTTTACTTTGTTGGCAACCGCATTGATCGTCCCCTATTTCAAACGCTCGTCGCGGGTAAAAGCGACGTTTGTGAATCCGTAATAACCTTACAGTTAACCTGTTGTCGCCTGCTCTGGATTAACGGATAATAGGCGGCTTTTTTATTTCAGGCCGAAAAATGACTGACTACCTGTTACTGTTTGTCGGAACTGTACTGGTCAATAACTTTGTACTGGTCAAGTTTCTCGGTCTCTGTCCGTTTATGGGGGTTTCCAAAAAACTGGAAACCGCGATGGGCATGGGGCTGGCA > CP009273/1699859‑1700155 | agCTGTTTACTTTGTTGGCAACCGCATTGATCGTCCCCTATTTCAAACGCTCGTCGCGGGTAAAAGCGACGTTTGTGAATCCGTAATAACCTTACAGTTAACCTGTTGTCGCCTGCTCTGGATTAACGGATAATAGGCGGCTTTTTTAtt < 1:3132854/149‑1 (MQ=255) agCTGTTTACTTTGTTGGCAACCGCATTGATCGTCCCCTATTTCAAACGCTCGTCGCGGGTAAAAGCGACGTTTGTGAATCCGTAATAACCTTACAGTTAACCTGTTGTCGCCTGCTCTGGATTAACGGATAATAGGCGGCTTTTTTAtt < 2:1186671/149‑1 (MQ=255) gCTGTTTACTTTGTTGGCAACCGCATTGATCGTCCCCTATTTCAAACGCTCGTCGCGGGTAAAAGCGACGTTTGTGAATCCGTAATAACCTTACAGTTAACCTGTTGTCGCCTGCTCTGGATTAACGGATAATAGGCGGCTTTATTAttt > 1:3513996/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |