| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,735,082 | G→T | 60.0% | V305V (GTG→GTT) | ydhC → | putative arabinose efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,735,082 | 0 | G | T | 60.0% | 88.3 / inf | 305 | V305V (GTG→GTT) | ydhC | putative arabinose efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/59); new base T (107/76); total (170/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
TATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCT > CP009273/1734933‑1735228 | tATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCtgtgtg < 2:3673406/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGAGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTAt > 1:1020552/1‑150 (MQ=255) gCTGTCGCGCCGCGCTGCAGATATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATgg < 1:4798850/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATgg < 1:1339107/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATgg < 1:4583315/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGa < 2:185318/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGAt < 1:2715226/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGAt < 1:4167896/150‑1 (MQ=255) cgccgcgcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGc > 2:1077302/1‑150 (MQ=255) gccgcgcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGcc < 1:5302411/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCaa > 1:182089/1‑150 (MQ=255) cTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGgc < 1:3186083/150‑1 (MQ=255) tGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGgcg > 1:1917823/1‑150 (MQ=255) tGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGgcg < 1:2625644/150‑1 (MQ=255) gAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGAt < 2:24744/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCTCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCt < 1:4122500/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCt < 1:1223341/150‑1 (MQ=255) aaTGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCt < 2:557489/150‑1 (MQ=255) ggcaaggcaaGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTAcc > 1:1487605/1‑150 (MQ=255) caaggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCt < 1:847222/150‑1 (MQ=255) aggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAt < 2:202903/150‑1 (MQ=255) aggcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAt > 2:1668686/1‑150 (MQ=255) gcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTCTGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAttg > 2:1208940/1‑150 (MQ=255) gcaagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAttg > 2:1549490/1‑150 (MQ=255) aagCAGTTATTCCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAttgtt < 2:384382/150‑1 (MQ=255) aagCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTAttgtt > 1:2155484/1‑150 (MQ=255) aGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCg < 2:4415572/150‑1 (MQ=255) gTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGc > 2:1005942/1‑150 (MQ=255) ttaCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAg > 2:1661371/1‑150 (MQ=255) taCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAgg < 2:4701617/150‑1 (MQ=255) aCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGgc > 1:2460734/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGgc > 1:2460789/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCt > 2:1758345/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCt > 2:3177001/1‑150 (MQ=255) gTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCt > 2:1940284/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTg < 2:2089800/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCg > 2:4538179/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGt > 1:3693377/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTccc > 2:847400/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCt > 1:3876284/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTc > 2:2146095/1‑150 (MQ=255) gTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCcaca > 1:959517/1‑150 (MQ=255) gTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCcaca < 1:5038260/150‑1 (MQ=255) 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cGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcg < 2:3547667/150‑1 (MQ=255) cGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTcg < 2:3046563/150‑1 (MQ=255) aTTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGcgcc > 1:539281/1‑150 (MQ=255) aTTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTACCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGcgcc > 1:4052930/1‑150 (MQ=255) ttGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGcgccg > 1:4028815/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGc > 2:4611034/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTg > 1:5176303/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTg < 2:4166748/150‑1 (MQ=255) tGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTg < 1:676386/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCa > 2:4979252/1‑150 (MQ=255) 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ggCGTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACAct < 2:1455448/150‑1 (MQ=255) cTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACActct > 2:2841925/1‑150 (MQ=255) cTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACActct > 2:5135658/1‑150 (MQ=255) cTTCATGAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACActct < 2:3256522/150‑1 (MQ=255) cATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCa < 1:1933023/150‑1 (MQ=255) 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ggTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCt < 1:2093898/150‑1 (MQ=255) gTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTc < 1:2120777/150‑1 (MQ=255) gAAATCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCa > 2:764081/1‑150 (MQ=255) gAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCa < 1:3661509/150‑1 (MQ=255) aaaTCCTGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCaa > 1:313895/1‑150 (MQ=255) 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tGATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTgg > 2:4905820/1‑150 (MQ=255) tGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTgg < 1:1668686/150‑1 (MQ=255) gATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGt > 1:2502397/1‑150 (MQ=255) gATCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGt > 1:1784226/1‑150 (MQ=255) aTCCCATTCTGTGTTATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTa > 1:3009137/1‑150 (MQ=255) 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tgtgtgATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTgg > 1:3285209/1‑150 (MQ=255) tgtgtgATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTgg > 1:3898215/1‑150 (MQ=255) | TATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCCCAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCT > CP009273/1734933‑1735228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |