Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,755,150 | A→T | 75.5% | L300* (TTG→TAG) | sufD ← | component of SufBCD Fe‑S cluster assembly scaffold |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,755,150 | 0 | A | T | 75.5% | 553.0 / 209.7 | 298 | L300* (TTG→TAG) | sufD | component of SufBCD Fe‑S cluster assembly scaffold |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/46); new base T (98/126); total (125/173) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.48e-01 |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CCAGCTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACACT > CP009273/1755001‑1755296 | gCTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACt < 2:5209123/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTg > 1:4720545/1‑150 (MQ=255) gCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTc < 2:2539872/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCg < 2:4664391/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCgg > 2:570057/1‑150 (MQ=255) tttCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCCCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCt < 2:2860284/150‑1 (MQ=255) cGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGtt < 1:4881898/150‑1 (MQ=255) agTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTTGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGtt > 2:3415574/2‑150 (MQ=255) gTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTa > 2:3401800/1‑150 (MQ=255) gTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTATGTGCTACTGTCGGCTGTTa > 2:5083316/1‑150 (MQ=255) tATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTAc < 1:2582704/150‑1 (MQ=255) aTCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACa > 1:1494068/1‑150 (MQ=255) cACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGAGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaaa < 1:3831862/150‑1 (MQ=255) aCTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCATTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACaaaaa > 2:4858478/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAAcc < 1:545142/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCttt < 1:3525497/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCtgt > 2:4390436/1‑148 (MQ=255) gCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTa > 2:4117864/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTa > 1:3421012/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTa > 1:5019935/1‑150 (MQ=255) ccAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTAt < 1:387594/150‑1 (MQ=255) cAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTAtt < 1:786413/150‑1 (MQ=255) aGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATtg > 1:1910636/1‑150 (MQ=255) aGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATtg < 1:3374810/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATtgt > 2:5025330/1‑150 (MQ=255) tttGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATtgtg < 2:1158004/150‑1 (MQ=255) tttGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATtgtg < 2:3649239/150‑1 (MQ=255) tGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCATACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGATGTTACAAAAACCTTTATTGTGtt < 1:4157863/150‑1 (MQ=255) gCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTc < 2:2267183/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagcc > 1:5308623/1‑150 (MQ=255) cagcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATCCCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagcca < 2:2937695/150‑1 (MQ=255) cagcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagcca < 1:2862852/150‑1 (MQ=255) agcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTccagccag > 1:4093790/1‑150 (MQ=255) gcagATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAgg > 2:12436/1‑150 (MQ=255) agATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTa > 2:4544434/1‑150 (MQ=255) agATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTa < 2:1268003/150‑1 (MQ=255) agATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTa > 1:5098319/1‑150 (MQ=255) gATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTAc > 1:224325/1‑150 (MQ=255) gttgttgGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGt > 1:3961128/1‑150 (MQ=255) gttgttgGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGt > 2:744300/1‑150 (MQ=255) gttgGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATc < 1:1118512/150‑1 (MQ=255) ggTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATcaca > 1:3866968/1‑150 (MQ=255) ggTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATcaca > 1:3321353/1‑150 (MQ=255) gTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATcacac < 2:103999/150‑1 (MQ=255) tCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATcacaca < 2:1804900/150‑1 (MQ=255) aTCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACAcc > 2:3685696/1‑150 (MQ=255) cTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTACATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTc < 2:4273065/150‑1 (MQ=255) tgtccATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCg > 2:4488509/4‑150 (MQ=255) gACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCATTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGCGTATCACACACCTCGt > 1:142587/1‑150 (MQ=255) cATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGtttt > 2:2618148/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCAc < 2:68032/150‑1 (MQ=255) gTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCAcc > 2:2157012/1‑150 (MQ=255) gTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCAcc < 1:4278977/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGc > 2:5267614/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGc > 2:5266732/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGc > 2:3967834/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCa > 2:1701825/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAACTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAg < 2:3817839/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAg < 1:4343673/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAg < 1:4433687/150‑1 (MQ=255) ctgcGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCt > 1:3262706/1‑150 (MQ=255) tgcGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGGTAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTa < 2:961296/150‑1 (MQ=255) cgcgACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTAtt < 1:5238129/150‑1 (MQ=255) cgcgACGTTAATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTAtt < 1:3099093/150‑1 (MQ=255) gcgACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTg < 2:1071814/150‑1 (MQ=255) gACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGAt > 2:4926517/1‑150 (MQ=255) aCGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATc < 1:2746517/150‑1 (MQ=255) cGTTGATCAATCCGTTAAATACCGCGCGGCCATTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATcc < 1:2872848/150‑1 (MQ=255) gTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCg < 2:515872/150‑1 (MQ=255) tGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCa > 2:213371/1‑150 (MQ=255) ccGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTg < 2:3321258/150‑1 (MQ=255) cGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGt > 1:4021260/1‑150 (MQ=255) ttAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGttt < 2:3893247/150‑1 (MQ=255) ttAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGttt < 2:4025339/150‑1 (MQ=255) ttAAAGACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTGATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGttt < 2:3203916/150‑1 (MQ=255) tAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGtttt < 1:570057/150‑1 (MQ=255) aaaTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTc < 1:2953514/150‑1 (MQ=255) aaTACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCg > 1:4593996/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCAt > 1:1190360/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCAtt < 2:2168196/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCAtt < 2:2414510/150‑1 (MQ=255) gcgGCCTGTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAg < 1:3625701/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGtt > 1:321892/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGtt > 1:726352/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGtt < 1:4928551/150‑1 (MQ=255) cTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCg < 2:306395/150‑1 (MQ=255) cTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCg > 1:157730/1‑150 (MQ=255) cTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCg < 2:1595859/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACt < 2:3514588/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACt < 1:1640432/150‑1 (MQ=255) cGCTGACGATAGTTTTGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTgg < 1:1799846/150‑1 (MQ=255) cGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTgg > 2:1432615/1‑150 (MQ=255) gATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTtgtg > 2:1879387/1‑150 (MQ=255) ttttGTGCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTa < 1:1397328/150‑1 (MQ=255) ttGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAac < 2:1644979/150‑1 (MQ=255) ttGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAac < 2:4305740/150‑1 (MQ=255) gtgCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAacac < 2:2450951/150‑1 (MQ=255) tgCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACACt < 2:1499658/150‑1 (MQ=255) tgCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACACt < 2:4426794/150‑1 (MQ=255) tgCTACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACACt < 2:4223735/150‑1 (MQ=255) | CCAGCTGCGGTTTCGTATCCACTTCCGCCAGTTTGCCCATCAGCAGATTGTTGTTGGTCATCTGACCATCCGTTTTGATGGCGTGCTGCGCGACGTTGATCAAACCGTTAAATACCGCGCGGCCTTTGTCGCTGACGATAGTTTTGTGCAACTGTCGGCTGTTACAAAAACCTTTATTGTGTTCCAGCCAGGTACGGGTATCACACACCTCGTTTTTCACCGGCATCGCCAGGCTATTGATCCGCAGCGTGCTGTTTTCGCCATTGAGTTGCGTACTGGTGTTGTGTCGTAACACT > CP009273/1755001‑1755296 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |