Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,796,101 | C→A | 100% | D243Y (GAC→TAC) | thrS ← | threonyl‑tRNA synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,796,101 | 0 | C | A | 97.6% | 952.5 / 10.1 | 309 | D243Y (GAC→TAC) | thrS | threonyl‑tRNA synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/6); new base A (135/166); total (137/172) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CCTGATACTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTCGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACATTTTGTTGTTGCTGTCGCCACGCCAGTAAGCCCCTGCCGTTTTCATTAGTTTGAAATGAT > CP009273/1795954‑1796247 | ccTGATACTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTagc < 1:1127989/150‑1 (MQ=255) cTGATACTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTagcg > 1:3310798/1‑150 (MQ=255) aTACTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTCGCGttt > 1:7228/1‑150 (MQ=255) tACTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTc > 1:3226435/1‑150 (MQ=255) aCTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTcg > 1:2883170/1‑150 (MQ=255) aCTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTcg > 1:160764/1‑150 (MQ=255) aCTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTAAGGTGGTAGCGTTTcg > 1:23588/1‑150 (MQ=255) aCTGGTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTACTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTTGTAGAGTTTcg > 2:1137209/1‑150 (MQ=255) gTACTCTTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGc > 1:872221/1‑150 (MQ=255) tctTTCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCTTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGcttct < 1:638731/150‑1 (MQ=255) tCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCa > 1:2133345/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCa < 1:2309971/150‑1 (MQ=255) tCAGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTCTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCa < 1:5127416/150‑1 (MQ=255) tCAGATTAGAACGAACAAACACCTCCAGTTCACGGAAGATTGTCCAGACGTCGTTGTGCAAGAATACCATACCAGGCGCTTCTTCCTGCATATGTTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCa < 2:656196/150‑1 (MQ=255) aGTTTAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAgg > 1:4870630/1‑150 (MQ=255) ttAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGgcgc > 1:47608/1‑150 (MQ=255) ttAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGgcgc > 2:5250706/1‑150 (MQ=255) tAGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCt > 2:433004/1‑150 (MQ=255) aGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTg < 1:1058649/150‑1 (MQ=255) aGAACGAACAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTg > 2:1061038/1‑150 (MQ=255) aacgaacAAACACTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCa < 2:4625348/150‑1 (MQ=255) caaacaCTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAg > 1:296967/1‑150 (MQ=255) aaacaCTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGc > 1:3011766/1‑150 (MQ=255) aaacaCTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGc > 1:1769764/1‑150 (MQ=255) aaacaCTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGc < 2:2555656/150‑1 (MQ=255) aacaCTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTCGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCg < 2:4062336/150‑1 (MQ=255) acacTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGt > 2:3389424/1‑150 (MQ=255) cacTTCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGtt < 1:2173931/150‑1 (MQ=255) tCCAGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGt < 1:3663272/150‑1 (MQ=255) aGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCt > 2:3982770/1‑150 (MQ=255) aGTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCGTCTTCCAGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGGGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTGAATTGCt > 1:3089092/1‑150 (MQ=255) gTTCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCtt < 1:832625/150‑1 (MQ=255) ttCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCttt < 1:4946860/150‑1 (MQ=255) tCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCtttt < 1:2249281/150‑1 (MQ=255) tCACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCtttt < 1:139097/150‑1 (MQ=255) cACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCttttt < 1:532826/150‑1 (MQ=255) cACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCttttt > 2:3802575/1‑150 (MQ=255) cACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCttttt < 1:4525125/150‑1 (MQ=255) cACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTACAGGCGCTGCAGGTAAGCGGTAAGTGCttttt > 1:2077430/1‑150 (MQ=255) cACGGAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGGTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGGTAAGTGCttttt > 2:4071258/1‑150 (MQ=255) ggAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGt > 2:4846432/1‑150 (MQ=255) ggAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGt < 2:1113941/150‑1 (MQ=255) ggAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCGTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGt > 2:4495071/1‑150 (MQ=255) gAAGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTc > 2:1220742/1‑150 (MQ=255) aaGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCt < 1:948179/150‑1 (MQ=255) aGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTg > 2:1798059/1‑150 (MQ=255) aGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTg > 2:4178807/1‑150 (MQ=255) aGATGGTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTAAGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGGTTAGTGCTTTTTTTTCtt > 1:76268/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCAc > 2:1260547/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGTTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGccgt > 2:1872646/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTTTCTGCCCACGccgtac > 2:4918985/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGccgtac < 2:3129794/150‑1 (MQ=255) gtcgtTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCACGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGccgtacc < 1:1034226/150‑1 (MQ=255) tcgtTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGccgtaccg < 2:1772982/150‑1 (MQ=255) cgtTGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGccgtaccgt > 2:2815032/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCAGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTaa < 1:4822266/150‑1 (MQ=255) tgtgCCAGAATACCATACCCGGCGCGTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTAGCGGCGTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACCCCCTACCGTaaa > 1:2026425/1‑150 (MQ=255) aGAATACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGtt < 1:4106496/150‑1 (MQ=255) aaTACCATACCCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGc < 1:3189318/150‑1 (MQ=255) taccataccCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAATCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCaa > 2:4464546/1‑150 (MQ=255) accataccCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAAc < 1:4621447/150‑1 (MQ=255) ccataccCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCACGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACa < 2:4724166/150‑1 (MQ=255) cataccCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACAt < 1:4963305/150‑1 (MQ=255) cataccCGGAGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACAt > 2:594350/1‑150 (MQ=255) accCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACAtttt < 2:3618911/150‑1 (MQ=255) accCGGCGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACAtttt < 1:1175985/150‑1 (MQ=255) cccGGAGCTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTGTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACATTttg < 2:2936404/150‑1 (MQ=255) cgcTTCTTCCTGCATATGGTACAGGTCGAGCTGTTTACCGATTTTACGGTGGTAGCGTTTCGCGGCTTCTTCCAGGCGCTGCAGGTAAGCGTTAAGTGCTTTTTTGTCTGCCCACGCCGTACCGTAAATACGTTGCAACATTttgttgtt < 2:737763/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |