| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,940,498 | G→T | 100% | intergenic (‑61/‑10) | yobI ← / → yebB | uncharacterized protein/DUF830 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,940,498 | 0 | G | T | 99.2% | 1190.2 / ‑0.2 | 372 | intergenic (‑61/‑10) | yobI/yebB | uncharacterized protein/DUF830 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (184/183); total (188/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
CAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACG > CP009273/1940351‑1940643 | caGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTaa > 2:2378354/1‑150 (MQ=255) aGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAAt > 1:1031320/1‑150 (MQ=255) aGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAAt > 1:4299919/1‑150 (MQ=255) gTATAATTTATTCTACAGTTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATg < 1:1623269/150‑1 (MQ=255) gTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATg > 1:1848576/1‑150 (MQ=255) ataATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGAc > 1:3244340/1‑150 (MQ=255) ataATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGAc < 1:5194508/150‑1 (MQ=255) taATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACa > 2:5018423/1‑150 (MQ=255) taATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACa < 1:3637238/150‑1 (MQ=255) aaTTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACaa > 2:256831/1‑150 (MQ=255) tttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACg < 2:4823629/150‑1 (MQ=255) tttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACg < 2:3949758/150‑1 (MQ=255) ttATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGt > 2:1800208/1‑150 (MQ=255) aTTCTACAGGTTATATTGGAAGCAACTATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGa < 2:3170314/150‑1 (MQ=255) aTTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGa < 2:4747918/150‑1 (MQ=255) tCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAat < 1:640767/150‑1 (MQ=255) cTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAata > 1:1332999/1‑150 (MQ=255) tACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAatat < 2:877758/150‑1 (MQ=255) aCAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatt < 2:3752145/150‑1 (MQ=255) aCAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatt < 2:4671450/150‑1 (MQ=255) cAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATatta > 1:4012115/1‑150 (MQ=255) aGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaa < 1:5029105/150‑1 (MQ=255) aGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaa > 2:1589129/1‑150 (MQ=255) ggTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaat < 1:2091483/150‑1 (MQ=255) gTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaatt < 1:959037/150‑1 (MQ=255) gTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaatt < 1:3560626/150‑1 (MQ=255) ttATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATattaatta < 2:4985020/150‑1 (MQ=255) tataTTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAc > 1:3341130/1‑150 (MQ=255) atatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAcc > 1:3196698/1‑150 (MQ=255) atatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAcc < 1:2607169/150‑1 (MQ=255) atatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATAGTAATTAcc > 2:2836761/1‑150 (MQ=255) tatTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTAccc > 2:3697711/1‑150 (MQ=255) atTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCct > 1:377764/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTCATGACAACGAGAATATTAATTACCctgct > 1:794437/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCctgct < 1:1240644/150‑1 (MQ=255) cAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAata < 2:2077483/150‑1 (MQ=255) cAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAata < 1:4573983/150‑1 (MQ=255) atatTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGa < 2:4238379/150‑1 (MQ=255) tatTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGaa > 1:113745/1‑150 (MQ=255) tttAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAAtt < 1:4849785/150‑1 (MQ=255) tAATATTACATATTCAGTTAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTgg < 2:3062779/150‑1 (MQ=255) tAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTgg > 2:1061145/1‑150 (MQ=255) atatTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgag < 1:4717373/150‑1 (MQ=255) atatTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGgag < 1:2436579/150‑1 (MQ=255) atTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGat < 1:3502915/150‑1 (MQ=255) atTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATCGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGat < 2:1296514/150‑1 (MQ=255) ttACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGata > 2:3616055/1‑150 (MQ=255) tACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGAAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGatat > 1:2852020/1‑150 (MQ=255) atatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGt > 2:935818/1‑150 (MQ=255) tatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTc < 1:1014869/150‑1 (MQ=255) tatTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTc > 2:4432037/1‑150 (MQ=255) atTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCt < 2:838925/150‑1 (MQ=255) atTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCt > 1:3398411/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCTTCTTTACAt > 2:4109657/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACAt < 1:5300890/150‑1 (MQ=255) aagaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt < 1:4173884/150‑1 (MQ=255) aagaaATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATAGTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACACTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGt > 2:3825691/1‑150 (MQ=255) tGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGt < 1:2367367/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 1:2142707/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 1:2011767/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 1:4494861/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 2:2683860/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCtt < 2:216966/150‑1 (MQ=255) aaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTa < 2:1480615/150‑1 (MQ=255) aaaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTa < 1:4410977/150‑1 (MQ=255) aaaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAt < 1:722999/150‑1 (MQ=255) aaTATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAtt > 1:4809591/1‑150 (MQ=255) atatACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAttt > 2:5248567/1‑150 (MQ=255) atatACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTAttt < 2:1150193/150‑1 (MQ=255) ataCATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATTAATAGGTGCTGCCTTATTTgg > 2:4335893/1‑150 (MQ=255) gcgcCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAata > 2:2932144/1‑150 (MQ=255) cgcCTCCTGAAAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAata > 2:552100/1‑150 (MQ=255) cctG‑AAAATATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCt < 2:4544462/150‑1 (MQ=255) tG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGc < 1:1407306/150‑1 (MQ=255) g‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCa > 2:1953913/1‑150 (MQ=255) g‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCa < 1:4549723/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt < 2:3032939/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt < 2:1182444/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCAATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATATGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCAt > 1:893421/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATc > 2:2604233/1‑150 (MQ=255) aaaaTAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCa > 2:3661615/1‑150 (MQ=255) aataaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCaaa > 1:1860318/1‑150 (MQ=255) aataaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCaaa > 1:4993420/1‑150 (MQ=255) aaatTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTg < 1:1664531/150‑1 (MQ=255) ttttttATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTg > 1:1072439/1‑150 (MQ=255) ttttATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGa < 1:507201/150‑1 (MQ=255) tttATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAg < 1:1787134/150‑1 (MQ=255) tATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACTTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGAATCAAATTGCTGGAGTa > 1:4500423/1‑150 (MQ=255) tATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTa < 2:5056087/150‑1 (MQ=255) aTGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTaa > 1:2943476/1‑150 (MQ=255) aTTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACg < 2:3244340/150‑1 (MQ=255) aTTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACg > 1:2246661/1‑150 (MQ=255) gTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCggg > 2:3411064/1‑150 (MQ=255) gTATATTTGTATCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCggg > 1:3841498/1‑150 (MQ=255) aTCTATTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCg < 1:2755185/150‑1 (MQ=255) aTTTCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCa > 2:3562853/1‑150 (MQ=255) tttCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCAt < 2:3921667/150‑1 (MQ=255) tCAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATaa > 1:196291/1‑150 (MQ=255) cAATGTAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAAc < 2:1332999/150‑1 (MQ=255) aaTGTAATGACAACGTGAATATTAATTAACCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTTGTCAATTATCAGATGAATCAAATTGCTGGAGTAATAACTTCGGGATCATTATATGTCATAACg > 1:3676320/1‑150 (MQ=255) | CAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACATTGCGCCTCCTG‑AAAAAATAAATTTTTTATGCTATTACGTATATTTGTATCTATTTCAATGGAATGACAACGTGAATATTAATTACCCTGCTGAATATGAAATTGGAGATATCGTCTTTACATGTATAGGTGCTGCCTTATTTGGTCAAATATCAGCTGCATCAAATTGCTGGAGTAATCACGTCGGGATCATTATCGGTCATAACG > CP009273/1940351‑1940643 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |