| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP009273 | 23,320 | T→A | 58.8% | F310L (TTT→TTA) | ileS → | isoleucyl‑tRNA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP009273 | 23,320 | 0 | T | A | 58.8% | 185.5 / 309.7 | 259 | F310L (TTT→TTA) | ileS | isoleucyl‑tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/67); new base A (81/71); total (121/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.61e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TATGCGCTGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTATGGGCTTCGACGTTCCGGCAATCCTCGGCGATCACGTTACCCTGGATGCCGGTACCGGTGCCGTTCACACCGCGCCTGGCCACGGCCCGGACGACTATGTGATCGGTCAGAAATACGGCCTGGAAACCGCTAACCCGGTTGGCCC > CP009273/23171‑23466 | aTGCGCTGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTa > 2:4254199/1‑150 (MQ=255) cgcTGGTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTGGCGAAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGCAGCGTATCGGCGTGACCGATTACACCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACCCATCCGTTTATgg < 2:2000672/150‑1 (MQ=255) gTGCAGATCGACGGTCAGGCCGTGATTCTTGCTTAAGATCTGGTTGAAAGCGTAATGAATATTATCGGAGTGACAGATTTCTCCATTCTCGGCACGGTAAAAGGTGCGGAGCTTGAGCTGCTGCGCTTTACACATCAGTTTATGGTCTTc < 2:2549117/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |