| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,027,334 | G→T | 7.7% | intergenic (+114/‑198) | rseX → / → yedS | sRNA antisense regulator of ompA and ompC translation, Hfq‑dependent/pseudogene, outer membrane protein homology; putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,027,334 | 0 | G | T | 7.7% | 1311.2 / 48.4 | 387 | intergenic (+114/‑198) | rseX/yedS | sRNA antisense regulator of ompA and ompC translation, Hfq‑dependent/pseudogene, outer membrane protein homology; putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (138/217); new base T (16/16); total (154/233) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
ATATTTTTTGGGCCGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATAACG > CP009273/2027185‑2027483 | ttttGGGCCGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAatat < 2:1261139/150‑1 (MQ=255) tttGGGCCGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAatatt > 2:1905172/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAatattt < 2:1994121/150‑1 (MQ=255) gggCCGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAatatttat < 2:478007/150‑1 (MQ=255) cGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAatatttatattt > 2:3799402/1‑150 (MQ=255) cGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAatatttatattt > 1:3078927/1‑150 (MQ=255) ggCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAAtatttatattta < 1:2653653/150‑1 (MQ=255) gCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAg < 1:755401/150‑1 (MQ=255) atgatgCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGaa > 2:2517988/1‑150 (MQ=255) atgatgCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCAAAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGaa > 1:4661634/1‑150 (MQ=255) tgatgCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAAt > 1:1875799/1‑150 (MQ=255) tgatgCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAAt < 2:4853710/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATaa < 2:3591529/150‑1 (MQ=255) ggCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAAt < 2:1179927/150‑1 (MQ=255) ggCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAAt < 1:569244/150‑1 (MQ=255) ggCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAAt < 2:3930747/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAAtt < 2:5243480/150‑1 (MQ=255) cTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTATAATTCATAATTa > 2:4112044/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTa > 2:4406405/1‑150 (MQ=255) tATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCCGCCGTTTGGCGCAACAATCCTTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATtat < 2:2723472/150‑1 (MQ=255) tATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATtat < 2:3064370/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCGTTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTatat > 2:1470002/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTTAATGTGCGCCTGATCACCCCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATAtt < 2:536777/150‑1 (MQ=255) tCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAAt < 1:2204641/150‑1 (MQ=255) caatAATGTGCGCCATATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATa < 1:4510186/147‑1 (MQ=255) cATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATa > 2:4586276/1‑150 (MQ=255) aTTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATGTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAg < 2:2408378/150‑1 (MQ=255) tAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGAt > 2:4812272/1‑150 (MQ=255) tgtgCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATACTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAg > 2:3379615/1‑150 (MQ=255) tgCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTCTGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGaa < 1:3724215/150‑1 (MQ=255) gcCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACCTATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAATAATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACa > 2:5155610/1‑150 (MQ=255) gATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACAtttt < 2:2562692/150‑1 (MQ=255) aTCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTg < 2:3484739/150‑1 (MQ=255) tCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGa < 1:2466608/150‑1 (MQ=255) cacCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGatat < 2:3864229/150‑1 (MQ=255) acCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGatata > 1:3368184/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCt < 1:4296068/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCtt < 1:2636833/150‑1 (MQ=255) aGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCttt < 1:2693187/150‑1 (MQ=255) gCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATATAGAATTCATAATTATTAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCtttt > 2:913064/1‑150 (MQ=255) tttGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAAt < 2:1323291/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATACAATCATTGATAACCCCTATGTTTCCTCTGTTCTCATAACATATTGATATACAATTATTATTTTAATGTATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTTGAAACATTTTGTTATCTTTTAATTa < 1:4601214/150‑1 (MQ=255) caacaaTCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTg > 1:2114868/1‑150 (MQ=255) aacaaTCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGt < 1:1905172/150‑1 (MQ=255) aacaaTCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGt > 1:2359245/1‑150 (MQ=255) aTCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACa > 1:4916662/1‑150 (MQ=255) aTCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACa > 1:666802/1‑150 (MQ=255) cATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATg > 1:1243898/1‑150 (MQ=255) aTTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGt > 1:224436/1‑150 (MQ=255) aTACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATc < 1:4373588/150‑1 (MQ=255) aTACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATc < 1:5300637/150‑1 (MQ=255) tACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATcc < 1:3296394/150‑1 (MQ=255) aCCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCt > 1:930801/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCt < 1:3688390/150‑1 (MQ=255) ccccTCTGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTta < 2:3281572/150‑1 (MQ=255) ccccTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTta < 2:1797187/150‑1 (MQ=255) ccccTATGTATCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCATta > 2:2602421/1‑150 (MQ=255) ccTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTtaaa < 1:5217227/150‑1 (MQ=255) cTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTtaaaa > 2:3556136/1‑150 (MQ=255) tttCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTtaaaataaaa < 1:2838989/150‑1 (MQ=255) ccGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGa < 2:3690474/150‑1 (MQ=255) gCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAAc < 2:1732928/150‑1 (MQ=255) cTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATATAGAATACATAATTATGAAATATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTATTAAATACATTAGATACATGTAATCCTTAAAATAAAATTAACt > 2:2168466/1‑150 (MQ=255) cTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACt < 1:1737216/150‑1 (MQ=255) cTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACt < 1:1407236/150‑1 (MQ=255) tCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACtt < 2:759130/150‑1 (MQ=255) tCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACtt > 1:896118/1‑150 (MQ=255) tCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACtt < 1:3974076/150‑1 (MQ=255) cAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTc < 1:5064420/150‑1 (MQ=255) aaCTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCa > 1:4974653/1‑150 (MQ=255) aCTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCAt < 2:655737/150‑1 (MQ=255) tCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAg < 2:1705776/150‑1 (MQ=255) tAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAAt < 1:3462381/150‑1 (MQ=255) aaCATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATa < 1:5148533/150‑1 (MQ=255) aCATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAg < 2:1025068/150‑1 (MQ=255) cATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGt > 1:3600193/1‑150 (MQ=255) atatTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTa > 2:4207787/1‑150 (MQ=255) tatTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTAt > 2:1495733/1‑150 (MQ=255) atTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATATAATATTATc > 1:4070157/1‑150 (MQ=255) atTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATc > 1:4809522/1‑150 (MQ=255) ttGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATcc < 1:4584266/150‑1 (MQ=255) tGATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATcaa > 1:4171412/1‑148 (MQ=255) gATATACATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCaa > 2:2280289/1‑150 (MQ=255) gATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCaa > 1:1559997/1‑150 (MQ=255) atatACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCaaa > 2:4298330/1‑150 (MQ=255) atatACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCaaa > 2:2337600/1‑150 (MQ=255) ataCATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAAtg < 2:4921014/150‑1 (MQ=255) aCATTTATAATTTTCATTAATATTTATATTTAGAATTCATAATTACGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAAtgtg > 2:4705332/1‑150 (MQ=255) aTTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCt > 1:1275543/1‑150 (MQ=255) aTTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCATTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCt > 2:649662/1‑150 (MQ=255) tataATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCtttt < 1:2771498/150‑1 (MQ=255) taATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGAATAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCtttttt < 1:1033325/150‑1 (MQ=255) actgttCCTGAATTGTGATATTTAGAATTCAGAATTATGAATTATATTAAAGAGATGAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATTGAATAGTATCCAAATGTGCtttttgt < 1:1487152/146‑3 (MQ=255) tttCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATATTATCCAAATGTGCTTTTTTTTgg > 2:27984/1‑150 (MQ=255) tCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGAt < 2:3147019/150‑1 (MQ=255) aTGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATaa > 2:457137/1‑150 (MQ=255) aTGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATaa > 1:1651316/1‑150 (MQ=255) aTGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATaa > 2:1143362/1‑150 (MQ=255) tGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATAAc < 1:5004325/150‑1 (MQ=255) gAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATAACg < 1:3550277/150‑1 (MQ=255) | ATATTTTTTGGGCCGGCATGATGCCGGCTTTTTTTTATGCCTTCATTAATGTGCGCCTGATCACACCAGCCGTTTGGCGCAACAATCATTGATACCCCCTATGTTTCCGCTCAACTCATAACATATTGATATACATTTATAATTTTCATGAATATTTATATTTAGAATTCATAATTATGAATTATATTAAATAGATTAGAAACATTTTGATATCTTTTAAATACATTTGTTACATGTAATCCTTAAAATAAAATGAACTTCATAGAATAGTATCCAAATGTGCTTTTTTTTGGATAACG > CP009273/2027185‑2027483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |