| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 193,157 | T→C | 10.4% | I42T (ATA→ACA) | rseP → | inner membrane zinc RIP metalloprotease; RpoE activator, by degrading RseA; cleaved signal peptide endoprotease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 193,157 | 0 | T | C | 10.4% | 798.6 / 71.6 | 279 | I42T (ATA→ACA) | rseP | inner membrane zinc RIP metalloprotease; RpoE activator, by degrading RseA; cleaved signal peptide endoprotease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (128/122); new base C (18/11); total (146/133) | |||||||||||
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Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TCAGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAATAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCAATAATA > CP009273/193008‑193306 | tCAGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAAt < 2:5127092/150‑1 (MQ=255) cAGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAATa > 1:343233/1‑150 (MQ=255) cAGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAATa < 2:3304299/150‑1 (MQ=255) 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aaTAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCaataa > 2:1369678/1‑150 (MQ=255) tAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCAataata > 1:3225756/1‑150 (MQ=255) | TCAGGACGCTTTAACGGAAGGTAATATGCTGAGTTTTCTCTGGGATTTGGCTTCGTTCATCGTTGCACTGGGTGTACTTATCACCGTGCATGAATTTGGTCATTTCTGGGTTGCCCGGCGTTGTGGTGTTCGCGTTGAGCGTTTCTCAATAGGGTTTGGTAAGGCGCTCTGGCGGCGAACTGATAAGCTCGGCACCGAATATGTTATCGCCCTGATCCCGTTGGGCGGTTATGTCAAAATGCTGGATGAGCGCGCAGAACCGGTCGTTCCGGAACTCCGCCACCATGCCTTCAATAATA > CP009273/193008‑193306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |