| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,099,341 | T→G | 28.2% | L66F (TTA→TTC) | wbbI ← | d‑Galf:alpha‑d‑Glc beta‑1,6‑galactofuranosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,099,341 | 0 | T | G | 28.2% | 479.8 / inf | 390 | L66F (TTA→TTC) | wbbI | d‑Galf:alpha‑d‑Glc beta‑1,6‑galactofuranosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (147/133); new base G (62/48); total (209/181) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
TCACAGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCTTGCTTT > CP009273/2099192‑2099490 | tCACAGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAAtt > 1:996549/1‑150 (MQ=255)tCACAGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAAtt < 2:5254476/150‑1 (MQ=255) cacaGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTa > 2:2384271/1‑150 (MQ=255) cacaGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTa < 2:815629/150‑1 (MQ=255) acaGGTAGCAAGCCGAACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATTAATCAGATGTACTATTCTAAATTTTTTAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTaa < 1:4504307/150‑1 (MQ=255) caGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCCTCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAACATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTaaa < 1:1272054/150‑1 (MQ=255) caGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTaaa > 1:4371629/1‑150 (MQ=255) tAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACAt < 2:4551111/150‑1 (MQ=255) tAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACAt < 2:3950748/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCt < 2:1532531/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCt < 1:3169163/150‑1 (MQ=255) cAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCtt > 2:3234679/1‑150 (MQ=255) gCCGCACAGTATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTGTAt < 2:5087034/150‑1 (MQ=255) ccGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACAtatttatt < 2:3158770/150‑1 (MQ=255) ccGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTAtt < 2:4494176/150‑1 (MQ=255) ccGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCATAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTAtt < 2:4300623/150‑1 (MQ=255) cacaGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTc < 2:1366292/150‑1 (MQ=255) acaGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCa > 2:3367130/1‑150 (MQ=255) agtaTCACTACCCCCTGCTCCTCTTTATTCATCAATATCTTGAATCTGTGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGATAGTATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGTAAATTAAATCATCTTTATTTTCAAg < 1:2334272/147‑1 (MQ=255) aaTCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGAc < 2:4421980/150‑1 (MQ=255) aaTCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGAc > 2:171787/1‑150 (MQ=255) aaTCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGAc < 1:1661098/150‑1 (MQ=255) aTCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGAcc < 1:2131047/150‑1 (MQ=255) tCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCg < 1:2042465/150‑1 (MQ=255) aCTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCa < 2:3710225/150‑1 (MQ=255) cTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCag > 1:4295734/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTCATTTTCAAGACCGCagag > 2:2171047/1‑150 (MQ=255) aCCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCagag < 1:5250833/150‑1 (MQ=255) cctcctcctCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAAt < 1:3382066/150‑1 (MQ=255) ctcctcctcTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATg > 1:852681/1‑150 (MQ=255) tcctcctcTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGt > 2:401984/1‑150 (MQ=255) ctcctcTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTAc > 2:2002990/1‑150 (MQ=255) tAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCtt < 1:763935/150‑1 (MQ=255) aaTTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTa > 2:3257303/1‑150 (MQ=255) aaTTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAAAATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTa > 1:3557908/1‑150 (MQ=255) aTTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTaa > 1:1769391/1‑150 (MQ=255) aTTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTaa > 2:1181828/1‑150 (MQ=255) ttCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAAc < 1:2632756/150‑1 (MQ=255) ttCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAAc < 1:5273731/150‑1 (MQ=255) ttCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAAc > 2:4532129/1‑150 (MQ=255) tcatcaATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACa < 2:1587038/150‑1 (MQ=255) tcatcaATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACa < 1:3946687/150‑1 (MQ=255) atcaATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGa > 1:1542850/1‑150 (MQ=255) aaTATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACt > 1:2529313/1‑150 (MQ=255) atatCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACta > 1:4053895/1‑150 (MQ=255) atCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACtaat < 1:4683865/150‑1 (MQ=255) gAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATtc > 2:1892059/1‑150 (MQ=255) aaTCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATtct > 1:2673343/1‑150 (MQ=255) aaTCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATtct > 1:2426158/1‑150 (MQ=255) tCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTctct > 2:2695546/1‑150 (MQ=255) ncAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTctct > 1:1017214/2‑150 (MQ=255) cAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTATCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTg > 2:2937690/1‑150 (MQ=255) agagGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTgg > 2:390319/1‑150 (MQ=255) gagGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGa > 2:2445857/1‑150 (MQ=255) gagGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGa > 1:1233886/1‑150 (MQ=255) agGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGac > 2:2778445/1‑150 (MQ=255) agGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGac > 2:95664/1‑150 (MQ=255) ggTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGact < 1:5050769/150‑1 (MQ=255) gTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGacta > 1:4252977/1‑150 (MQ=255) tACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGactac < 1:2805782/150‑1 (MQ=255) aTTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAAAATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATACTCTGGACTACTCCa > 2:4953732/1‑150 (MQ=255) ttAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAAATAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATagag > 1:533107/1‑150 (MQ=255) tAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATAAGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTAATTTCAATACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTATGGACTACTCCACCCCATAGAgg > 1:2191270/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGaa > 2:1234060/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAAt < 1:1627365/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAAt < 2:2994327/150‑1 (MQ=255) gTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTaac < 2:1275885/150‑1 (MQ=255) tGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTaaca < 1:3633477/150‑1 (MQ=255) aaaGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTaacaac < 1:3131460/150‑1 (MQ=255) aaGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACGGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAacaaca > 2:4209957/1‑150 (MQ=255) aaGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAacaaca < 2:866811/150‑1 (MQ=255) aTGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGaaa < 1:4005040/150‑1 (MQ=255) tGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAAt < 1:139136/150‑1 (MQ=255) gACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATg > 1:4926569/1‑150 (MQ=255) cAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGtt > 1:4803488/1‑150 (MQ=255) aaTATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGttt > 1:2973509/1‑150 (MQ=255) atatGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCa > 2:3123596/1‑150 (MQ=255) cAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCt < 2:2893154/150‑1 (MQ=255) aaaaTGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTg < 1:3532193/150‑1 (MQ=255) aaaaTGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTg > 2:3505739/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGc < 1:3855072/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCa > 1:4763222/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCa > 2:264928/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCa > 2:704095/1‑150 (MQ=255) tttGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAAt > 1:1178827/1‑150 (MQ=255) ccATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCa > 2:1087645/1‑150 (MQ=255) cATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAg > 2:5306682/1‑150 (MQ=255) cATCGGGAAATTGAAAATTAAAACAACTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTACCAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAAGGTCCAg < 2:1404931/150‑1 (MQ=255) aTCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGt < 1:4448730/150‑1 (MQ=255) gggAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCa < 2:4799073/150‑1 (MQ=255) gAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATc > 1:3250187/1‑150 (MQ=255) aaaTTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACACCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGAGCATCt > 2:1434059/1‑150 (MQ=255) ttGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCtttt > 2:4713281/1‑150 (MQ=255) gAAACTGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTACCAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCt < 2:2268397/150‑1 (MQ=255) gAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATTTTTTCt < 1:4153962/150‑1 (MQ=255) gAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATTTTTTCt < 1:1097481/150‑1 (MQ=255) aaaaTTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCtt < 2:4053895/150‑1 (MQ=255) aaaTTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCTTg > 2:5029445/1‑150 (MQ=255) aaaTGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGACTGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCTTg > 1:4310369/1‑150 (MQ=255) aaaTGAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCTTg > 1:3943970/1‑150 (MQ=255) | TCACAGGTAGCAAGCCGCACAGAATCACTACCCCCTCCTCCTCTTAATTCATCAATATCATGAATCAGAGGTACTATTCTAAATTTTAGAAGGCGGTGAAAGAATGACAATATATGCCAAAATGGTTTGGCCATCGGGAAATTGAAAATTAAAACATCTTTATTTTCAAGACCGCAGAGAAATGTACTAAGCTTAACAGAACTAATAATTCTCTGGACTACTCCACCCCATAGAGGAATGTTAACAACAGAAATGTTTTCATAATCTGAAGCAATGTCCAGTGCATCTTTTCTTGCTTT > CP009273/2099192‑2099490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |