| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,109,283 | C→G | 6.7% | R32P (CGA→CCA) | wcaM ← | colanic acid biosynthesis protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,109,283 | 0 | C | G | 6.7% | 827.6 / 8.2 | 297 | R32P (CGA→CCA) | wcaM | colanic acid biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (115/143); new base G (19/3); total (151/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.98e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
ACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATCACCTG > CP009273/2109134‑2109432 | aCGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTc < 1:3621961/150‑1 (MQ=255)aCGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTc < 1:866921/150‑1 (MQ=255) gTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTcgg > 1:2808681/1‑150 (MQ=255) ttttACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAACGCTTTGTcggg > 2:4292001/1‑150 (MQ=255) tttACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAAAGCATTGTagggg > 2:4566825/1‑149 (MQ=255) tttACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTcgggc > 1:2004397/1‑150 (MQ=255) ttACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTcgggcg < 1:3293344/150‑1 (MQ=255) ttACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTcgggcg < 2:2175460/150‑1 (MQ=255) ttACCGGGAGGGAGAAAGATGCCGGTGTTGAAATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGGGGGGTGTAGGCGTGAATGTTAACGCTTTGTcgggcg > 2:1737997/1‑150 (MQ=255) gggagggaTCAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGGGGGGGGTGTAGTCGGTAATGTTAACGCGTTGGCGGGCGGGCAg > 2:103807/1‑150 (MQ=255) gggagggaTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGGGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTAGGGCGGGacg > 2:5115914/1‑148 (MQ=255) agggaTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAACGCTTTGTCGGGCGGGTAgcgc > 1:3330410/1‑150 (MQ=255) gggaTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTTATGTTAACGCGTTGTCGGGCGGGAAgcgcg > 1:2478622/1‑150 (MQ=255) gggaTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAgcgcg < 2:5032711/150‑1 (MQ=255) ggaTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACTACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAgcgcgc < 2:4504877/150‑1 (MQ=255) aTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGACGCGCGCgg > 2:2492685/1‑150 (MQ=255) aTAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCgg > 1:4748971/1‑150 (MQ=255) aaaGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAAAGCTTTGTAGGGCGGGAAGCGCGCGGGc > 2:4308951/1‑150 (MQ=255) gATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTGAATGTTAAAGCGTTTTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCgca > 2:4983622/1‑148 (MQ=255) aTGCCGGTGTTGATATTGTAACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTGATTGTTTAAGCGTTGTGGGGGGGGGCGCGCGCgggggcca > 1:4547634/1‑145 (MQ=255) ggTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGt < 1:83003/150‑1 (MQ=255) tgtTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTAt < 1:1806011/150‑1 (MQ=255) tgtTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTAt < 1:1507519/150‑1 (MQ=255) atatTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGGGGGGTGTAGTCGTGAATGTTAAAGCGTTGTCGGGGGGGACGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATggagg > 2:5100799/1‑150 (MQ=255) cacaAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTGAAAGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGACCCGCGCGGGCGAAAGGGGGGTGGGGGAAgggca > 1:3403508/1‑147 (MQ=255) acaAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAg < 1:309622/150‑1 (MQ=255) caAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGGAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGGGGAAGGCAAgc > 2:3795258/1‑150 (MQ=255) caAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAgc < 2:3158436/150‑1 (MQ=255) aaaCCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAgcg < 1:915692/150‑1 (MQ=255) aaaCCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGGGGGGTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGACGCGCGCGGGCGGAAGGGGTGTGGCGGAAGGCAAgcg > 2:4182084/1‑150 (MQ=255) aaCCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAgcgc < 2:901720/150‑1 (MQ=255) aaTCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGGTAATGTTAACGCGTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAg > 2:410673/1‑150 (MQ=255) gcaggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGcc < 1:4794992/150‑1 (MQ=255) gcaggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGGGGGTTGTAGTCGTGTATGTTTACGCGTTGTGGGGCGGGCAGCGCGGGGGCGGAAGGGGGATGGGGGGAGGGCAGCGCCGAGCTTggc > 1:1048196/1‑148 (MQ=255) caggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTTATGTTTACGCGTTGGCGGGCGGGCAGCGCGCGGGCGGAAGGGGGTTGGTGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCg > 2:1350232/1‑150 (MQ=255) caggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGGGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCGTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCg > 2:2194307/1‑150 (MQ=255) aggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAAAGGGTTGTAGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGTAGGCAAGCGCCGAGCATGCCGt > 2:4774793/1‑150 (MQ=255) aggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGGTGTAGTCGTGAATGTTAAAGCATTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGCAAGGGGGATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCGTGCCGt > 2:4093773/1‑150 (MQ=255) ggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTCACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTc < 2:2329622/150‑1 (MQ=255) ggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGTAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTc > 2:2998590/1‑150 (MQ=255) ggcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTc < 1:2492685/150‑1 (MQ=255) gcaCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCa < 2:2663975/150‑1 (MQ=255) caCGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTCTGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAg > 2:3459230/1‑150 (MQ=255) gacgacTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAAAGCTTTGTCGGGCGGGGAGCGCGCGGGCGGAAGGGGTATGGAGGTAGGCAAGCGCCGAGCTTTCCGTCAGGaa > 2:1567592/1‑150 (MQ=255) gacTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTTATGTTGTCGCGTTTTCGGGGGGGTAGCGCGCGGGCGAAATGGGGATTGTGGTAGGCAAGCGCCCAGCATTCCGGCAGGAACGt > 1:18003/1‑150 (MQ=255) gacTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAAAGCGTTGTCGGGGGGGGATCGCGCGGGCGGAAGGGGTATGGAGGGAGGGAAGCGCCGAGCTTGCCGGCAGGAACgg > 2:1835698/1‑149 (MQ=255) acTTTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTg < 1:2099178/150‑1 (MQ=255) acTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTg < 1:5115914/150‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGc < 1:3952017/150‑1 (MQ=255) tttGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTc < 1:167730/150‑1 (MQ=255) cccTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAACGCATTTTAGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGCAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGGCAGGAACCGGCGTCGGga > 2:1372241/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGTAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGgaga > 2:1692665/1‑150 (MQ=255) cGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGTAAGGAAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGtt < 1:2190145/150‑1 (MQ=255) cTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCCGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTTATGTTACCGCTTTGTGGGGGGGGACGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGTGGTAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGtttt < 1:2207567/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAAAGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGGATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCGTTCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGttttt > 1:4771473/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCCAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGttttt > 2:3991914/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGGTAATGTTAAACCGTTGTAGGGCGGGAAGCGCGCGGGGGAAATGGGGTTGGAGGTAGGCAAACCCCCATCTTGCCGGACCGTACGTGCGTCGGGGGAGttttt > 1:3267796/1‑150 (MQ=255) aaGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTGATGTTAACGCGTTTTGGGGCGGGGAGCGCGCGGGCGCAAGGGGTGTGGAGGAAGGCAAGCGCCGCGCGTGCCGTCAGGAACCTGCGGCGGGAGAGttttttt > 1:3850113/1‑149 (MQ=255) aGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTaa < 2:4254999/150‑1 (MQ=255) aGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTaa < 2:152764/150‑1 (MQ=255) ggCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTaaa > 2:1344084/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTTCAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAAt < 2:349079/150‑1 (MQ=255) gCTTGTTTAATTGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAAt < 2:2392658/150‑1 (MQ=255) gCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAACGCGTTTTGGGGGGGGGAACGCCCGGGGGAAAAGGGTATGGAGGTAGGCAATCGCCCAGCGTGCCGTCAGGAAAGGGCGGAGGGGGAGTTTTTTTAAt > 1:4184800/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAAt < 1:1871384/150‑1 (MQ=255) cTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGCATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATg < 1:3484805/150‑1 (MQ=255) gTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCa < 1:4322959/150‑1 (MQ=255) gTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGGTAATGTTAACGGGTTGTCGGGCGGGGAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTGTGGATGTAGGCAAGCGCCGAGCGTTCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGGGAGTTTTTTAAATTGCa > 1:1324489/1‑150 (MQ=255) tttAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCAt < 1:2964881/150‑1 (MQ=255) tAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGc < 2:2004397/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTCATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGCGGAAGGCACGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGtt < 1:1737997/150‑1 (MQ=255) tGAGGCGATCCTGTCGTGTGGGTTGTTGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAATGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTtc < 1:4068056/150‑1 (MQ=255) tGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTtc < 1:4600237/150‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTctcc < 2:3362299/150‑1 (MQ=255) gCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTAAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTctcct < 1:1026261/150‑1 (MQ=255) gATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATTGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAAAGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCctct > 2:4336696/1‑150 (MQ=255) ccAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATTTTAAAGCTTTTTCGGGCGGGAATCGCGCGGGCGAAAGGGGTATTGATGAATGCAAACGCCGATCTTTCCGTCAGGAAAGTTCGTAGGGATTGTTTTTTAAAATGCATTAGTTATACTCaata > 1:2681097/1‑150 (MQ=255) tgtgGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAATGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCtt > 2:3782233/1‑149 (MQ=255) tgtgGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTg < 2:3639502/150‑1 (MQ=255) ttGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCaa < 1:137618/150‑1 (MQ=255) tGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAg < 1:5010666/150‑1 (MQ=255) tAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCt < 1:3772772/150‑1 (MQ=255) aGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTg > 1:2365821/1‑150 (MQ=255) gTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTgg < 2:1202120/150‑1 (MQ=255) gTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGa < 1:2745898/150‑1 (MQ=255) ttAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGACGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAg > 1:1272012/1‑150 (MQ=255) ttAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAg > 1:2289425/1‑150 (MQ=255) tAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGt > 2:2526017/1‑150 (MQ=255) gTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAACGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTtctc < 1:4513186/150‑1 (MQ=255) gTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTtctc < 2:3285054/150‑1 (MQ=255) gTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTtctc < 1:4818545/150‑1 (MQ=255) ttAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCg > 1:2380520/1‑150 (MQ=255) aaCGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGAt > 1:4551621/1‑150 (MQ=255) aCGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGAtt < 1:3538811/150‑1 (MQ=255) cGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTg < 2:2819857/150‑1 (MQ=255) tttGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATc < 2:4816011/150‑1 (MQ=255) tGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATCAc < 1:4731329/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATCAcc < 2:3906392/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATCACct < 1:4150568/150‑1 (MQ=255) cgggcgggAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATCACctg > 2:1463399/1‑150 (MQ=255) | ACGTTTTACCGGGAGGGATAAAGATGCCGGTGTTGATATTGTCACAAACCAATCCGGCAGGCACGACGACTGTTTGCCCTTCGCTGAAGGCTTGTTTAAATGAGGCGATCCAGTCGTGTGGGTTGTAGTCGTTAATGTTAACGCTTTGTCGGGCGGGAAGCGCGCGGGCGAAAGGGGTATGGAGGAAGGCAAGCGCCGAGCTTGCCGTCAGGAACGTGCGTCGGGAGAGTTTTTTAAATGGCATGCGTTCTCCTCTATAAAGCCTGCAGCAAGCTGGCGAGTTCTCGATTGATCACCTG > CP009273/2109134‑2109432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |