| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,480,932 | A→C | 6.3% | Q1027P (CAA→CCA) | evgS → | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,480,932 | 0 | A | C | 6.3% | 848.1 / 43.8 | 302 | Q1027P (CAA→CCA) | evgS | hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (134/149); new base C (9/10); total (143/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
GCTAAATCTATTAGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACACCAAGTT > CP009273/2480783‑2481080 | gCTAAATCTATTAGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCa < 2:2013677/150‑1 (MQ=255) aaTCTATTAGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCCAAAt > 2:4198771/1‑150 (MQ=255) aTTAGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAAttcttc > 1:1023813/1‑150 (MQ=255) aGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCtt < 2:563164/150‑1 (MQ=255) aGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCtt < 2:1700167/150‑1 (MQ=255) ggATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTa > 1:2434808/1‑150 (MQ=255) gatgTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATc > 1:1882190/1‑150 (MQ=255) gatgTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATc > 2:4744860/1‑150 (MQ=255) gatgTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATc > 2:5003402/1‑150 (MQ=255) atgTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCt < 1:3553215/150‑1 (MQ=255) ttGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTggg < 2:3201069/150‑1 (MQ=255) ttGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTggg < 1:2957725/150‑1 (MQ=255) tgatgaAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTgggg > 2:3067859/1‑150 (MQ=255) gaAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCtt < 2:3605895/150‑1 (MQ=255) gCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACa < 1:1772362/150‑1 (MQ=255) gCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACa < 2:1884579/150‑1 (MQ=255) ccACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAg > 2:2771280/1‑150 (MQ=255) ccACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAg < 2:2126108/150‑1 (MQ=255) aCTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGcc > 1:4764400/1‑150 (MQ=255) aCTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGACGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGcc > 1:4721565/1‑150 (MQ=255) cTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCa < 2:684379/150‑1 (MQ=255) tGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCGTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCaa < 2:4010489/150‑1 (MQ=255) gATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAAc > 1:2314614/1‑150 (MQ=255) gATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAAc < 1:4319521/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACg < 1:2638835/150‑1 (MQ=255) tGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGc > 1:1684710/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGca < 2:2916241/150‑1 (MQ=255) gtgCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAg < 2:3553833/150‑1 (MQ=255) gtgCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAg < 2:4334293/150‑1 (MQ=255) gtgCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAg < 2:837748/150‑1 (MQ=255) tgCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAgg < 1:4201586/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCt > 2:409532/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCt < 2:445784/150‑1 (MQ=255) aGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTaa < 2:2184559/150‑1 (MQ=255) gcgcTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTaac < 1:531146/150‑1 (MQ=255) cgcTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTaacg > 2:3956006/1‑150 (MQ=255) gcTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTaacga > 1:4156561/1‑150 (MQ=255) gcTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTaacga < 1:183034/150‑1 (MQ=255) tACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTaacgaac < 2:1354208/150‑1 (MQ=255) cacaAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGt < 2:4775918/150‑1 (MQ=255) acaAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCACAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTg > 2:452463/1‑150 (MQ=255) aaaGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCCAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGaa > 2:2714730/1‑150 (MQ=255) aaGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGaaa < 2:2303962/150‑1 (MQ=255) aaGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGaaa < 1:4011438/150‑1 (MQ=255) tCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAg < 1:1381191/150‑1 (MQ=255) aGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAggg > 1:1649372/1‑150 (MQ=255) gTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGt < 1:3755710/150‑1 (MQ=255) aTGCAACTTTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCTAACTCCGTGAGCATAATTCTTCCTTACCGATCTGGGTGATTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTa < 2:1380733/150‑1 (MQ=255) tGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTaa > 1:4853858/1‑150 (MQ=255) tGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTaa > 1:3658001/1‑150 (MQ=255) gCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAg > 2:2427261/1‑150 (MQ=255) aaCATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGtt < 2:2528470/150‑1 (MQ=255) aaCATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGtt < 1:3811986/150‑1 (MQ=255) aCATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTg < 1:1953307/150‑1 (MQ=255) aTTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCg > 1:1206681/1‑150 (MQ=255) aTTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCg > 1:3924161/1‑150 (MQ=255) ttATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCgg > 2:3284888/1‑150 (MQ=255) tGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCAt > 1:365563/1‑150 (MQ=255) gATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATg > 2:5075345/1‑150 (MQ=255) tGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCACACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACt < 1:3215639/150‑1 (MQ=255) gCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACtt < 1:781421/150‑1 (MQ=255) ttattaCTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTAt > 1:21491/1‑150 (MQ=255) ttattaCTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTAt < 2:1866906/150‑1 (MQ=255) attaCTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCCAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTAtgt < 2:2506396/150‑1 (MQ=255) taCTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTAtgttt < 1:5199620/150‑1 (MQ=255) taCTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTAtgttt < 1:428017/150‑1 (MQ=255) aCTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCCAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTAtgtttg > 2:4150249/1‑150 (MQ=255) gACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCCAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTc < 1:4198751/150‑1 (MQ=255) aCGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTGACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCa > 2:2964651/1‑150 (MQ=255) gTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCaaa > 1:3475539/1‑150 (MQ=255) gTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCaaa > 2:3839642/1‑150 (MQ=255) aaTATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCg > 1:463819/1‑150 (MQ=255) aaTATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCg > 1:3423470/1‑150 (MQ=255) atGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTg > 2:3405707/1‑150 (MQ=255) tGCCGAAGATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCCTCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAGGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGa < 2:77918/150‑1 (MQ=255) gAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCt > 2:4914946/1‑150 (MQ=255) gAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCt > 1:2713569/1‑150 (MQ=255) gAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCt > 1:5062835/1‑150 (MQ=255) aaTATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTAACCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACTACCGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGATGACCCTg > 2:912133/1‑150 (MQ=255) atggatggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGAt > 1:2204105/1‑150 (MQ=255) atggatggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGAt < 2:4420609/150‑1 (MQ=255) tggatggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATg < 2:1185023/150‑1 (MQ=255) ggatggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGt > 1:5242837/1‑150 (MQ=255) gatggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTa < 1:3445182/150‑1 (MQ=255) gatggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTa > 2:348221/1‑150 (MQ=255) tggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACt < 2:3167586/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTg > 1:60628/1‑150 (MQ=255) gTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAAcaca > 1:4039125/1‑150 (MQ=255) tGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACAtt < 2:5180906/150‑1 (MQ=255) aCTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTa > 1:3333651/1‑150 (MQ=255) aaCTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGt < 1:4413359/150‑1 (MQ=255) aCTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGtt < 1:944168/150‑1 (MQ=255) aCTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGtt < 1:906101/150‑1 (MQ=255) cTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTa > 2:1638319/1‑150 (MQ=255) ccGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTaca < 2:1423446/150‑1 (MQ=255) gTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACAcc > 1:5014015/1‑150 (MQ=255) tGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACACCa < 1:2133188/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGAGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACACCa < 2:1802672/150‑1 (MQ=255) aGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACACCAAg > 1:1228041/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACACCAAGtt < 2:1452027/150‑1 (MQ=255) | GCTAAATCTATTAGGATATGATGTTGATGAAGCCACTGATGGTGTGCAAGCGCTACACAAAGTCAGTATGCAACATTATGATCTGCTTATTACTGACGTTAATATGCCGAATATGGATGGTTTTGAGTTGACTCGCAAACTCCGTGAGCAAAATTCTTCCTTACCCATCTGGGGGCTTACAGCCAACGCACAGGCTAACGAACGTGAAAAAGGGTTAAGTTGCGGCATGAACTTATGTTTGTTCAAACCGTTGACCCTGGATGTACTGAAAACACATTTAAGTCAGTTACACCAAGTT > CP009273/2480783‑2481080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |