| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,736,714 | C→A | 100% | R325S (CGC→AGC) | yfiN → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,736,714 | 0 | C | A | 99.1% | 1066.3 / 0.1 | 325 | R325S (CGC→AGC) | yfiN | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase with an N‑terminal periplasmic domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base A (197/125); total (199/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GCCCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATT > CP009273/2736567‑2736860 | gCCCGACACACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGc < 2:4190934/150‑1 (MQ=255) ccGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 1:1198176/150‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTg < 2:21456/150‑1 (MQ=255) cGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTATTGATGGCGATAATTTAAAATAAATCAATGATAACTGGGGTCATGCGACGGGCGATATAGTCTTGATTTTAATAGCAAAAAGGTTATCTGAATTTTGAGGGCTGCGACATAAAACATAAAGCCTg > 1:4570907/1‑150 (MQ=255) gAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTgg > 2:3459638/1‑150 (MQ=255) aaaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTggg > 1:4454447/1‑150 (MQ=255) aaaaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTggg > 1:3563067/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGggcg > 2:3274593/1‑150 (MQ=255) ggCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt > 2:2464228/1‑138 (MQ=255) ggCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCt < 1:2464228/138‑1 (MQ=255) ggCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGa < 2:2577148/150‑1 (MQ=255) cGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAAt > 2:4006907/1‑150 (MQ=255) cGTGACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAAt < 2:1231013/150‑1 (MQ=255) gTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAAtt < 1:2339867/150‑1 (MQ=255) aCTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGc > 2:947539/1‑150 (MQ=255) cTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCt < 2:2304725/150‑1 (MQ=255) tATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTa > 1:1325480/1‑150 (MQ=255) tATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGGTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGGTGATTTGGCTa > 2:2379892/1‑150 (MQ=255) tttCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATg < 2:690186/150‑1 (MQ=255) tttCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATg > 2:5205377/1‑150 (MQ=255) tttCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATg > 2:5037106/1‑150 (MQ=255) tCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGt < 1:3761271/150‑1 (MQ=255) cTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTg < 2:3817236/150‑1 (MQ=255) tGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTa > 1:2754020/1‑150 (MQ=255) ggCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTat > 1:3411305/1‑150 (MQ=255) cGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatga > 1:4787232/1‑150 (MQ=255) aTAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatgatg > 2:3527870/1‑150 (MQ=255) aTAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTatgatg > 2:196396/1‑150 (MQ=255) aTTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTAc > 1:3366222/1‑150 (MQ=255) ttCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAg > 2:5230806/1‑150 (MQ=255) tCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGt < 2:1027683/150‑1 (MQ=255) aaaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCg > 1:3076563/1‑150 (MQ=255) aaTACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCgg > 1:1010199/1‑150 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATc > 1:3250832/1‑150 (MQ=255) cATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATc > 2:469644/1‑150 (MQ=255) aTCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCt > 1:2574089/1‑150 (MQ=255) aTCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCt > 2:1998053/1‑150 (MQ=255) tCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTg < 1:2239375/150‑1 (MQ=255) aTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAg > 1:2944550/1‑150 (MQ=255) aTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAg > 2:316289/1‑150 (MQ=255) aTGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAg < 2:1915200/150‑1 (MQ=255) tGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGt > 2:4639054/1‑150 (MQ=255) tGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGt > 2:561000/1‑150 (MQ=255) gATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTg > 1:889766/1‑150 (MQ=255) aTACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgc > 2:4388240/1‑150 (MQ=255) aCCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTgcag < 1:1572141/150‑1 (MQ=255) gggTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGat < 2:3923749/150‑1 (MQ=255) gTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGatat > 1:3652217/1‑150 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGtt > 2:2920722/1‑150 (MQ=255) aTGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGACTGGGCGGCGATGAATTCGCTATTGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGtt > 1:298602/1‑150 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCa > 2:2271678/1‑150 (MQ=255) gCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCa < 1:1691940/150‑1 (MQ=255) gACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGc > 2:3901858/1‑150 (MQ=255) aCGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCa < 1:424638/150‑1 (MQ=255) gggCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACt < 2:1617369/150‑1 (MQ=255) gCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGa < 1:5221812/150‑1 (MQ=255) cGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGac < 1:1961618/150‑1 (MQ=255) gagTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGTATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACaaa < 1:3974980/150‑1 (MQ=255) agTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAAt > 2:2839473/1‑150 (MQ=255) tCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCt < 1:1816553/150‑1 (MQ=255) ttgattgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCttt > 2:44663/1‑150 (MQ=255) attgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAt > 1:266174/1‑150 (MQ=255) ttgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtc < 2:2968174/150‑1 (MQ=255) tgaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtct < 2:1697363/150‑1 (MQ=255) gaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtctc > 2:3128400/1‑150 (MQ=255) gaAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAAtctc < 1:4971548/150‑1 (MQ=255) aaaTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTcc < 1:1610473/150‑1 (MQ=255) aTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCg > 2:2021469/1‑150 (MQ=255) aTCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCg > 1:5295802/1‑150 (MQ=255) cGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGtt < 1:1428341/150‑1 (MQ=255) gCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGttt < 2:1302714/150‑1 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCt < 1:4501760/150‑1 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCt > 1:3846661/1‑150 (MQ=255) aCGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCt < 2:5166931/150‑1 (MQ=255) cGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCtt < 2:3449808/150‑1 (MQ=255) ggTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTc > 1:4098222/1‑150 (MQ=255) gTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCa > 1:1740692/1‑150 (MQ=255) ttAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCAt < 1:609912/150‑1 (MQ=255) tAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATa < 1:4887059/150‑1 (MQ=255) cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATg < 2:3417320/150‑1 (MQ=255) cTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATg < 1:4384047/150‑1 (MQ=255) tGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATgg < 2:4333880/150‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAGAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 2:2620179/1‑150 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 1:3128674/1‑150 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 2:2875418/1‑150 (MQ=255) aaTTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTACAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGcc > 2:858786/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAg < 2:1234258/150‑1 (MQ=255) gCGGGCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGa > 2:1591976/1‑150 (MQ=255) gggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacc < 1:745971/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacca < 1:2404849/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGacca > 2:4823350/1‑150 (MQ=255) gCTGCGACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGaccac > 1:1160608/1‑150 (MQ=255) gACATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGa > 2:4545804/1‑150 (MQ=255) aCATAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGAc < 1:5108832/150‑1 (MQ=255) aTAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAt > 1:3533070/1‑150 (MQ=255) aTAAAGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACAt > 1:689588/1‑150 (MQ=255) aaaGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTa > 2:4904511/1‑150 (MQ=255) aaGCATACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGTCCATCAGACCACCATGACATTaa > 1:2849355/1‑150 (MQ=255) aTACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAt > 1:2079191/1‑150 (MQ=255) aTACAGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCAt > 2:2708641/1‑150 (MQ=255) | GCCCGAAAAACGTCGGCGTTACTATTTCTTGATGGCGATAATTTCAAATACATCAATGATACCTGGGGTCATGCGACGGGCGATAGAGTCTTGATTGAAATCGCAAAACGGTTAGCTGAATTTGGCGGGCTGCGACATAAAGCATACCGCCTGGGCGGCGATGAATTCGCTATGGTGCTCTATGATGTACAGTCGGAATCTGAAGTGCAGCAGATATGTTCAGCACTGACACAAATCTTTAATCTCCCGTTTGATCTTCATAATGGCCATCAGACCACCATGACATTAAGCATT > CP009273/2736567‑2736860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |