| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,778,820 | G→A | 100% | intergenic (‑450/+301) | ypjC ← / ← ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,778,820 | 0 | G | A | 98.7% | 1318.4 / 3.2 | 397 | intergenic (‑450/+301) | ypjC/ileY | pseudogene/tRNA‑Ile |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/3); new base A (139/253); total (141/256) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 398 total aligned reads displayed.
TGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAA > CP009273/2778673‑2778966 | tgactgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATa < 1:2406820/147‑1 (MQ=255) tgcGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTa > 2:863819/1‑150 (MQ=255) gcggGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCt < 2:2100969/150‑1 (MQ=255) gggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGa < 2:2821308/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAt < 1:4530644/150‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAtt < 1:1142306/150‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGAtt < 1:618091/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTaaa > 2:4700605/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAAt < 2:2191779/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 1:3756304/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 1:4914920/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 1:1615358/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAAt < 1:2144518/150‑1 (MQ=255) gTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAg > 1:4217022/1‑150 (MQ=255) tCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgg < 1:552434/150‑1 (MQ=255) cAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAggg > 1:3146695/1‑150 (MQ=255) agtagtAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAAGAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAgggg < 1:1853991/150‑1 (MQ=255) gtagtaGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGt < 1:2935250/150‑1 (MQ=255) agtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat > 2:2304733/1‑150 (MQ=255) agtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat < 2:1109878/150‑1 (MQ=255) agtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtat < 2:1151887/150‑1 (MQ=255) gtagATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGtata < 1:2319093/150‑1 (MQ=255) agATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat > 1:3437711/1‑150 (MQ=255) agATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTataat < 2:775584/150‑1 (MQ=255) ttttAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 2:4667161/150‑1 (MQ=255) tttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg > 1:2746820/1‑150 (MQ=255) tttAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATg < 2:2023753/150‑1 (MQ=255) tAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGat < 1:1764035/150‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataa < 1:4670214/150‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataa < 2:4503097/150‑1 (MQ=255) aGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGAGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataa > 2:2616369/1‑150 (MQ=255) gCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGataata < 1:2536978/150‑1 (MQ=255) cGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAc > 2:1927798/1‑150 (MQ=255) gTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAct > 1:828630/1‑150 (MQ=255) gTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAct < 2:4422788/150‑1 (MQ=255) ggCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATActct < 2:1254296/150‑1 (MQ=255) agagACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGc < 2:620230/150‑1 (MQ=255) agagACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGc > 2:4153340/1‑150 (MQ=255) agaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCtt > 1:4227118/1‑150 (MQ=255) agaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCtt > 2:2358553/1‑150 (MQ=255) gaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCttt < 1:1035206/150‑1 (MQ=255) gaCATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCttt < 1:3861197/150‑1 (MQ=255) tttCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCg < 2:5263886/150‑1 (MQ=255) aTCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTaa > 2:1403493/1‑150 (MQ=255) cTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGTGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTa < 2:3409951/150‑1 (MQ=255) cTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTa < 2:133526/150‑1 (MQ=255) tACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACt < 2:356299/150‑1 (MQ=255) aCTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACtt < 1:3044322/150‑1 (MQ=255) ctctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTa < 2:4246274/150‑1 (MQ=255) tctACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTaa > 1:4759053/1‑150 (MQ=255) tACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 1:5020297/150‑1 (MQ=255) gaCGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAtt < 2:3691474/149‑1 (MQ=255) aCGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 2:2704417/150‑1 (MQ=255) aCGGCATTGTTATACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTc < 1:4281249/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTcc < 2:3934778/150‑1 (MQ=255) ggCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCca < 1:966238/150‑1 (MQ=255) ggCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCca > 2:1817157/1‑150 (MQ=255) aTTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt < 1:1929082/150‑1 (MQ=255) aTTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 1:1385312/1‑150 (MQ=255) aTTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACAt > 2:3438709/1‑150 (MQ=255) tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGt > 1:2116031/1‑150 (MQ=255) tGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGt > 1:2063409/1‑150 (MQ=255) gTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTa < 1:4173228/150‑1 (MQ=255) tCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAg < 2:1779590/150‑1 (MQ=255) cTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGc > 2:1561062/1‑150 (MQ=255) cTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGc > 2:4933322/1‑150 (MQ=255) tacatacaTTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCa > 1:2199608/1‑150 (MQ=255) acatacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCaa < 1:1463798/150‑1 (MQ=255) catacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAt < 1:4576972/150‑1 (MQ=255) tacatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAAttt > 1:2516074/1‑150 (MQ=255) acatTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTg < 2:1066715/150‑1 (MQ=255) atTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGcc > 1:3998426/1‑150 (MQ=255) atTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGcc > 1:1102354/1‑150 (MQ=255) ttGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTGTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGcgt > 2:163317/1‑148 (MQ=255) cACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAg < 2:2734434/150‑1 (MQ=255) cACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATATGCCCGCTTGGCATAGCAg > 1:5216536/1‑150 (MQ=255) ttATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCa < 1:393400/150‑1 (MQ=255) tATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAAGTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAt < 1:1440636/150‑1 (MQ=255) atcatcAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtt > 1:3538721/1‑150 (MQ=255) atcatcAGTGAGAGAACAGAGACTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCAGCTTGGCATAGCAGGCAtt < 2:671306/150‑1 (MQ=255) catcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt > 2:5044871/1‑150 (MQ=255) catcaGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCAtttt < 2:4080190/150‑1 (MQ=255) caGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTc > 2:3845658/1‑150 (MQ=255) aGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTcc > 1:263077/1‑150 (MQ=255) aGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTcc > 1:3215403/1‑150 (MQ=255) cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtttt > 1:723727/1‑150 (MQ=255) cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtttt < 1:2968715/150‑1 (MQ=255) cAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACtttt < 1:286233/150‑1 (MQ=255) aaTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATg < 1:1566617/150‑1 (MQ=255) aTAGTTCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATAATCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGa > 2:3259259/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAc < 1:1241828/150‑1 (MQ=255) ttCAGTGAGTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTAc < 2:946104/150‑1 (MQ=255) tCAGTTATTTGAATAATTAAACTGATTAAATGAAGGTGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATAGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACt < 1:677788/150‑1 (MQ=255) tCAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACt < 1:3297684/150‑1 (MQ=255) cAGTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTg > 2:4830968/1‑150 (MQ=255) gTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGACGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAt < 2:330150/150‑1 (MQ=255) gTGATTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGAt < 1:5140632/150‑1 (MQ=255) aTTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGa > 2:5160805/1‑150 (MQ=255) aTTTGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGa < 2:537685/150‑1 (MQ=255) tGAATAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATaa < 2:304271/150‑1 (MQ=255) | TGCCTGCGGCGGGTGTTCTGGTCAGTAGTAGATGTTTAAGGCGTGGCAGAGACATTTCATCCTTACTCTACGGCATTGTTCTACATACATTGGTTGTGGTACTCACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTGATTAAATGAAGGGGTATAATAAATGATAATACTCTGGCTTTATCGTTAATTACTTAATTCCACATGTAAGCAATTTGCCCGCTTGGCATAGCAGGCATTTTTTCCAGGTACTTTTGAATGAGTACTGATGGATAA > CP009273/2778673‑2778966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |