| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 238,303 | A→T | 26.7% | V496V (GTT→GTA) | fadE ← | acyl coenzyme A dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 238,303 | 0 | A | T | 26.7% | 498.8 / 209.5 | 290 | V496V (GTT→GTA) | fadE | acyl coenzyme A dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (127/85); new base T (45/33); total (172/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.88e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
ACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCGCCAGGAAGTTGCTTTGCCCGAGCATAATGCCTTTACCGCCGGTAATATCCATCGCATCAATAATCGACTGCTGCCCGCGGTGGGTACAGTGATACTTAACGATAGCCGACA > CP009273/238154‑238451 | gACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACgg > 1:3742949/1‑150 (MQ=255) gACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACgg < 1:1962949/150‑1 (MQ=255) tgATATGTATGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTTACGTCATTGTTCTTCGCCGCATCCATCTCTACCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCATGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGa > 2:3050509/2‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |