| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 634,078 | T→A | intergenic (‑49/‑323) | dsbG ← / → ahpC | thiol:disulfide interchange protein, periplasmic/alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 634,078 | 0 | T | A | 99.6% | 889.0 / NA | 266 | intergenic (‑49/‑323) | dsbG/ahpC | thiol:disulfide interchange protein, periplasmic/alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base A (150/115); total (150/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TGTAATGCCCTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCTATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTCAGATTACAC > CP009273/633931‑634224 | aaTGCCCTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCAc > 1:3161814/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTg > 2:1105940/1‑150 (MQ=255) gCCCTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGt < 2:2116707/150‑1 (MQ=255) cccTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTc > 1:2880263/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCa < 2:1279655/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCAt < 1:2958639/150‑1 (MQ=255) tGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTATTTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATa < 2:1616347/150‑1 (MQ=255) gTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAg < 2:3212540/150‑1 (MQ=255) tttttCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAgg < 1:261041/150‑1 (MQ=255) tttttCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAgg < 1:697480/150‑1 (MQ=255) tttCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTa < 1:588276/150‑1 (MQ=255) tttCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTa < 2:1861098/150‑1 (MQ=255) tCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCt < 1:2553395/150‑1 (MQ=255) tCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCt < 2:464006/150‑1 (MQ=255) tttACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGAt < 2:3504319/150‑1 (MQ=255) ttACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATc < 1:1105940/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGt < 1:3711969/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGt > 2:1882742/1‑150 (MQ=255) tGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGt > 1:1371406/1‑150 (MQ=255) tGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGt > 1:1025713/1‑150 (MQ=255) tGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCAGAGGTAAGAGCTTAGATCAGGt > 2:2698145/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTg > 1:445524/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTg < 2:2348291/150‑1 (MQ=255) ggAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTg > 1:2350978/1‑150 (MQ=255) aGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGAt < 1:2642513/150‑1 (MQ=255) aGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGAt > 2:2730633/1‑150 (MQ=255) gCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGAtt < 1:956632/150‑1 (MQ=255) gCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGAtt < 2:606255/150‑1 (MQ=255) aGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGc > 1:2262400/1‑150 (MQ=255) ggAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGcc > 1:1168410/1‑150 (MQ=255) aaGTTACTCTGAGAAGGCGATTGCAGGAAGTAGAGCCAGTAAAATTATATTTTTTAATATTAATTTGTACTTTTCATTCAGTGTTAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCTGGTGATTGCCCt < 1:3260839/150‑1 (MQ=255) aGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCtt > 1:1590698/1‑150 (MQ=255) aGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCtt < 1:192428/150‑1 (MQ=255) ttaatctGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTg < 1:2218003/146‑1 (MQ=255) ttCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTg < 2:1753801/150‑1 (MQ=255) tCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGt < 1:3351065/150‑1 (MQ=255) tctGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTa < 1:1756125/150‑1 (MQ=255) ctGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTAt > 2:2770552/1‑150 (MQ=255) gCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGa < 1:2516607/150‑1 (MQ=255) cGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAg < 2:1382946/150‑1 (MQ=255) gAAGGCGATTGGAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAgg > 2:1303514/1‑150 (MQ=255) aGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGgt < 1:1339932/150‑1 (MQ=255) ggCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGgtg > 2:2452719/1‑150 (MQ=255) cGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGtgtt < 2:2663643/150‑1 (MQ=255) cGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGtgtt > 2:3691453/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGtgttgt > 1:2310662/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGtgttgt > 2:2584061/1‑150 (MQ=255) aaGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATg > 2:1092448/1‑150 (MQ=255) aaGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATg > 2:1160940/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTc < 1:1950370/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTc < 1:3117674/150‑1 (MQ=255) agagCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCgt > 1:1051678/1‑150 (MQ=255) gagCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCgtt > 2:740378/1‑150 (MQ=255) gagCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCgtt > 2:148959/1‑150 (MQ=255) agCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCgttg < 1:3355397/150‑1 (MQ=255) agCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCgttg > 1:2976098/1‑150 (MQ=255) ccAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCgttgtt < 1:1882742/150‑1 (MQ=255) aGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGc > 2:242229/1‑150 (MQ=255) gTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCa > 2:2062852/1‑150 (MQ=255) aaaaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCAtt > 1:915232/1‑150 (MQ=255) aaaaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCAtt < 1:3727035/150‑1 (MQ=255) aaaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCAttt > 2:3146534/1‑150 (MQ=255) aaaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCAttt > 2:1246870/1‑150 (MQ=255) aaaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCAttt > 1:3602087/1‑150 (MQ=255) aaaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCAttt < 2:702008/150‑1 (MQ=255) aaGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTg > 2:3388885/1‑150 (MQ=255) tCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAgg > 1:2750020/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAggg < 1:2071064/150‑1 (MQ=255) tttttAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCa > 2:450817/1‑150 (MQ=255) tttttAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCa > 2:616634/1‑150 (MQ=255) ttAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAaca < 1:2896738/150‑1 (MQ=255) ttAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAaca < 1:513429/150‑1 (MQ=255) ttAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAaca > 2:3598327/1‑150 (MQ=255) tAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAacac < 2:2880263/150‑1 (MQ=255) aCATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCt > 2:1691922/1‑150 (MQ=255) cATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTc > 2:1048469/1‑150 (MQ=255) ttAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATAGCACTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCAAGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCACCACCTCAg > 1:179944/1‑150 (MQ=255) aTTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGGTTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCt > 2:726936/1‑150 (MQ=255) aTTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCt < 1:2025333/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCt < 1:367801/150‑1 (MQ=255) tttGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTg > 2:3298112/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTgca < 1:3382583/150‑1 (MQ=255) tCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTgcagg > 1:2698900/1‑150 (MQ=255) ttCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCaggcaggc > 1:3078836/1‑150 (MQ=255) gtcagtGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTg > 2:1527258/1‑150 (MQ=255) tcagtGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGa > 2:3373494/1‑150 (MQ=255) agtGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAg > 2:1025871/1‑150 (MQ=255) gtGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGa > 2:2860097/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAg > 2:787337/1‑150 (MQ=255) tCGAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAgg > 1:1065895/1‑150 (MQ=255) gAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGt > 1:3523052/1‑150 (MQ=255) gAGTAAAAGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGt > 1:2393197/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGtt > 2:2482126/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGtt > 1:389197/1‑150 (MQ=255) aaaGGCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTc < 2:391861/150‑1 (MQ=255) ggCATAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCACAGGGTAGTTCAGa < 2:540220/150‑1 (MQ=255) aTAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGTAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTCAGATTa > 2:3008679/1‑150 (MQ=255) tAACCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTCAGATTac < 1:2424157/150‑1 (MQ=255) aCCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTCAGATTacac < 2:2884943/150‑1 (MQ=255) aCCAATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTCAGATTacac > 2:2022917/1‑150 (MQ=255) | TGTAATGCCCTGTTTTTCAATCGCTTTTACTGGAGCAGGAAGTTCCTCTGCGAAGGCGATTGCAGGAAGCAGAGCCAGTAAAAGTATCTTTTTTAACATTAATTTGTCCTTTTCAGTCAGTGCAAAAGTCGAGTAAAAGGCATAACCTATCACTGTCATAGGTAAGAGCTTAGATCAGGTGATTGCCCTTTGTTTATGAGGGTGTTGTAATCCATGTCGTTGTTGCATTTGTAAGGGCAACACCTCAGCCTGCAGGCAGGCACTGAAGATACCAAAGGGTAGTTCAGATTACAC > CP009273/633931‑634224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |