| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP009273 | 1,604,988 | G→A | intergenic (‑51/+176) | uxaB ← / ← yneF | altronate oxidoreductase, NAD‑dependent/putative membrane‑bound diguanylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,604,988 | 0 | G | A | 99.4% | 563.0 / NA | 177 | intergenic (‑51/+176) | uxaB/yneF | altronate oxidoreductase, NAD‑dependent/putative membrane‑bound diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (78/98); minor base C (1/0); total (79/98) | |||||||||||
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Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AGTCAACAAAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAGGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGC > CP009273/1604841‑1605134 | aGTCAACAAAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGt > 1:656651/1‑150 (MQ=255) caacaaAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAg > 1:3649853/1‑150 (MQ=255) acaaAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATCCGTTCTGGATACTGTGCACCGGGACAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACACGTTAGCa > 2:1509112/1‑150 (MQ=255) 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tACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGAt > 2:1048891/1‑150 (MQ=255) aCAACCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATc > 2:1968160/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCAt > 2:2873874/1‑150 (MQ=255) tGTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAg > 2:1037023/1‑150 (MQ=255) gTTTGAATTGGTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGt > 1:1208254/1‑150 (MQ=255) 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gTACGACAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAacac > 1:1546923/1‑150 (MQ=255) aCAAGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGc > 2:2413244/1‑150 (MQ=255) | AGTCAACAAAGGCGCGCAGGAAGTTACCTTCACCAAACTGAATGATACGTTCTGGATACTGTGCACCGGGAAAATCGCGACGATTTAGTGTTTTCACAATGGGTTCCCTTCTGATTAGTCATACAACCTGTTTGAATTGGTACGACAGGTTAGCAAACTTTAATACGCCGAACCCCTGTTTTGATCAACTCCTGATGATTAATGAGCAGTTTTATGAGAAAAGTGTGGCGCGGATCATGGTTTAATCGAGGAAAAACGCCTTTTCCTGGATCATAAAGTGGTAGAACACATTGC > CP009273/1604841‑1605134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |